AFF2 - Википедия - AFF2

AFF2
Идентификаторы
ПсевдонимыAFF2, FMR2, FMR2P, FRAXE, MRX2, OX19, AF4 / FMR2 член семейства 2
Внешние идентификаторыOMIM: 300806 ГомолоГен: 136314 Генные карты: AFF2
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение AFF2
Геномное расположение AFF2
ГруппаXq28Начинать148,500,617 бп[1]
Конец149,000,663 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE AFF2 210957 s в формате fs.png

PBB GE AFF2 216364 s в формате fs.png

PBB GE AFF2 206105 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr X: 148,5 - 149 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

AF4 / FMR2 член семьи 2 это белок что у людей кодируется AFF2 ген.[3] Мутации в AFF2 причастны к случаям рак молочной железы.[4]

Экспансия CCG-повторов в этом гене связана с Х-связанная умственная отсталость и, в частности, синдром, известный как Хрупкая умственная отсталость XE (ФРАКС). FRAXE - одна из наиболее распространенных форм несиндромальной Х-связанной умственной отсталости. После этого состояния этот ген также известен как FMR2 (ломкая умственная отсталость 2).[5]

Геномика

Этот ген расположен на длинном плече хромосомы X (Xq27.3-Xq28). Он имеет 22 экзона размером не менее 500 т.п.н. Возможен альтернативный сплайсинг с участием экзонов 2, 3, 5, 7 и 21. Нормальный кодируемый белок - 1311 кодоны в длину. Он выражается в виде транскрипции 8,7 килобаз в плацента и взрослый мозг.

Нормальная 5'-нетранслируемая область имеет 10-35 повторов CCG, а чаще 15-20. Патогенные расширения обычно имеют более 200 повторов и метилированы.

Этот ген принадлежит к семейству генов AFF, которое в настоящее время состоит из четырех членов: AFF1 / AF4, AFF2 / FMR2, AFF3 / LAF4 и AFF4 / AF5q31.[6] Все белки AFF локализованы в ядре и играют роль активаторов транскрипции с положительным действием на удлинение РНК. AFF2 / FMR2, AFF3 / LAF4 и AFF4 / AF5q31 локализуются в ядерных спеклах (субядерные структуры, которые считаются сайтами хранения / модификации факторов сплайсинга пре-мРНК) и способны связывать РНК с высокой очевидной аффинностью к структуре G-квадруплекса. Они, по-видимому, модулируют альтернативный сплайсинг посредством взаимодействия со структурой, образующей G-quadruplex РНК.

Сообщалось, что другие члены этого семейства образуют гены слияния в результате транслокаций хромосом и участвуют в патогенезе миелоидных / лимфоидных или смешанных линий. лейкемия.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155966 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Энтрез Ген: AFF2 AF4 / FMR2 семейство, член 2».
  4. ^ Сеть Атласа генома рака (октябрь 2012 г.). «Комплексные молекулярные портреты опухолей груди человека». Природа. 490 (7418): 61–70. Bibcode:2012 Натур.490 ... 61 т. Дои:10.1038 / природа11412. ЧВК  3465532. PMID  23000897.
  5. ^ Стеттнер Г.М., Шукьер М., Хёгер С., Брокманн К., Обер Б. (август 2011 г.). «Семейная умственная отсталость и аутичное поведение, вызванные небольшой делецией гена FMR2». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 155A (8): 2003–7. Дои:10.1002 / ajmg.a.34122. PMID  21739600.
  6. ^ Мелко М., Дуге Д., Бенсаид М., Зонгаро С., Верхегген С., Гец Дж., Бардони Б. (май 2011 г.). «Функциональная характеристика семейства РНК-связывающих белков AFF (AF4 / FMR2): понимание молекулярной патологии умственной отсталости FRAXE». Молекулярная генетика человека. 20 (10): 1873–85. Дои:10.1093 / hmg / ddr069. PMID  21330300.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка