Проект Атлас малярии - Malaria Atlas Project

Проект Атлас малярии
MAP Logo.png
СокращениеКАРТА
Формирование1 мая 2006 г.; 14 лет назад (2006-05-01)[1][2]
ЦельОпределение пространственных границ Плазмодий falciparum и Плазмодий вивакс малярия в глобальном масштабе и ее эндемичность в этом диапазоне
Штаб-квартираПерт, Австралия
Обслуживаемый регион
Глобальный
Официальный язык
английский
Руководитель группы
Профессор Питер Гетинг
Головная организация
Детский институт телемарафона
Интернет сайтhttps://malariaatlas.org/

Проект Атлас малярии, сокращенно MAP, это некоммерческая академическая группа, возглавляемая профессором Питером Гетингом, заведующим кафедрой здоровья детей Керри М. Стокса, Детский институт телемарафона, Перт, Западная Австралия. Группа финансируется Фонд Билла и Мелинды Гейтс, при этом предыдущее финансирование также поступало от Совет медицинских исследований и Wellcome Trust. MAP стремится распространять бесплатную, точную и актуальную информацию о малярия и связанные темы, организованные по географическому принципу. Работа МАП делится на три области:

Команда MAP собрала уникальную пространственную базу данных по связанной информации, полученной из медицинской разведки, спутниковых климатических данных, чтобы ограничить пределы передачи малярии,[3] и самый большой архив оценок распространенности паразитов на уровне сообществ.[4] Эти данные были собраны и проанализированы группой специалистов. географы, статистики, эпидемиологи, биологи и здравоохранение специалистов. Кроме того, если эти данные были очищены для публикации, они доступны через инструмент анализа данных на веб-сайте MAP.

История

MAP был основан Бобом Сноу и Саймон Хэй в 2005 году, чтобы заполнить нишу сообщества по борьбе с малярией в глобальном масштабе. С 2012 по 2015 год его возглавляли Питер Гетинг, Дэйв Смит, Кэтрин Мойес и Саймон Хэй.Первоначальная цель MAP была сосредоточена на прогнозировании эндемичности Плазмодий falciparum,[5] наиболее смертоносная форма малярийного паразита в связи с его глобальным эпидемиологическим значением и лучшими перспективами ликвидации и контроля. В 2009 году началась работа по выявлению масштабов и бремени относительно запущенных Плазмодий вивакс.

Хранилище данных открытого доступа из проекта Атлас малярии (ROAD-MAP) было создано Кэтрин Мойес, Саймон Хэй и Боба Сноу в 2011 году. С 2014 по 2019 год его возглавляли Питер Гетинг и Майк Торн.

Академическое исследование

Моделирование распространенности малярии

Ключевым аспектом работы MAP является использование статистических подходов к моделированию распространенности различных форм малярия в глобальном масштабе с использованием Байесовский модельный геостатистика.[6]

Известно, что на распространенность малярии влияют различные факторы окружающей среды. Известно, что распространенность малярии относительно предсказуемо варьируется в пространстве и времени, а наблюдаемая распространенность малярии во многом зависит от возраста людей и охвата вмешательством.

В пространственная эпидемиология, обычно обнаруживается, что очень мало измерений было выполнено в больших частях интересующего географического региона. Доступные измерения могут быть подвержены ошибкам или могут быть неполными, и почти всегда опрашивается подмножество местного населения.

С 2005 года MAP собрал обширную базу данных обследований из различных источников. Эти обследования, как правило, группируются на уровне села и регистрируют данные о показателях паразитарной положительности, обычно определяемые с помощью экспресс-анализов крови. Кроме того, MAP собрал обширные данные по таким ковариатам, как температурная пригодность и растительный покров. Эти факторы влияют на распространение комаров-переносчиков малярии.

Преимущество использования геостатистики на основе байесовской модели заключается в том, что она передает пространственно изменяющийся уровень неопределенности, связанный с нанесенной на карту поверхностью.

Вероятность того, что любая из очень многих индивидуальных (кандидатов) карт является единственной правильной картой, мала, поэтому нецелесообразно сообщать единственную наиболее вероятную карту. Однако вместе взятые карты-кандидаты позволяют вычислить вероятность правильности утверждений о карте, таких как Плазмодий falciparum эндемичность в точке x в 2010 г. составляла от 0,1 до 0,3 ".

Плазмодий falciparum карты распространенности

С 2000 года согласованная кампания против малярии привела к беспрецедентному уровню охвата вмешательством во всех странах. К югу от Сахары. Планирование будущего контроля зависит от понимания эффекта этих усилий. Однако влияние мероприятий по борьбе с малярией в различных эпидемиологических условиях Африки остается плохо изученным из-за отсутствия надежных данных эпиднадзора и упрощенных подходов, лежащих в основе текущих оценок заболеваемости.

В сентябре 2015 г. исследование MAP, опубликованное в Природа количественно оценили влияние усилий по борьбе с малярией в Африке. Результаты показали Плазмодий falciparum Распространенность инфекции в эндемичной Африке сократилась вдвое, а частота клинических заболеваний упала на 40% в период с 2000 по 2015 годы. По наилучшим оценкам, с 2000 года с помощью вмешательств удалось предотвратить 663 миллиона клинических случаев. крупнейший участник. Несмотря на то, что текущие мероприятия по борьбе с малярией все еще ниже целевых уровней, они существенно снизили заболеваемость малярией на всем континенте.[7][8]

Мировая карта эндемичности Plasmodium falciparum в 2010 г.

