C1D - C1D

C1D
Идентификаторы
ПсевдонимыC1D, LRP1, SUN-CoR, SUNCOR, hRrp47, корепрессор ядерного рецептора C1D
Внешние идентификаторыOMIM: 606997 MGI: 1927354 ГомолоГен: 4619 Генные карты: C1D
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение C1D
Геномное расположение C1D
Группа2п14Начинать68,041,130 бп[1]
Конец68,110,948 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_173177
NM_001190263
NM_001190265
NM_006333

NM_020558
NM_001330649

RefSeq (белок)

NP_001177192
NP_001177194
NP_006324
NP_775269

NP_001317578
NP_065583

Расположение (UCSC)Chr 2: 68.04 - 68.11 МбChr 11: 17.26 - 17.27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий нуклеиновую кислоту C1D это белок что у людей кодируется C1D ген.[5][6][7][8][9][10]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является ДНК-связывающим и индуцирующим апоптоз белком, локализованным в ядре. Это также белок, взаимодействующий с Rac3, который действует как корепрессор рецептора гормона щитовидной железы. Считается, что этот белок регулирует образование комплекса TRAX / Translin. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не была определена.[10]

Взаимодействия

C1D был показан взаимодействовать с TSNAX[8] и ДНК-PKcs.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197223 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000581 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нелс П., Кек Т., Греферат Р., Шписс Е., Глейзер Т., Ротбарт К., Штаммер Х., Вернер Д. (апрель 1998 г.). «клонирование кДНК, рекомбинантная экспрессия и характеристика полипептидов с исключительной аффинностью к ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (5): 1160–6. Дои:10.1093 / nar / 26.5.1160. ЧВК  147382. PMID  9469821.
  6. ^ Шильдерс Г., Эгбертс В.В., Райджмейкерс Р., Пруейн Г.Дж. (июль 2007 г.). «C1D является основной мишенью для аутоантител у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита и склеродермии». Ревматоидный артрит. 56 (7): 2449–54. Дои:10.1002 / арт.22710. PMID  17599775.
  7. ^ Шильдерс Г., ван Дейк Э., Пруейн Г.Дж. (май 2007 г.). «C1D и hMtr4p связываются с субъединицей экзосомы человека PM / Scl-100 и участвуют в процессинге пре-рРНК». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (8): 2564–72. Дои:10.1093 / нар / гкм082. ЧВК  1885644. PMID  17412707.
  8. ^ а б Erdemir T, Bilican B, Oncel D, Goding CR, Yavuzer U (январь 2002 г.). «Зависимое от повреждений ДНК взаимодействие белка ядерного матрикса C1D с транслин-ассоциированным фактором X (TRAX)». J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 207–16. PMID  11801738.
  9. ^ Замир И., Доусон Дж., Лавинский Р.М., Гласс С.К., Розенфельд М.Г., Лазар М.А. (декабрь 1997 г.). «Клонирование и характеристика корепрессора и потенциального компонента репрессивного комплекса ядерных гормонов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (26): 14400–5. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14400. ЧВК  24996. PMID  9405624.
  10. ^ а б «Ген Entrez: ядерный ДНК-связывающий белок C1D».
  11. ^ Явузер У., Смит Г.К., Блисс Т., Вернер Д., Джексон С.П. (июль 1998 г.). «Независимая от конца ДНК активация ДНК-ПК, опосредованная посредством ассоциации с ДНК-связывающим белком C1D». Genes Dev. 12 (14): 2188–99. Дои:10.1101 / gad.12.14.2188. ЧВК  317006. PMID  9679063.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Ротбарт К., Стэммер Х, Вернер Д. (2002). «Опосредованная протеасомами деградация препятствует критическим уровням индуцирующего апоптоз белка C1D». Cancer Cell Int. 2 (1): 12. Дои:10.1186/1475-2867-2-12. ЧВК  140130. PMID  12379155.
  • Ротбарт К., Хунцикер А., Стэммер Х, Вернер Д. (2001). «Промотор гена, кодирующего ДНК-связывающий и индуцирующий апоптоз белок C1D размером 16 кДа». Биохим. Биофиз. Acta. 1518 (3): 271–5. Дои:10.1016 / S0167-4781 (01) 00198-1. PMID  11311939.
  • Ротбарт К., Списс Э., Юодка Б., Явузер Ю., Нелс П., Штаммер Х., Вернер Д. (1999). «Индукция апоптоза сверхэкспрессией ДНК-связывающего и ДНК-PK-активирующего белка C1D». J. Cell Sci. 112 (13): 2223–32. PMID  10362552.
  • Хаатая Л., Гроффен Дж., Хейстеркамп Н. (1998). «Идентификация нового белка C1D, взаимодействующего с Rac3». Int. J. Mol. Med. 1 (4): 665–70. Дои:10.3892 / ijmm.1.4.665. PMID  9852280.