Мотив РНК анти-hemB - Anti-hemB RNA motif
| анти-гемВ | |
|---|---|
 Консенсус вторичная структура и сохранение последовательности РНК Burkholderia 7 (анти-hemB) | |
| Идентификаторы | |
| Символ | анти-гемВ |
| Рфам | RF02837 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мРНК |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO:,Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000370 |
| PDB структуры | PDBe |
В мотив анти-hemB РНК это консервированный РНК структура, которая была обнаружена во всех известных бактерии в роду Burkholderia, и во множестве других бетапротеобактерии.[1] Мотив РНК анти-hemB состоит в основном из двух стебель-петли, а затем предсказанный rho-независимая терминация транскрипции стебель-петля. Поскольку анти-hemB РНК обычно не локализуются в 5 'UTR, предполагается, что РНК некодирующие РНК. Терминатор ствол-петля означает, что анти-hemB РНК транскрибируются как независимые молекулы.
Название «anti-hemB» предназначено для того, чтобы отличить мотив от его обратного комплемента, который был назван мотивом «hemB», мотив, который часто присутствует в очевидных 5'-UTR HemB гены. Было сочтено неоднозначным относительно того, какая из этих ориентаций является правильной, поскольку оба направления демонстрируют ковариацию (см. прогноз вторичной структуры ), и оба складываются в вероятные структуры РНК. Однако более вероятной ориентацией был признан анти-гемВ, поскольку в нем было меньше А-С. пар оснований, которые не способствуют стабильности РНК. В обратном дополнении пара A-C становится стабильной парой колебаний G-U.
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Баррик Дж. Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 кандидатных структурированных РНК в бактериях с использованием системы сравнительной геномики CMfinder». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (14): 4809–4819. Дои:10.1093 / нар / гкм487. ЧВК 1950547. PMID 17621584.
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |