Домен гомологии кальпонина - Википедия - Calponin homology domain

Домен гомологии кальпонина (CH)
2RR8.pdb.jpg
Структура раствора домена гомологии кальпонина IQGAP1[1]
Идентификаторы
СимволCH
PfamPF00307
ИнтерПроIPR001715
УМНАЯCH
PROSITEPDOC00019
SCOP21aoa / Объем / СУПФАМ
CDDcd00014

Домен гомологии кальпонина (или домен CH) это семья актин связывающие домены, обнаруженные как в белках цитоскелета, так и в белках сигнальной трансдукции.[2] Домен имеет длину около 100 аминокислот и состоит из четырех альфа-спиралей.[3] Он состоит из следующих групп актин-связывающих доменов:

Подробный обзор белков, содержащих этот тип актин-связывающих доменов, приведен в.[4]

Домен CH участвует в связывании актина у некоторых членов этого семейства. Однако в кальпонинах есть доказательства того, что домен CH не участвует в его активности связывания с актином.[5] Большинство белков имеют две копии домена CH, однако некоторые белки, такие как кальпонин и протоонкоген vav человека (P15498) есть только в единственном экземпляре. Структура примерного домена CH была определена с использованием Рентгеновская кристаллография.[6]

Примеры

Гены человека, кодирующие белки, содержащие гомологичный домен кальпонина, включают:

Рекомендации

  1. ^ PDB: 2RR8​; Умемото Р., Нисида Н., Огино С., Шимада И. (сентябрь 2010 г.). «Структура ЯМР домена гомологии кальпонина человеческого IQGAP1 и ее значение для режима распознавания актина». J. Biomol. ЯМР. 48 (1): 59–64. Дои:10.1007 / s10858-010-9434-8. PMID  20644981. S2CID  25649748.
  2. ^ Сарасте М., Кастресана Дж. (1995). «Связывается ли Vav с F-actin через домен CH?». FEBS Lett. 374 (2): 149–151. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 01098-У. PMID  7589522. S2CID  29667309.
  3. ^ Коренбаум, Э .; Риверо, Ф. (сентябрь 2002 г.). "Домены гомологии кальпонина с первого взгляда". J Cell Sci. 115 (Pt 18): 3543–5. CiteSeerX  10.1.1.608.8653. Дои:10.1242 / jcs.00003. PMID  12186940. S2CID  38137068.
  4. ^ Хартвиг ​​JH (1995). «Актин-связывающие белки. 1: Суперсемейство Spectrin». Протеин Проф. 2 (7): 703–800. PMID  7584474.
  5. ^ Гимона М., Митал Р. (1998). «Единственный домен CH кальпонина не является ни достаточным, ни необходимым для связывания F-актина». J. Cell Sci. 111: 1813–1821. PMID  9625744.
  6. ^ Сарасте М., Каруго К.Д., Бануэлос С. (1997). «Кристаллическая структура домена гомологии кальпонина». Nat. Struct. Биол. 4 (3): 175–179. Дои:10.1038 / nsb0397-175. PMID  9164454. S2CID  1428195.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001715