Ортобунявирус - Википедия - Orthobunyavirus

Ортобунявирус
Peribunyavirus вирион structure.gif
Структура ортобунявируса (слева); трансмиссионная электронная микрофотография из Вирус калифорнийского энцефалита (верно)
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Учебный класс:Ellioviricetes
Заказ:Буньявиралес
Семья:Peribunyaviridae
Род:Ортобунявирус
Типовой вид
Ортобуньявирус Буньямвера
Разновидность[1]

см текст

Ортобунявирус это род из Peribunyaviridae семья[2] в порядке Буньявиралес. В настоящее время известно около 170 вирусов этого рода. Всего насчитывается 97 видов.[1] и 20 серогрупп.

Название Ортобунявирус происходит от Буньямвера, Уганда,[3] где оригинал типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера был впервые обнаружен,[4] вместе с префиксом Ортопеды (ορϑοϛ), что означает «прямой».[5]

В типовой вид является Ортобуньявирус Буньямвера.

Эпидемиология

Наиболее разнообразен род по Африка, Австралия и Океания, но встречается почти во всем мире. Самый ортобуньявирус разновидность передаются комары и вызывают болезни крупный рогатый скот.[нужна цитата ] В Вирус калифорнийского энцефалита, то Вирус Ла Кросса и Вирус Джеймстаунского каньона находятся североамериканский виды, которые вызывают энцефалит в людях.

Вирусология

Геном Вирус Буньямвера рода Ортосбуниавирус[3]
  • Типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера.[6]
  • Вирус имеет сферическую форму, диаметр от 80 до 120 нм, и состоит из трех одноцепочечных молекул РНК с отрицательным смыслом, инкапсулированных в рибонуклеокапсид.[7]
  • Три РНК обозначены как S, M и L (для малых, средних и больших) и имеют длину около 1 килобаз, 4,5 и 6,9 килобайт.[8][7][9]
  • S-РНК кодирует белок нуклеокапсида (белок N) и неструктурный белок (белок NS).[10]
  • М РНК кодирует полипротеин, который расщепляется протеазой хозяина на белки Gn, NSm и Gc.[7]
  • L-РНК кодирует вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу или L-белок.[11]

Жизненный цикл

Векторы

Первичные переносчики ортобуньявирусов: гематофаг насекомые Culicidae семья, в том числе представители ряда родов комаров (в том числе Aedes, Coquillettidia, Culex, Кулисета, и Анофелес ) и мокрецов (таких как Куликоидес параенсис ).[12][9] Хотя также возможна передача клещами и постельными клопами. Предпочтение вирусных векторов обычно строгое, только один или очень небольшое количество векторов передают конкретный вирус в регионе, даже если несколько вирусов и векторов перекрываются.[13] Организмы, относящиеся к предпочтительному переносчику, могут переносить вирус, но не могут передавать его компетентно.[9]

Членистоногие-переносчики заражаются вирусом, питаясь кровью инфицированного хозяина. У комаров репликация ортобуньявирусов усиливается за счет иммуномодуляции, которая возникает в результате переваривания белков крови, производящих ГАМК и активация ГАМКергической передачи сигналов.[14] Инфекция передается новому хозяину через вирусные частицы в слюне переносчиков.[14] Ортобунявирусная инфекция в членистоногие клетки до конца не изучены, но обычно не являются цитопатологическими и вредные эффекты минимальны.[15][13] Зараженные комары могут улучшить физическую форму.[13] Трансорвариальная передача наблюдалась среди москитов, инфицированных ортобуньявирусами калифорнийской серогруппы.[9] Подобно комарам, кровью питаются только самки куликоидных мошек; они предпочитают кормление в помещении, особенно во время дождя.[9]

Хосты Sylvatic Cycle

в сливатический цикл, вирусы передаются между млекопитающими-хозяевами посредством членистоногих векторов. В качестве хозяев или резервуаров ортобуньявирусов был идентифицирован широкий круг млекопитающих, включая приматов, ленивцев, диких и домашних птиц, мартышек, грызунов и крупных млекопитающих, таких как олени, лоси и лоси.[12][9]

Инфекционное заболевание

Заражение начинается с укуса инфицированного компетентного переносчика. Проникновение вируса происходит посредством рецептор-опосредованного (клатрин-зависимого) эндоцитоза, но рецепторы неизвестны.[15] Несмотря на то что, Гепаран сульфат и DC-SIGN (CD209 или Дендритная клетка -специфическая молекула внутриклеточной адгезии -3-захватывающий неинтегрин) были идентифицированы как компоненты проникновения вируса в некоторых ортобуньявирусах.[13][15] Гетеродимеры Gn / Gc на вирусной поверхности ответственны за распознавание клеток-мишеней[16], с Gc считается первичным белком прикрепления, хотя Gn был предложен как белок прикрепления для LACV в клетках членистоногих.[13] Подкисление эндосомы запускает конформационные изменения в пептиде слияния Gc, освобождая рибонуклеарный белок (RNP), когда он высвобождается в цитоплазму.[16]

После высвобождения в цитоплазму первичная транскрипция начинается с того, что эндонуклеазный домен на L-белке участвует в процессе, известном как «захват крышки».[13][16] Во время захвата кэпа 10-18 нуклеотидов 5'-7-метилгуанилатных праймеров отщепляются от мРНК хозяина и прикрепляются к 5'-концу вирусных РНК.[9] Как и все РНК-вирусы с отрицательным смыслом, ортобуньявирусы требуют непрерывной параллельной трансляции клеткой-хозяином для получения полноразмерных вирусных мРНК, следовательно, на 3'-конце мРНК ортобуньявируса отсутствует полиаденилирование.[9] Примечательно, что у них также отсутствует сигнал полиаденилирования; вместо этого считается, что 3'-концы образуют структуру стержень-петля.[9][13] Антигеномы (полная длина положительный-смысловые РНК), используемые в качестве матриц для репликации вирусного генома, продуцируются L-белком RdRp без необходимости использования праймеров.[9] Как геномы с отрицательным смыслом, так и антигеномы с положительным смыслом связаны с N белками (образующими RNP) на всех этапах цикла репликации.[17] Таким образом, N и L - это минимальные белки, необходимые для транскрипции и репликации.[16][13]

Сегмент генома М кодирует полипротеин Gn-NSm-Gc на единственной открытой рамке считывания (ORF), кото-рый котрансляционно расщепляется внутренними сигнальными пептидами и сигнальной пептидазой хозяина.[16][9] Свободные гликопротеины Gc и Gn вставляются в мембрану эндоплазматического ретикулума и образуют гетеродимеры. Сигнал удержания Гольджи на Gn позволяет транспортировать гетеродимеры к аппарату Гольджи, где происходит гликозилирование. Присутствие вирусных гликопротеинов модифицирует мембрану Гольджи, позволяя отрастать РНП в производную Гольджи трубчатую вирусную фабрику (вироплазма ).[15][9] Ортобуйнавирусы, как сегментированные вирусы, требуют точной упаковки одного из трех геномных сегментов в конечный вирион для образования зрелой инфекционной частицы. Кажется, что упаковка направляется сигналами, полностью содержащимися в последовательностях UTR.[13] Упакованные геномы приобретают липидную мембрану по мере того, как попадают в вирусные фабрики, затем транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина и высвобождаются посредством экзоцитоза. Последняя модификация гилкопротеина после высвобождения дает зрелую инфекционную частицу.[13]

Эволюция

Ортобунявирусы частично эволюционируют с помощью ключевого механизма, известного как геномная реассортация, который также имеет место в других сегментированных вирусах. Когда вирусы одной и той же группы одновременно инфицируют клетку-хозяина, могут образовываться смеси и новые комбинации сегментов S, M и L, увеличивая разнообразие. Наиболее частые события перераспределения связаны с сегментами L и S.[18]

Таксономия

Разновидность

Таксономия остается несколько гибкой, поскольку секвенировано относительно небольшое количество вирусных геномов этого рода. Было показано, что некоторые из перечисленных вирусов являются рекомбинантами других вирусов и могут быть переклассифицированы. В роду 88 видов:[1]

Организовано по серогруппам

На основании результатов ингибирования перекрестной гемагглютинации и нейтрализации антител были определены 18 серогрупп. Другой - Виемия - с тех пор был признан. Некоторые вирусы еще не отнесены к одной из серогрупп. Серогруппа Симбу является самой крупной и насчитывает не менее 25 членов. Серогруппа группы C состоит как минимум из 13 человек. Важные с медицинской точки зрения вирусы принадлежат к серогруппам Bwamba, Bunyamwera, California, Group C и Simbu.

