CASC3 - CASC3
Белок CASC3 это белок что у людей кодируется CASC3 ген.[5][6][7]
Функция
Продукт этого гена является основным компонентом комплекс экзонов (EJC), белковый комплекс, который откладывается на сплайсированных мРНК на переходах экзон-экзон и функции в нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD). Кодируемый белок связывает РНК и взаимодействует с двумя другими основными компонентами EJC. Он преимущественно расположен в цитоплазма, но челноки в ядро где он находится ядерные спеклы.[7]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108349 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078676 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Tomasetto C, Regnier C, Moog-Lutz C, Mattei MG, Chenard MP, Lidereau R, Basset P, Rio MC (январь 1996 г.). «Идентификация четырех новых человеческих генов, амплифицированных и сверхэкспрессированных в карциноме груди и локализованных в области q11-q21.3 хромосомы 17». Геномика. 28 (3): 367–76. Дои:10.1006 / geno.1995.1163. PMID 7490069.
- ^ Арриола Е., Маркио С., Тан Д.С., Друри С.К., Ламброс М.Б., Натраджан Р., Родригес-Пинилья С.М., Маккей А., Тамбер Н., Фенвик К., Джонс С., Доусетт М., Эшворт А., Рейс-Филхо Дж.С. (апрель 2008 г.). «Геномный анализ ампликона HER2 / TOP2A в клеточных линиях рака груди и рака груди». Lab Invest. 88 (5): 491–503. Дои:10.1038 / labinvest.2008.19. PMID 18332872.
- ^ а б «Ген Entrez: кандидат 3 предрасположенности к раку по CASC3».
внешняя ссылка
- Человек CASC3 расположение генома и CASC3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Варис А., Вольф М., Монни О. и др. (2002). «Мишени амплификации и сверхэкспрессии гена 17q при раке желудка». Рак Res. 62 (9): 2625–9. PMID 11980659.
- Дегот С., Ренье С.Х., Вендлинг С. и др. (2002). «Метастатический лимфатический узел 51, новый нуклео-цитоплазматический белок, сверхэкспрессируемый при раке груди». Онкоген. 21 (28): 4422–34. Дои:10.1038 / sj.onc.1205611. PMID 12080473.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Макки П., Кроенинг С., Паласиос И.М. и др. (2003). «Barentsz, новый компонент частиц рибонуклеопротеина, содержащих Штауфен, в клетках млекопитающих, взаимодействует со Штауфеном РНК-зависимым образом». J. Neurosci. 23 (13): 5778–88. Дои:10.1523 / jneurosci.23-13-05778.2003. ЧВК 6741274. PMID 12843282.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Паласиос И.М., Гатфилд Д., Сент-Джонстон Д., Изаурральде Э (2004). «Комплекс, содержащий eIF4AIII, необходимый для локализации мРНК и нонсенс-опосредованного распада мРНК». Природа. 427 (6976): 753–7. Дои:10.1038 / природа02351. PMID 14973490. S2CID 4400243.
- Degot S, Le Hir H, Alpy F и др. (2004). «Ассоциация белка рака молочной железы MLN51 с комплексом соединения экзонов через его спекл-локализатор и модуль связывания РНК». J. Biol. Chem. 279 (32): 33702–15. Дои:10.1074 / jbc.M402754200. PMID 15166247.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Ким Ю.К., Фурик Л., Desgroseillers L, Maquat LE (2005). «Staufen1 млекопитающих рекрутирует Upf1 на специфические 3'UTR мРНК, чтобы вызвать распад мРНК». Ячейка. 120 (2): 195–208. Дои:10.1016 / j.cell.2004.11.050. PMID 15680326. S2CID 16786108.
- Баллют Л., Маршадье Б., Баге А. и др. (2005). «Основной комплекс соединения экзонов блокируется на РНК за счет ингибирования активности АТФазы eIF4AIII». Nat. Struct. Мол. Биол. 12 (10): 861–9. Дои:10.1038 / nsmb990. PMID 16170325. S2CID 1359792.
- Танге То, Сибуя Т., Юрика М.С., Мур М.Дж. (2006). «Биохимический анализ EJC выявляет два новых фактора и стабильное тетрамерное белковое ядро». РНК. 11 (12): 1869–83. Дои:10.1261 / rna.2155905. ЧВК 1370875. PMID 16314458.
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Сибуя Т., Танге То, Строуп М.Э., Мур М.Дж. (2006). «Мутационный анализ человеческого eIF4AIII определяет области, необходимые для образования комплекса соединения экзона и нонсенс-опосредованного распада мРНК». РНК. 12 (3): 360–74. Дои:10.1261 / rna.2190706. ЧВК 1383576. PMID 16495234.
- Андерсен CB, Ballut L, Johansen JS и др. (2006). «Структура комплекса ядра соединения экзона с захваченной DEAD-бокс-АТФазой, связанной с РНК». Наука. 313 (5795): 1968–72. Дои:10.1126 / science.1131981. PMID 16931718. S2CID 26409491.
- Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Багет А., Дегот С., Кугот Н. и др. (2007). «Метастатический лимфатический узел 51 с соединением экзонов и комплексным компонентом функционирует в сборке стресс-гранул». J. Cell Sci. 120 (Pt 16): 2774–84. Дои:10.1242 / jcs.009225. PMID 17652158.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |