ASF1A - ASF1A

ASF1A
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1ТЕЙ, 2I32, 2IIJ, 2IO5, 3AAD, 5C3I
Идентификаторы
Псевдонимы	ASF1A, CGI-98, CIA, HSPC146, функция анти-сайленсинга гистоновый шаперон 1A
Внешние идентификаторы	OMIM: 609189 MGI: 1913653 ГомолоГен: 8528 Генные карты: ASF1A
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	118,909,171 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	53,609,225 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание гистонов; • связывание хроматина; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• ядерный хроматин; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • макромолекулярный комплекс;
Биологический процесс	• Сборка нуклеосом, зависимая от репликации ДНК; • дифференциация мышечных клеток; • сборка нуклеосом; • Независимая от репликации ДНК сборка нуклеосом; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • сборка или разборка хроматина; • Ремонт ДНК; • дифференцировка остеобластов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция молчания хроматина; • организация хроматина;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	25842
	66403
	ENSG00000111875
	ENSMUSG00000019857
	Q9Y294
	Q9CQE6
	NM_014034
	NM_025541
	NP_054753
	NP_079817
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гистоновый шаперон ASF1A это белок что у людей кодируется ASF1A ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства H3 / H4 белков-шаперонов гистонов и подобен гену анти-сайленсирующей функции-1 у дрожжей. Белок является ключевым компонентом донорного комплекса гистонов, который участвует в сборке нуклеосом. Он взаимодействует с гистонами H3 и H4 и функционирует вместе с фактором сборки хроматина во время репликации и репарации ДНК.^[7]

Взаимодействия

ASF1A было показано взаимодействовать с участием TLK1,^[8]^[9] TLK2,^[8] CHAF1B^[10] и CHAF1A.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111875 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019857 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (май 2000 г.) «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Геномные исследования. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК 310876. PMID 10810093.
^ Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
^ ^а ^б "Ген Entrez: ASF1A ASF1 функция анти-сайленсинга, гомолог A 1 (S. cerevisiae)".
^ ^а ^б Силлже Х. Х., Нигг Э. А. (июль 2001 г.). «Идентификация факторов сборки хроматина человека Asf1 в качестве субстратов Tousled-подобных киназ». Текущая биология. 11 (13): 1068–73. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00298-6. PMID 11470414. S2CID 8866062.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ ^а ^б Мелло Дж. А., Силлже Х. Х., Рош Д. М., Киршнер Д. Б., Нигг Е. А., Альмоузни Дж. (Апрель 2002 г.). «Человеческий Asf1 и CAF-1 взаимодействуют и синергируют в связанном с репарацией пути сборки нуклеосом». EMBO отчеты. 3 (4): 329–34. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf068. ЧВК 1084056. PMID 11897662.

