ANKRD26 - ANKRD26

ANKRD26
Идентификаторы
ПсевдонимыANKRD26, THC2, bA145E8.1, домен анкиринового повтора 26
Внешние идентификаторыOMIM: 610855 MGI: 1917887 ГомолоГен: 45968 Генные карты: ANKRD26
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение ANKRD26
Геномное расположение ANKRD26
Группа10п12.1Начинать26,991,914 бп[1]
Конец27,100,498 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ANKRD26 205705 в формате fs.png

PBB GE ANKRD26 205706 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001256053
NM_014915

NM_001081112

RefSeq (белок)

NP_001242982
NP_055730

NP_001074581

Расположение (UCSC)Chr 10: 26,99 - 27,1 МбChr 6: 118,5 - 118,56 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий анкириновый повторяющийся домен 26 это белок что у людей кодируется ANKRD26 ген.[5][6] Этот белок имеет функцию, которая в настоящее время не изучена.

Белок 26, содержащий домен анкиринового повтора, является белком, который у человека кодируется ANKRD26. ген.[7]

Ген

ANKRD26 находится на 10-й хромосоме, в 10q21. Он имеет 6816 пар оснований в транскрипте мРНК контрольной последовательности.[8]

Район

LOC100289548 (ПУТАЕТИВНЫЙ НЕХАРАКТЕРИЗОВАННЫЙ БЕЛК C10ORF52-LIKE) расположен непосредственно слева (3 ') от ANKRD26 и представляет собой ген, кодирующий белок, расположенный в 10p12.1.[9] У него неизвестная функция. На другой стороне LOC100289548 находится NCRNA00202 небелковая кодирующая РНК 202.[10] На 5'-конце ANKRD26 YME1L1 находится в 10q14.1. Белок, кодируемый YME1-подобным 1, является ортологом дрожжевой митохондриальной AAA-металлопротеиназы.[11] Считается, что этот ген играет роль в метаболизме митохондриального белка.[11] На положительной цепи десятой хромосомы человека, расположенной рядом с 5'-концом ANKRD26, находится MASTL, связанная с микротрубочками серин / треонинкиназа. Этот конкретный ген кодирует серин / треонинкиназу, связанную с микротрубочками. Ожидается, что мутации в этом гене связаны с тромбоцитопенией-2.[12]

Протеин

[13]Белок 26, содержащий домен анкиринового повтора, имеет три консервативных домена: ANK, SbcC и DUF3496. Консервативный домен ANK расположен от аминокислоты 74-199. Обнаружено, что повторы анкирина опосредуют белок-белковые взаимодействия, а также содержат две антипараллельные спирали, а также бета-шпильку. Консервативный домен SbcC можно найти из аминокислоты 743-1333, и он является доменом, связанным с АТФазой, участвующей в репарации ДНК. Также существует домен с неизвестной функцией из аминокислоты 1538-1649.

Выражение

Было замечено, что у людей ANKRD26 наиболее сильно экспрессируется в ухе, лимфе, пищеводе, паращитовидных железах и плаценте, а также чаще всего наблюдается при опухолях пищевода и лимфоме, а также в бластоцистах, плодах, подростках и взрослых. стадии развития. У людей это связано на всех этапах жизни с раком лимфомы, а также с опухолями пищевода. Связь с экспрессией в тканях и болезненными состояниями не показывает достаточной разницы, чтобы связать друг друга.[14]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107890 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000007827 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID  10470851.
  6. ^ «Ген Entrez: домен 26 анкиринового повтора ANKRD26».
  7. ^ Ген Entrez: домен 26 анкиринового повтора ANKRD26
  8. ^ «Домен 26 анкиринового повтора (ANKRD26) человека (Homo sapiens), мРНК». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.
  9. ^ "Ген". Национальный центр биотехнологической информации.
  10. ^ «NCRNA00202 небелковая кодирующая РНК 202 [Homo sapiens]». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.
  11. ^ а б "YME1L1 YME1-подобный 1 (S. cerevisiae) [Homo sapiens". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.
  12. ^ «MASTL, связанная с микротрубочками, подобная серин / треонинкиназе [Homo sapien». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.
  13. ^ «Сохраненные домены». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.
  14. ^ «Профиль EST». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 мая 2011.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение