EVA (контрольный показатель) - EVA (benchmark)

EVA был непрерывно работающим ориентир проект по оценке качества и стоимости предсказание структуры белка и прогноз вторичной структуры методы. Методы прогнозирования обоих вторичная структура и третичная структура - включая моделирование гомологии, белковая нить, и контактный заказ предсказание - сравнивались с результатами вновь решенных за каждую неделю белковые структуры депонировано в Банк данных белков. Проект был нацелен на определение точности прогнозов, ожидаемой от обычных общедоступных прогнозов, не являющихся экспертами. веб-серверы; это похоже на связанный LiveBench проект и контрастирует с двухгодичным эталоном CASP, цель которого - определить максимальную точность, достижимую экспертами по прогнозированию.

Рекомендации

  • Рост Б, Эйрих В.А. (2001). EVA: крупномасштабный анализ прогноза вторичной структуры. Белки Дополнение 5: 192-9. PMID  11835497
  • Эйрих В.А., Марти-Реном М.А., Пшибыльски Д., Мадхусудхан М.С., Фисер А., Пазос Ф., Валенсия А, Сали А., Рост Б. (2001). EVA: непрерывная автоматическая оценка серверов прогнозирования структуры белка. Биоинформатика 17(12):1242-3. PMID  11751240
  • Ко И.Ю., Эйрих В.А., Марти-Реном М.А., Пшибыльски Д., Мадхусудхан М.С., Эсвар Н., Грана О., Пазос Ф., Валенсия А., Сали А., Рост Б. (2003). EVA: Оценка серверов предсказания структуры белка. Нуклеиновые кислоты Res 31(13):3311-5. PMID  12824315

внешняя ссылка