Суммирование Эвальда - Ewald summation

Суммирование Эвальда, названный в честь Пол Питер Эвальд, представляет собой метод вычисления дальнодействующих взаимодействий (например, электростатические взаимодействия ) в периодических системах. Впервые он был разработан как метод расчета электростатической энергии ионные кристаллы, и теперь обычно используется для расчета дальнодействующих взаимодействий в вычислительная химия. Суммирование по Эвальду - это частный случай Формула суммирования Пуассона, заменяя суммирование энергий взаимодействия в реальном пространстве эквивалентным суммированием в Пространство Фурье. В этом методе дальнодействующее взаимодействие делится на две части: ближний вклад и дальнодействующий вклад, который не имеет необычность. Вклад ближнего действия рассчитывается в реальном пространстве, тогда как вклад дальнего действия рассчитывается с использованием преобразование Фурье. Преимущество этого метода - быстрое конвергенция энергии по сравнению с прямым суммированием. Это означает, что метод имеет высокую точность и разумную скорость при вычислении дальнодействующих взаимодействий и, таким образом, фактически является стандартным методом расчета дальнодействующих взаимодействий в периодических системах. Метод требует зарядовой нейтральности молекулярной системы, чтобы точно рассчитать полное кулоновское взаимодействие. Колафа и Перрам изучают ошибки усечения, вносимые в расчет энергии и силы неупорядоченных систем точечных зарядов.[1]

Вывод

Суммирование Эвальда переписывает потенциал взаимодействия как сумму двух членов:

,

куда представляет собой краткосрочный член, сумма которого быстро сходится в реальном пространстве и представляет собой долгосрочный член, сумма которого быстро сходится в фурье (обратном) пространстве. Длинная часть должна быть конечной для всех аргументов (особенно р = 0), но может иметь любую удобную математическую форму, чаще всего Гауссово распределение. Метод предполагает, что короткодействующая часть легко суммируется; следовательно, проблема сводится к суммированию долгосрочного члена. За счет использования суммы Фурье в методе неявно предполагается, что исследуемая система бесконечно периодический (разумное предположение для недр кристаллов). Одна повторяющаяся единица этой гипотетической периодической системы называется ячейка. Одна такая ячейка выбирается в качестве «центральной ячейки» для справки, а остальные ячейки называются изображений.

Энергия дальнодействующего взаимодействия - это сумма энергий взаимодействия между зарядами центральной элементарной ячейки и всеми зарядами решетки. Следовательно, его можно представить как двойной интеграл по двум полям плотности заряда, представляющим поля элементарной ячейки и кристаллической решетки

где поле плотности заряда элементарной ячейки это сумма по позициям обвинений в центральной элементарной ячейке

и общий поле плотности заряда такая же сумма по зарядам элементарной ячейки и их периодические образы

Здесь, это Дельта-функция Дирака, , и - векторы решетки и , и диапазон по всем целым числам. Общее поле можно представить как свертка из с функция решетки

Поскольку это свертка, то Преобразование Фурье из это продукт

где преобразование Фурье решеточной функции представляет собой другую сумму по дельта-функциям

где векторы обратного пространства определены (и циклические перестановки), где - объем центральной элементарной ячейки (если она геометрически параллелепипед, что бывает часто, но не обязательно). Обратите внимание, что оба и настоящие, даже функции.

Для краткости определим эффективный одночастичный потенциал

Поскольку это тоже свертка, преобразование Фурье того же уравнения представляет собой произведение

где преобразование Фурье определено

Теперь энергию можно записать как Один интеграл поля

С помощью Теорема Планшереля, энергию также можно просуммировать в пространстве Фурье

куда в окончательном подведении итогов.

Это существенный результат. Один раз вычисляется суммирование / интегрирование по прост и должен быстро сходиться. Наиболее частой причиной отсутствия сходимости является плохо определенная элементарная ячейка, которая должна быть нейтральной по заряду, чтобы избежать бесконечных сумм.

Метод Эвальда с использованием сетки частиц (PME)

Суммирование Эвальда было развито как метод в теоретическая физика, задолго до появления компьютеры. Однако метод Эвальда получил широкое распространение с 1970-х гг. компьютерное моделирование систем частиц, особенно тех, частицы которых взаимодействуют через обратный квадрат сила закон, такой как сила тяжести или же электростатика. В последнее время PME также использовался для расчета часть Потенциал Леннарда-Джонса для устранения артефактов из-за усечения.[2] Приложения включают моделирование плазма, галактики и молекулы.

В методе сетки частиц, как и в стандартном суммировании Эвальда, общий потенциал взаимодействия разделяется на два члена. Основная идея суммирования Эвальда сетки частиц состоит в том, чтобы заменить прямое суммирование энергий взаимодействия между точечными частицами.

с двумя суммированиями прямая сумма краткосрочного потенциала в реальном космосе

(это частица часть сетка частиц Ewald) и суммирование в пространстве Фурье дальнодействующей части

куда и представляют Преобразования Фурье из потенциал и плотность заряда (это Эвальд часть). Поскольку оба суммирования быстро сходятся в своих соответствующих пространствах (вещественном и Фурье), они могут быть усечены с небольшой потерей точности и значительным сокращением требуемого времени вычислений. Чтобы оценить преобразование Фурье поля плотности заряда эффективно использовать Быстрое преобразование Фурье, который требует, чтобы поле плотности оценивалось на дискретной решетке в пространстве (это сетка часть).