Список видов и штаммов ортобнявируса по серогруппам


Вирусы по серогруппе:

Анофелес серогруппы

  • Вирус Anopheles A
  • Вирус такайума
  • Вирус реки Вирджин
  • Комплекс Тромбетас
    • Вирус Аруматеуа
    • Вирус Караипе
    • Вирус тромбета
    • Вирус Тукуруи

Anopheles B серогруппы

  • Вирус Anopheles B
  • Вирус борасеи

Бакау серогруппа

  • Вирус Бакау
  • Вирус нола

Серогруппа Буньямвера

  • Комплекс Нгари
    • Вирус Гарисса
    • КВ-141 вирус
    • Вирус Нгари

Бвамба серогруппа

Калифорнийская серогруппа

Капим серогруппа

Серогруппа гамбоа

Группа C серогруппа

  • Вирус Bruconha
  • Осса вирус
  • Комплекс Карапару
    • Вирус апеу
    • Вирус Bruconha
    • Вирус Карапару
    • Винсес вирус
  • Мадридский комплекс
    • Мадридский вирус
    • Комплекс Маритуба
    • Гамбо вирус лимбо
    • Вирус Маритуба
    • Вирус Мурутюку
    • Непуйо вирус
    • Вирус Рестана
  • Орибока комплекс
    • Вирус Итаки
    • Орибока вирус

Серогруппа Гуама

  • Вирус Ananindeua
  • Вирус Бертиоги
  • Вирус Бимити
  • Вирус кананеи
  • Кату вирус
  • Вирус Ган Гана
  • Вирус Гуама
  • Вирус Гуаратуба
  • Итимирим вирус
  • Вирус гамака красного дерева
  • Вирус Мирим
  • Тимботуа вирус
  • Вирус Трубанамана

Кунгол серогруппа

  • Кунгол вирус
  • Вонгал вирус

Маппутта серогруппа

  • Вирус Buffalo Creek
  • Вирус Маппутта
  • Вирус Маприк
  • Вирус Муррамбиджи
  • Вирус солевой золы

Минатитлан серогруппа

  • Вирус Минатитлан
  • Вирус Палестины

Ньяндо серогруппа

  • Вирус эретмаподитов
  • Вирус Нямдо

Олифанстлей серогруппа

  • Вирус Ботамби
  • Olifanstlei вирус

Патуа серогруппа

  • Вирус абраса
  • Вирус Бабахойо
  • Вирус Пахайоке
  • Вирус Патуа
  • Вирус Shark River
  • Zegla вирус

Симбу серогруппа

  • Икитос вирус
  • Вирус Ятобаль
  • Leanyer вирус
  • Вирус Мермет
  • Оя вирус
  • Вирус тимири
  • Серокомплекс Шамонда
    • Вирус торфа
    • Вирус Шамонда

Тете серогруппа

  • Вирус Bahig
  • Вирус Батама
  • Вирус Матруха
  • Тете вирус
  • Цурусэ вирус
  • Вирус Велдона

Серогруппа турлока

  • Кедах вирус
  • Вирус Леднице
  • M'Poko вирус
  • Turlock вирус
  • Umbre вирус

Виемия серогруппа

  • Вирус Анхемби
  • Вирус Cachoeira Porteira
  • Вирус Иако
  • Вирус макауа
  • Соророка вирус
  • Вирус Тайассуи
  • Вирус Тукундуба
  • Виемия вирус

Неклассифицированный

  • Вирус Батама
  • Вирус Беллависта
  • Вирус Бельмона
  • Энсеада вирус
  • Эстеро Реал вирус
  • Вирус Герберта
  • Jonchet вирус
  • Вирус Юрона
  • Вирус Kaeng Khei
  • Вирус Кибале
  • Вирус Кованьяма
  • Вирус Mojuí dos Campos
  • Вирус Ntwetwe[20]
  • Вирус Taï
  • Tataguine вирус
  • Вирус Тринити
  • Вирус Витватерсранда
  • Вирус Волькберга
  • Вирус Якааба

