CYTH1 - CYTH1

CYTH1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1BC9, 4A4P
Идентификаторы
Псевдонимы	CYTH1, B2-1, ЦИТОГЕЗИН-1, D17S811E, PSCD1, SEC7, цитогезин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 182115 MGI: 1334257 ГомолоГен: 31262 Генные карты: CYTH1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	78,782,297 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	118,248,592 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов; • липидное связывание; • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны; • клеточная мембрана; • мембрана; • цитозоль; • Мембрана Гольджи; • стык; • двухклеточное плотное соединение; • соединение клеток;
Биологический процесс	• регуляция передачи сигнала белка ARF; • регуляция клеточной адгезии; • везикулярный транспорт; • установление полярности эпителиальных клеток;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9267
	19157
	ENSG00000108669
	ENSMUSG00000017132
	Q15438
	Q9QX11
NM_001292018; NM_001292019; NM_004762; NM_017456; NM_001365037;
	NM_001365038; NM_001365039; NM_001365040; NM_001365041
NM_001112699; NM_001112700; NM_011180; NM_001378885; NM_001378886;
	NM_001378887; NM_001378888
NP_001278947; NP_001278948; NP_004753; NP_059430; NP_001351966;
	NP_001351967; NP_001351968; NP_001351969; NP_001351970
NP_001106169; NP_001106170; NP_035310; NP_001365814; NP_001365815;
	NP_001365816; NP_001365817
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Цитогезин-1 ранее известный как гомология плэкстрина, Sec7 и coiled / coil домены 1 (PSCD1) являются белок что у людей кодируется CYTH1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Цитогезин-1 (CYTH1) является членом семейства цитогезинов. Члены этого семейства имеют идентичную структурную организацию, состоящую из N-концевой спиральная катушка мотив, центральный домен Sec7 и C-терминал гомология плекстрина (PH) домен. Мотив coiled-coil участвует в гомодимеризация, домен Sec7 содержит гуанин-нуклеотидный обмен белка (GEP), а домен PH взаимодействует с фосфолипиды и отвечает за ассоциацию CYTHs с мембранами. Представляется, что члены этой семьи опосредуют регулирование сортировка белков и мембранный трафик. CYTH1 высоко экспрессируется в естественный убийца и периферийные Т-клетки, и регулирует адгезию интегринов к плазматической мембране лимфоциты. Белок CYTH1 на 83% гомологичен CYTH2.^[7]

Взаимодействия

CYTH1 показал взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108669 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000017132 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Лю Л., Похайдак Б. (сентябрь 1992 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК человека из цитолитических NK / T-клеток, гомологичных дрожжевому SEC7». Биохим. Биофиз. Acta. 1132 (1): 75–8. Дои:10.1016/0167-4781(92)90055-5. PMID 1511013.
^ Диксон Б., Мансур М., Похайдак Б. (апрель 1993 г.). «Присвоение человеческого гена B2-1 (D17S811E) хромосоме 17qter с помощью ПЦР-анализа гибридов соматических клеток и флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 63 (1): 42–4. Дои:10.1159/000133498. PMID 8449036.
^ ^а ^б «Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD1, Sec7 и домены 1 спиральной спирали (цитохезин 1)».
^ Шюрманн А., Шмидт М., Асмус М., Байер С., Флигерт Ф., Колинг С., Массманн С., Шильф С., Субаусте М.С., Восс М., Якобс К. Х., Йост Х. Г. (апрель 1999 г.). «Связанный с АДФ-фактором рибозилирования (ARF) белок GTPase, связанный с ARF, связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитохезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D». J. Biol. Chem. 274 (14): 9744–51. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9744. PMID 10092663.
^ Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (октябрь 1998 г.). «Белок с повторами WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». J. Biol. Chem. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.
^ Гейгер С., Нагель В., Бем Т., ван Койк Ю., Фигдор К. Г., Креммер Е., Хогг Н., Цейтлманн Л., Диркс Н., Вебер К. С., Коланус В. (июнь 2000 г.). «Цитогезин-1 регулирует адгезию, опосредованную бета-2 интегрином, посредством функции ARF-GEF и взаимодействия с LFA-1». EMBO J. 19 (11): 2525–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2525. ЧВК 212768. PMID 10835351.
^ Vitale N, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Riemenschneider W, Moss J, Vaughan M (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID 10748148.

дальнейшее чтение

Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Коланус В., Нагель В., Шиллер Б., Цейтлманн Л., Годар С., Стокингер Н., Сид Б. (1996). «Связывание интегрина альфа L бета 2 / LFA-1 с ICAM-1, индуцированное цитохезином-1, цитоплазматической регуляторной молекулой». Ячейка. 86 (2): 233–42. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80095-1. PMID 8706128. S2CID 18390795.
Миччи Э., Цай С.К., Адамик Р., Мосс Дж., Воган М. (1997). «Цитогезин-1, цитозольный гуанин-нуклеотид-обменный белок для фактора ADP-рибозилирования». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (5): 1745–8. Дои:10.1073 / пнас.94.5.1745. ЧВК 19987. PMID 9050849.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Нагель В., Цайтльманн Л., Шилхер П., Гейгер С., Коланус Дж., Коланус В. (1998). «Фосфоинозитид 3-ОН киназа активирует путь адгезии интегрина бета 2 и индуцирует привлечение цитогезина-1 в мембрану». J. Biol. Chem. 273 (24): 14853–61. Дои:10.1074 / jbc.273.24.14853. PMID 9614087.
Бец С.Ф., Шнухель А., Ван Х., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Липски Б.П., Харрис Е.А., Стонтон Д.Е., Фесик С.В. (1998). «Структура раствора цитогезина-1 (B2-1) Sec7 домена и его взаимодействие с фактором рибозилирования 1 GTPase ADP». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (14): 7909–14. Дои:10.1073 / пнас.95.14.7909. ЧВК 20903. PMID 9653114.
Нагель В., Шилхер П., Цейтлманн Л., Коланус В. (1998). «PH-домен и многоосновный c-домен цитогезина-1 специфически взаимодействуют в ассоциации с плазматической мембраной и клеточной функции». Мол. Биол. Ячейка. 9 (8): 1981–94. Дои:10.1091 / mbc.9.8.1981. ЧВК 25450. PMID 9693361.
Пачеко-Родригес Г., Меаччи Е., Витале Н., Мосс Дж., Воан М. (1998). «Обмен гуаниновых нуклеотидов на факторах ADP-рибозилирования, катализируемый цитогезином-1 и его доменом Sec7». J. Biol. Chem. 273 (41): 26543–8. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26543. PMID 9756891.
Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (1998). «Белок с повторами WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». J. Biol. Chem. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.
Шюрманн А., Шмидт М., Асмус М., Байер С., Флигерт Ф., Колинг С., Массманн С., Шильф С., Субаусте М.С., Восс М., Якобс К. Х., Йост Х. Г. (1999). «Связанный с АДФ-фактором рибозилирования (ARF) белок GTPase, связанный с ARF, связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитохезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D». J. Biol. Chem. 274 (14): 9744–51. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9744. PMID 10092663.
Пачеко-Родригес Дж., Паттон В.А., Адамик Р., Ю Х.С., Ли Ф.Дж., Чжан Г.Ф., Мосс Дж., Воган М. (1999). «Структурные элементы фактора АДФ-рибозилирования 1, необходимые для функционального взаимодействия с цитогезином-1». J. Biol. Chem. 274 (18): 12438–44. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12438. PMID 10212218.
Венкатесварлу К., Ганн-Мур Ф., Таваре Дж. М., Каллен П. Дж. (1999). «Стимулированная EGF и NGF транслокация цитогезина-1 к плазматической мембране клеток PC12 требует активации PI 3-киназы и функционального PH домена цитогезина-1». J. Cell Sci. 112 (Pt 12) (12): 1957–65. PMID 10341214.
Огасавара М., Ким С.К., Адамик Р., Тогава А., Ферранс В.Дж., Такеда К., Кирби М., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Сходства в функции и структуре генов цитогезина-4 и цитогезина-1, белков обмена гуаниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования». J. Biol. Chem. 275 (5): 3221–30. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3221. PMID 10652308.
Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID 10748148.
Ли С.Ю., Мансур М., Похайдак Б. (2000). «B2-1, белок, содержащий домен гомологии Sec7 и плекстрина, локализуется в комплексе Гольджи». Exp. Cell Res. 256 (2): 515–21. Дои:10.1006 / excr.2000.4845. PMID 10772823.
Гейгер С., Нагель В., Бем Т., ван Койк Ю., Фигдор К. Г., Креммер Е., Хогг Н., Цайтлманн Л., Диркс Н., Вебер К. С., Коланус В. (2000). «Цитогезин-1 регулирует адгезию, опосредованную бета-2 интегрином, посредством функции ARF-GEF и взаимодействия с LFA-1». EMBO J. 19 (11): 2525–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2525. ЧВК 212768. PMID 10835351.
Диркс Х., Коланус Дж., Коланус В. (2001). «Актиновая ассоциация цитоскелета цитохезина-1 регулируется специфическим фосфорилированием его карбоксиконцевого многоосновного домена». J. Biol. Chem. 276 (40): 37472–81. Дои:10.1074 / jbc.M101502200. PMID 11438522.
Тан П, Ченг Т.П., Агнелло Д., Ву Си Ю., Хиссонг Б. Д., Уотфорд В. Т., Ан Х. Дж., Галон Дж., Мосс Дж., Воан М., О'Ши Дж. Дж., Гадина М. (2002). «Cybr, цитокин-индуцируемый белок, который связывает цитохезин-1 и регулирует его активность». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2625–9. Дои:10.1073 / pnas.052712999. ЧВК 122398. PMID 11867758.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108669 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000017132 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1511013-5] Лю Л., Похайдак Б. (сентябрь 1992 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК человека из цитолитических NK / T-клеток, гомологичных дрожжевому SEC7». Биохим. Биофиз. Acta. 1132 (1): 75–8. Дои:10.1016/0167-4781(92)90055-5. PMID 1511013.

[pmid8449036-6] Диксон Б., Мансур М., Похайдак Б. (апрель 1993 г.). «Присвоение человеческого гена B2-1 (D17S811E) хромосоме 17qter с помощью ПЦР-анализа гибридов соматических клеток и флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 63 (1): 42–4. Дои:10.1159/000133498. PMID 8449036.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD1, Sec7 и домены 1 спиральной спирали (цитохезин 1)».

[pmid10092663-8] Шюрманн А., Шмидт М., Асмус М., Байер С., Флигерт Ф., Колинг С., Массманн С., Шильф С., Субаусте М.С., Восс М., Якобс К. Х., Йост Х. Г. (апрель 1999 г.). «Связанный с АДФ-фактором рибозилирования (ARF) белок GTPase, связанный с ARF, связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитохезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D». J. Biol. Chem. 274 (14): 9744–51. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9744. PMID 10092663.

[pmid9765275-9] Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (октябрь 1998 г.). «Белок с повторами WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». J. Biol. Chem. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.

[pmid10835351-10] Гейгер С., Нагель В., Бем Т., ван Койк Ю., Фигдор К. Г., Креммер Е., Хогг Н., Цейтлманн Л., Диркс Н., Вебер К. С., Коланус В. (июнь 2000 г.). «Цитогезин-1 регулирует адгезию, опосредованную бета-2 интегрином, посредством функции ARF-GEF и взаимодействия с LFA-1». EMBO J. 19 (11): 2525–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2525. ЧВК 212768. PMID 10835351.

[pmid10748148-11] Vitale N, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Riemenschneider W, Moss J, Vaughan M (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID 10748148.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]