FXR1 - FXR1

FXR1
Белок FXR1 PDB 2cpq.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFXR1, FXR1P, аутосомный гомолог 1 FMR1, MYORIBF, MYOPMIL
Внешние идентификаторыOMIM: 600819 MGI: 104860 ГомолоГен: 3573 Генные карты: FXR1
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение FXR1
Геномное расположение FXR1
Группа3q26.33Начните180,868,141 бп[1]
Конец180,982,753 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FXR1 201637 s на fs.png

PBB GE FXR1 201636 в fs.png

PBB GE FXR1 201635 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001013438
NM_001013439
NM_005087
NM_001363882

NM_001113188
NM_001113189
NM_008053

RefSeq (белок)

NP_001013456
NP_001013457
NP_005078
NP_001350811

NP_001106659
NP_001106660
NP_032079

Расположение (UCSC)Chr 3: 180.87 - 180.98 МбChr 3: 34.02 - 34.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок 1, связанный с синдромом ломкой X-умственной отсталости это белок что у людей кодируется FXR1 ген.[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой связывающий РНК белок, который взаимодействует с функционально подобными белками FMR1 и FXR2. Эти белки перемещаются между ядром и цитоплазмой и связываются с полирибосомами, преимущественно с рибосомной субъединицей 60S. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7]

Взаимодействия

FXR1 был показан взаимодействовать с участием FXR2,[8][9] FMR1 [8][9] и CYFIP2.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114416 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027680 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сиоми М.С., Сиоми Х., Зауэр WH, Сринивасан С., Нуссбаум Р.Л., Дрейфус Г. (июль 1995 г.). «FXR1, аутосомный гомолог хрупкого гена умственной отсталости X». EMBO J. 14 (11): 2401–8. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07237.x. ЧВК  398353. PMID  7781595.
  6. ^ Боливар Дж., Гельман С., Иглесиас С., Ортис М., Вальдивия М.М. (август 1998 г.). «Ген FXR1, связанный с ломким X, представляет собой человеческий аутоантиген, процессируемый во время апоптоза». J Biol Chem. 273 (27): 17122–7. Дои:10.1074 / jbc.273.27.17122. PMID  9642279.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: FXR1 ломкая X умственная отсталость, аутосомный гомолог 1».
  8. ^ а б Сиоми, М. С; Zhang Y; Siomi H; Дрейфус Г. (июль 1996 г.). «Специфические последовательности в белке синдрома ломкой Х-хромосомы FMR1 и белках FXR опосредуют их связывание с 60S рибосомными субъединицами и взаимодействия между ними». Мол. Cell. Биол. 16 (7): 3825–32. Дои:10.1128 / mcb.16.7.3825. ISSN  0270-7306. ЧВК  231379. PMID  8668200.
  9. ^ а б Zhang, Y; О'Коннор Дж. П.; Siomi M C; Шринивасан S; Дутра А; Nussbaum R L; Дрейфус Г. (ноябрь 1995 г.). «Белок синдрома ломкой X-умственной отсталости взаимодействует с новыми гомологами FXR1 и FXR2». EMBO J. 14 (21): 5358–66. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00220.x. ISSN  0261-4189. ЧВК  394645. PMID  7489725.
  10. ^ Шенк А., Бардони Б., Моро А., Баньи С., Мандель Дж. Л. (июль 2001 г.). «Семейство высококонсервативных белков, взаимодействующих с ломким белком X-психической отсталости (FMRP) и демонстрирующих селективные взаимодействия с FMRP-родственными белками FXR1P и FXR2P». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (15): 8844–9. Bibcode:2001PNAS ... 98.8844S. Дои:10.1073 / pnas.151231598. ЧВК  37523. PMID  11438699.

дальнейшее чтение