Рекомендации

  1. ^ а б c «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 6 мая 2020.
  2. ^ Хьюз, HR; Адкинс, S; Альховский, С; Пиво, M; Блэр, C; Калишер, Швейцария; Дребот, М; Ламберт, AJ; де Соуза, ВМ; Marklewitz, M; Nunes, MRT; Shí 石晓宏, X; Консорциум отчетов ICTV (январь 2020 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Peribunyaviridae". Журнал общей вирусологии. 101 (1): 1–2. Дои:10.1099 / jgv.0.001365. PMID  31846417.
  3. ^ а б "Отчет ICTV Peribunyaviridae".
  4. ^ Smithburn KC, Haddow AJ, Mahaffy AF (март 1946 г.). «Нейротропный вирус, выделенный из комаров Aedes, пойманных в лесу Семлики». Американский журнал тропической медицины и гигиены. 26 (2): 189–208. Дои:10.4269 / ajtmh.1946.s1-26.189. OCLC  677158400. PMID  21020339.
  5. ^ Гриффит С (2005). «Словарь ботанических эпитетов». Словарь ботанических эпитетов. Получено 31 января 2019. orthos orth adj ορϑοϛ прямо
  6. ^ «Международный комитет по таксономии вирусов, Bunyaviridae». bio-mirror.cn. Архивировано из оригинал 9 сентября 2013 г.. Получено 20 декабря 2018.
  7. ^ а б c "Страница ViralZone". viralzone.expasy.org. Получено 20 декабря 2018.
  8. ^ Kascsak RJ, Lyons MJ (октябрь 1977 г.). «Вирус Буньямвера. I. Молекулярная сложность РНК вириона». Вирусология. 82 (1): 37–47. Дои:10.1016/0042-6822(77)90030-7. PMID  898678.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я j k л Эванс А.Б., Петерсон К.Е. (август 2019 г.). «Выбросьте карту: нейропатогенез глобально расширяющейся калифорнийской серогруппы ортобуньявирусов». Вирусы. 11 (9): 794. Дои:10.3390 / v11090794. ЧВК  6784171. PMID  31470541.
  10. ^ Генбанк: Сегмент S вируса Буньямвера, полная последовательность
  11. ^ Генбанк: L-сегмент вируса Буньямвера, полная последовательность
  12. ^ а б Саккас Х., Бозидис П., Фрэнкс А., Пападопулу С. (апрель 2018 г.). "Лихорадка оропуша: обзор". Вирусы. 10 (4): 175. Дои:10.3390 / v10040175. ЧВК  5923469. PMID  29617280.
  13. ^ а б c d е ж грамм час я j Эллиотт Р.М. (октябрь 2014 г.). «Ортобунявирусы: последние генетические и структурные открытия». Обзоры природы. Микробиология. 12 (10): 673–85. Дои:10.1038 / nrmicro3332. PMID  25198140.
  14. ^ а б У П, Ю Икс, Ван П, Ченг Джи (март 2019 г.). «Жизненный цикл арбовируса у комаров: приобретение, распространение и передача». Обзоры экспертов в области молекулярной медицины. 21: e1. Дои:10.1017 / erm.2018.6. PMID  30862324.
  15. ^ а б c d Дутузе М.Ф., Нзайирамбахо М., Морес С.Н., Кристоферсон Р.К. (2018-04-12). "Ортобунявирусы, потенциально опасные для здоровья". Границы ветеринарии. 5: 69. Дои:10.3389 / fvets.2018.00069. ЧВК  5906542. PMID  29707545.
  16. ^ а б c d е Павайя Р.В., Гупта В.К. (21.11.2013). «Обзор вирусной инфекции Шмалленберга: недавно возникшего заболевания крупного рогатого скота, овец и коз». Veterinární Medicína. 58 (10): 516–526. Дои:10.17221 / 7083-ветмед. ISSN  0375-8427.
  17. ^ Чжэн В., Тао Ю. Дж. (Май 2013 г.). «Инкапсидация генома нуклеопротеинами ортобуньявируса». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (22): 8769–70. Bibcode:2013PNAS..110.8769Z. Дои:10.1073 / pnas.1306838110. ЧВК  3670359. PMID  23696659.
  18. ^ да Роса, Хорхе Фернандо Травассос; де Соуза, Уильям Марсель; де Паула Пиньейро, Франсиско; Фигейредо, Марио Луис; Кардосо, Джедсон Феррейра; Акрани, Густаво Ольшанский; Нуньес, Марсио Роберто Тейшейра (06.02.2017). «Вирус оропуша: клинические, эпидемиологические и молекулярные аспекты забытого ортобуниавируса». Американский журнал тропической медицины и гигиены. 96 (5): 16–0672. Дои:10.4269 / ajtmh.16-0672. ISSN  0002-9637. ЧВК  5417190. PMID  28167595.
  19. ^ Nachrichten, n-tv. "Unbekanntes Virus entdeckt". n-tv.de. Получено 20 декабря 2018.
  20. ^ Эдридж А.В., Дейс М., Намаззи Р., Кристелла С., Джеббинк М.Ф., Маурер И. и др. (Январь 2019). «Новый ортобуниавирус, обнаруженный в спинномозговой жидкости ребенка из Уганды с тяжелой энцефалопатией». Клинические инфекционные болезни. 68 (1): 139–142. Дои:10.1093 / cid / ciy486. ЧВК  6293039. PMID  29893821.

внешняя ссылка