дальнейшее чтение

Мунаката Т., Адачи Н., Йокояма Н., Кузухара Т., Хорикоши М. (март 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора против сайленсинга обладает активностью шаперона гистонов». Гены в клетки. 5 (3): 221–33. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00319.x. PMID 10759893. S2CID 20198031.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Силлже Х. Х., Нигг Э. А. (июль 2001 г.). «Идентификация факторов сборки хроматина человека Asf1 в качестве субстратов Tousled-подобных киназ». Текущая биология. 11 (13): 1068–73. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00298-6. PMID 11470414. S2CID 8866062.
Мелло Дж. А., Силлже Х. Х., Рош Д. М., Киршнер Д. Б., Нигг Е. А., Альмоузни Дж. (Апрель 2002 г.). «Человеческий Asf1 и CAF-1 взаимодействуют и синергируют в связанном с репарацией пути сборки нуклеосом». EMBO отчеты. 3 (4): 329–34. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf068. ЧВК 1084056. PMID 11897662.
Чимура Т., Кузухара Т., Хорикоши М. (июль 2002 г.). «Идентификация и характеристика CIA / ASF1 как взаимодействия бромодоменов, связанных с TFIID». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (14): 9334–9. Bibcode:2002PNAS ... 99.9334C. Дои:10.1073 / pnas.142627899. ЧВК 123141. PMID 12093919.
Умехара Т., Хорикоши М. (сентябрь 2003 г.). «Фактор инициации транскрипции IID-интерактивный гистоновый шаперон CIA-II, участвующий в сперматогенезе млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (37): 35660–7. Дои:10.1074 / jbc.M303549200. PMID 12842904.
Tagami H, Ray-Gallet D, Almouzni G, Nakatani Y (январь 2004 г.). «Комплексы гистона H3.1 и H3.3 опосредуют пути сборки нуклеосом, зависимые или независимые от синтеза ДНК». Ячейка. 116 (1): 51–61. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 01064-X. PMID 14718166. S2CID 13262868.
Mousson F, Couprie J, Thuret JY, Neumann JM, Mann C, Ochsenbein F (июль 2004 г.). «Резонансные отнесения 1H, 13C и 15N консервативного ядра hAsf1 A». Журнал биомолекулярного ЯМР. 29 (3): 413–4. Дои:10.1023 / B: JNMR.0000032497.24661.44. PMID 15213445. S2CID 33782636.
Чжан Р., Пустовойтов М.В., Е X, Сантос Х.А., Чен В., Даганзо С.М., Эрцбергер Дж. П., Серебряский И.Г., Канутеску А.А., Данбрак Р.Л., Пехрсон Дж. Р., Бергер Дж. М., Кауфман П.Д., Адамс П.Д. (январь 2005 г.). «Формирование MacroH2A-содержащих очагов гетерохроматина, связанных со старением, и старение, вызванное ASF1a и HIRA». Клетка развития. 8 (1): 19–30. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.10.019. PMID 15621527.
Грот А., Рей-Галлет Д., Киви Дж. П., Лукас Дж., Бартек Дж., Альмоузни Дж. (Январь 2005 г.). «Человеческий Asf1 регулирует поток гистонов S фазы во время репликационного стресса». Молекулярная клетка. 17 (2): 301–11. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.12.018. PMID 15664198.
Mousson F, Lautrette A, Thuret JY, Agez M, Courbeyrette R, Amigues B, Becker E, Neumann JM, Guerois R, Mann C, Ochsenbein F (апрель 2005 г.). «Структурная основа взаимодействия Asf1 с гистоном H3 и его функциональные последствия». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (17): 5975–80. Bibcode:2005ПНАС..102.5975М. Дои:10.1073 / pnas.0500149102. ЧВК 1087920. PMID 15840725.
Тан Ю., Пустовойтов М.В., Чжао К., Гарфинкель М., Канутеску А., Данбрак Р., Адамс П.Д., Марморштейн Р. (октябрь 2006 г.). «Структура человеческого комплекса ASF1a-HIRA и понимание специфичности сборки гистонового шаперонного комплекса». Структурная и молекулярная биология природы. 13 (10): 921–9. Дои:10.1038 / nsmb1147. ЧВК 2933817. PMID 16980972.
Сен С.П., Де Бенедетти А (2006). «TLK1B способствует восстановлению поврежденной ультрафиолетом ДНК посредством ремоделирования хроматина с помощью Asf1». BMC Молекулярная биология. 7: 37. Дои:10.1186/1471-2199-7-37. ЧВК 1626478. PMID 17054786.
Agez M, Chen J, Guerois R, van Heijenoort C, Thuret JY, Mann C, Ochsenbein F (февраль 2007 г.). «Структура гистонового шаперона ASF1, связанного с С-концевой спиралью гистона H3, и функциональные сведения». Структура. 15 (2): 191–9. Дои:10.1016 / j.str.2007.01.002. PMID 17292837.
Нацумэ Р., Эйтоку М., Акаи Ю., Сано Н., Хорикоши М., Сенда Т. (март 2007 г.). «Структура и функция гистонового шаперона CIA / ASF1 в комплексе с гистонами H3 и H4». Природа. 446 (7133): 338–41. Bibcode:2007Натура.446..338Н. Дои:10.1038 / природа05613. PMID 17293877. S2CID 4410753.

внешние ссылки

Человек ASF1A расположение генома и ASF1A страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111875 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019857 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10810093-5] Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (май 2000 г.) «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Геномные исследования. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК 310876. PMID 10810093.

[pmid11042152-6] Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.

[entrez-7] а ^б "Ген Entrez: ASF1A ASF1 функция анти-сайленсинга, гомолог A 1 (S. cerevisiae)".

[pmid11470414-8] а ^б Силлже Х. Х., Нигг Э. А. (июль 2001 г.). «Идентификация факторов сборки хроматина человека Asf1 в качестве субстратов Tousled-подобных киназ». Текущая биология. 11 (13): 1068–73. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00298-6. PMID 11470414. S2CID 8866062.

[pmid16189514-9] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid11897662-10] а ^б Мелло Дж. А., Силлже Х. Х., Рош Д. М., Киршнер Д. Б., Нигг Е. А., Альмоузни Дж. (Апрель 2002 г.). «Человеческий Asf1 и CAF-1 взаимодействуют и синергируют в связанном с репарацией пути сборки нуклеосом». EMBO отчеты. 3 (4): 329–34. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf068. ЧВК 1084056. PMID 11897662.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]