Утечка сканирования - Leaky scanning

Утечка сканирования это механизм, используемый на этапе инициации эукариотический перевод что позволяет регулировать экспрессия гена. Во время инициации малый 40S рибосомальная субъединица (как 43S PIC ) "сканирует" или перемещается в направлении 5 '-> 3' вдоль 5'UTR найти стартовый кодон для начала удлинения. Иногда сканирующая рибосома обходит начальный стартовый кодон AUG и начинает трансляцию с последующих стартовых кодонов AUG.[1] Трансляция в эукариотических клетках в соответствии с большинством механизмов сканирования происходит в стартовом кодоне AUG, проксимальнее 5' конец мРНК; однако сканирующая рибосома может столкнуться с «неблагоприятным нуклеотидным контекстом» вокруг стартового кодона и продолжить сканирование.[2]

В некоторых случаях было обнаружено, что инициация происходит выше по течению в кодоне, отличном от AUG. Эукариотические гены, содержащие последовательные G-C богатый лидерные последовательности часто наблюдаются выполнение этого механизма. Предполагается, что сканирование замедляется из-за вторичной структуры, которая позволяет связывать Встретил -тРНК с кодоном несовпадения.[3]

Несколько вирусы использовать негерметичный механизм сканирования для получения жизненно важных белки что означает, что утечка сканирования не является следствием несоответствия, а позволяет вирусам преодолеть селективное давление соревноваться со своими хозяевами.[4] Молекулярные биологи сужают круг поиска идеальной нуклеотидной среды для инициации трансляции и механизмов репликации вирусов.[1]

Открытие

Через несколько исследований Мэрилин Козак был первым, кто осознал основную роль сканирования в инициации трансляции в клетках млекопитающих. Кодон AUG у млекопитающих оптимально распознается контекстом GCCRCCAUGG, также известным как «консенсусная последовательность Козака».[5] Пурин (R) и каждый из нуклеотидов в этой последовательности являются высококонсервативными и обеспечивают важную функцию распознавания и инициации трансляции для многих 40S субъединиц рибосомы. При оптимальном контексте в стартовом кодоне AUG рибосомы начнут инициацию в этой точке. Слабый контекст возникает, когда последовательности, смежные со стартовым кодоном AUG, отклоняются от согласованной последовательности. Некоторые рибосомы по-прежнему инициируют трансляцию в слабом месте, но большинство будет выполнять сканирование с утечкой и инициировать ниже по течению. Как следствие, вероятно, будут производиться разные белки.[3]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б Козак, Мэрилин. «Инициирование трансляции у прокариот и эукариот». Gene 234 (1999): 187-208. Академический поиск завершен. Интернет. 10 июня 2014 г.
  2. ^ Herzog, Etienne., Et al. «Трансляция второго гена РНК 2 вируса комочков арахиса происходит при сканировании с утечкой данных in vitro». Вирусология 208. (1995): 215-225. Академический поиск завершен. Интернет. 10 июня 1014 г.
  3. ^ а б Козак, Мэрилин. «Расширяя пределы сканирующего механизма инициации перевода». Ген 299 (2002): 1-34. Академический поиск завершен. Интернет. 11 июня 2014 г.
  4. ^ Рябоба, Любовь. И др. «Повторная инициализация трансляции и сканирование с утечками в растительных вирусах». Virus Research 119 (2006): 52-62 Академический поиск завершен. Интернет. 23 июня 2014 г.
  5. ^ Хиннебуш, Алан., «Молекулярный механизм сканирования и выбора стартовых кодонов у эукариот». Американское общество микробиологии Vol. 75 нет. 3. (2011): 434-467. Интернет. 11 июня 2014 г.