Плазмодий вивакс карты распространенности

В 2012 году МАП опубликовала первые глобальные карты для Плазмодий вивакс эндемичность.[4]

Пространственное распределение карты эндемичности малярии Plasmodium vivax в мире в 2010 г.

Сбор, курирование и распространение данных

Всемирные доклады ВОЗ по малярии

Команда MAP работает в сотрудничестве с Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) предоставить оценки распространенности в странах Африки к югу от Сахары для ежегодного Доклада о малярии в мире. Кроме того, MAP помогает ВОЗ в составлении карт ежегодных показателей распространенности во Всемирном докладе о малярии.

Текущее курирование данных

База данных MAP является крупнейшим источником обработанных маляриометрических данных.

К апрелю 2015 года база данных MAP содержала:

  • 40 000 записей обследования уровня паразитов в кластерах с географической привязкой из 2010 источников
  • База данных содержит около 50 000 записей о ежегодной заболеваемости паразитами (далее API) за период с 2002 по 2010 год.

MAP активно ищет и обрабатывает широкий спектр дополнительных данных из разных источников, включая следующие:

  • Данные индикатора охвата вмешательством против малярии
  • Данные о частоте паразитов
  • Годовые данные о заболеваемости паразитами
  • Данные обращения за лечением
  • Спутниковые данные для создания ковариативных растровых поверхностей
  • Данные о заболевании крови
  • Биономика и данные о распространении комаров

MAP стремится к бесплатному и открытому распространению этих данных (если владелец данных разрешил их опубликовать). Распространение данных упрощается с помощью главной веб-страницы MAP и инструмента Explorer. Последний позволяет пользователям загружать табличные данные о малярии по странам.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Хэй, Симон I; Сноу, Роберт В. (5 декабря 2006 г.). «Проект« Атлас малярии »: разработка глобальных карт риска малярии». PLOS Медицина. PLOS. 3 (12): e473. Дои:10.1371 / journal.pmed.0030473. ЧВК  1762059. PMID  17147467. Веб-сайт MAP (https://malariaatlas.org ) был запущен 1 мая 2006 года для достижения целей и амбиций MAP.
  2. ^ «Исследователи MAP». Проект Атлас малярии. Получено 9 января, 2017. Проект Атлас малярии (MAP) был основан в 2005 году.
  3. ^ Weiss, D.J .; Mappin, B .; Dalrymple, U .; Bhatt, S .; Cameron, E .; Hay, S.I; Gething, P.W. (7 февраля 2015 г.). «Пересмотр экологических коррелятов эндемичности малярии Plasmodium falciparum: подход к отбору переменных с большим объемом данных». Журнал Малярии. 14 (68): 68. Дои:10.1186 / s12936-015-0574-х. ЧВК  4333887. PMID  25890035.
  4. ^ а б Gething, P.W .; Elyazar, I.R.F .; Мойес, К. М.; Smith, D.L .; Battle, K.E .; Guerra, CA; Патил, А.П .; Tatem, A.J .; Howes, R.E .; Myers, M.F .; Джордж, Д. Б.; Horby, P .; Wertheim, H.F .; Price, R., Müller.I; Baird, J.K .; HAY, S.I (6 сентября 2012 г.). «Карта мира по малярии, которой давно не уделялось внимания: эндемичность Plasmodium vivax». PLoS забытые тропические болезни. 6 (9): e1814. Дои:10.1371 / journal.pntd.0001814. ЧВК  3435256. PMID  22970336.
  5. ^ Gething, P.W; Патил, А.П .; Smith, D.L .; Guerra, CA; Elyazar, I.R.F .; Johnston, G.L .; Tatem, A.J .; Хэй, С.И. (20 декабря 2011 г.). «Новая карта мира по малярии: эндемичность Plasmodium falciparum в 2010 г.». Журнал Малярии. 10 (378): 378. Дои:10.1186/1475-2875-10-378. ЧВК  3274487. PMID  22185615.
  6. ^ Патил, Ананд П .; Гетинг, Питер В .; Piel, Frédéric B .; Хэй, Саймон И. (2011). «Байесовская геостатистика в медицинской картографии: перспектива малярии». Тенденции в паразитологии. 27 (6): 246–253. Дои:10.1016 / j.pt.2011.01.003. ЧВК  3109552. PMID  21420361.
  7. ^ Bhatt, S .; Weiss, D. J .; Cameron, E .; Bisanzio, D .; Mappin, B .; Dalrymple, U .; Battle, K. E .; Moyes, C.L .; Генри, А. (октябрь 2015 г.). «Влияние борьбы с малярией на Plasmodium falciparum в Африке в период с 2000 по 2015 год». Природа. 526 (7572): 207–211. Дои:10.1038 / природа15535. ЧВК  4820050. PMID  26375008.
  8. ^ «Миллионы детских жизней спасены благодаря падению смертности от малярии: ООН». Рейтер. 2015-09-16. Получено 2015-12-09.

внешняя ссылка