Из-за предположения о периодичности, неявного в суммировании Эвальда, приложения метода PME к физическим системам требуют наложения периодической симметрии. Таким образом, этот метод лучше всего подходит для систем, которые можно моделировать как бесконечные по пространству. В молекулярная динамика при моделировании это обычно выполняется путем преднамеренного построения элементарной ячейки с нейтральным зарядом, которую можно бесконечно «мозаично» формировать для формирования изображений; однако, чтобы правильно учесть эффекты этого приближения, эти изображения повторно включаются обратно в исходную ячейку моделирования. Общий эффект называется периодическое граничное условие. Чтобы представить это наиболее ясно, представьте себе единичный куб; верхняя сторона эффективно контактирует с нижней стороной, правая - с левой, а передняя - с задней. В результате размер элементарной ячейки должен быть тщательно выбран, чтобы он был достаточно большим, чтобы избежать неправильной корреляции движения между двумя сторонами, «находящимися в контакте», но все же достаточно малым, чтобы его можно было вычислить. Определение границы между короткими и дальними взаимодействиями также может вносить артефакты.

Ограничение поля плотности сеткой делает метод PME более эффективным для систем с «плавными» изменениями плотности или непрерывными потенциальными функциями. Локализованные системы или системы с большими колебаниями плотности можно более эффективно обрабатывать с помощью быстрый мультипольный метод Грингарда и Рохлина.

Дипольный член

Электростатическая энергия полярного кристалла (т.е. кристалла с чистым диполем в элементарной ячейке) условно сходящийся, т.е. зависит от порядка суммирования. Например, если диполь-дипольные взаимодействия центральной элементарной ячейки с элементарными ячейками, расположенными на постоянно увеличивающемся кубе, энергия сходится к другому значению, чем если бы энергии взаимодействия были суммированы сферически. Грубо говоря, эта условная сходимость возникает потому, что (1) количество взаимодействующих диполей на оболочке радиуса растет как ; (2) сила одиночного диполь-дипольного взаимодействия падает как ; и (3) математическое суммирование расходится.

Этот несколько удивительный результат можно согласовать с конечной энергией реальных кристаллов, потому что такие кристаллы не бесконечны, т.е. имеют определенную границу. Более конкретно, граница полярного кристалла имеет эффективную поверхностную плотность заряда на своей поверхности. куда - вектор нормали к поверхности и представляет собой чистый дипольный момент на объем. Энергия взаимодействия диполя в центральной элементарной ячейке с такой поверхностной плотностью заряда можно записать[3]

куда и - суммарный дипольный момент и объем элементарной ячейки, бесконечно малая площадь на поверхности кристалла и - вектор от центральной элементарной ячейки к бесконечно малой площади. Эта формула является результатом интегрирования энергии куда представляет собой бесконечно малое электрическое поле, создаваемое бесконечно малым поверхностным зарядом (Закон Кулона )

Отрицательный знак происходит из определения , который указывает на заряд, а не от него.

История

Суммирование Эвальда было разработано Пол Питер Эвальд в 1921 г. (см. ссылки ниже) для определения электростатической энергии (и, следовательно, Постоянная Маделунга ) ионных кристаллов.

Масштабирование

Как правило, разные методы суммирования Эвальда дают разные временные сложности. Прямой расчет дает , куда - количество атомов в системе. Метод PME дает .[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Колафа, Иржи; Перрам, Джон В. (сентябрь 1992 г.). «Ошибки обрезания в формулах суммирования Эвальда для систем точечных зарядов». Молекулярное моделирование. 9 (5): 351–368. Дои:10.1080/08927029208049126.
  2. ^ Ди Пьерро, М .; Эльбер, Р .; Леймкулер, Б. (2015), "Стохастический алгоритм для изобарино-изотермического ансамбля с суммированием Эвальда для всех дальнодействующих сил.", Журнал химической теории и вычислений, 11 (12): 5624–5637, Дои:10.1021 / acs.jctc.5b00648, ЧВК  4890727, PMID  26616351.
  3. ^ Герц, HD; Гарсия, AE; Дарден, Т. (28 марта 2007 г.). «Электростатический поверхностный член: (I) периодические системы». Журнал химической физики. 126 (12): 124106. Bibcode:2007ЖЧФ.126л4106Н. Дои:10.1063/1.2714527. PMID  17411107.
  4. ^ J. Chem. Phys. 98, 10089 (1993); Дои:10.1063/1.464397
  • Эвальд, П. (1921). "Die Berechnung optischer und elektrostatischer Gitterpotentiale". Анна. Phys. 369 (3): 253–287. Bibcode:1921АнП ... 369..253Э. Дои:10.1002 / andp.19213690304.
  • Дарден, Т; Перера, L; Ли, Л; Педерсен, Л. (1999). «Новые приемы для разработчиков моделей из набора инструментов кристаллографии: алгоритм Эвальда с сеткой частиц и его использование при моделировании нуклеиновых кислот». Структура. 7 (3): R55 – R60. Дои:10.1016 / S0969-2126 (99) 80033-1. PMID  10368306.
  • Френкель, Д., и Смит, Б. (2001). Понимание молекулярного моделирования: от алгоритмов к приложениям, Академическая пресса.