PDCD4 - PDCD4

PDCD4
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2KZT, 2GGF, 2RG8, 2ZU6, 3EIJ
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD4, H731, запрограммированная гибель клеток 4 (ингибитор неопластической трансформации), запрограммированная гибель клеток 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 608610 MGI: 107490 ГомолоГен: 7879 Генные карты: PDCD4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 10 (человек)
Конец	110,900,006 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	53,929,860 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • цитозоль; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• клеточное старение; • регуляция белкового обмена; • отрицательная регуляция клеточного цикла; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция активности киназы JUN; • положительная регуляция процесса апоптоза гладкомышечных клеток; • отрицательная регуляция дифференцировки миофибробластов; • апоптотический процесс; • положительная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток; • BMP сигнальный путь; • эпителиально-мезенхимальный переход, участвующий в развитии сердечных фибробластов; • отрицательная регуляция дифференцировки клеток гладких мышц сосудов; • положительная регуляция воспалительного ответа; • клеточный ответ на липополисахарид; • негативная регуляция производства цитокинов, участвующих в воспалительной реакции; • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB; • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12; • отрицательная регуляция пролиферации клеток гладких мышц сосудов; • положительная регуляция процесса апоптоза гладкомышечных клеток, ассоциированных с сосудом;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	27250
	18569
	ENSG00000150593
	ENSMUSG00000024975
	Q53EL6; Q5VZS7
	Q61823
	NM_145341; NM_001199492; NM_014456
	NM_001168491; NM_001168492; NM_011050
	NP_001186421; NP_055271; NP_663314
	NP_001161963; NP_001161964; NP_035180
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок запрограммированной гибели клеток 4 это белок что у людей кодируется PDCD4 ген.^[5]^[6] Это одна из целей онкомира, МИРН21.^[7]

Функция

Этот ген кодирует белок, расположенный в ядре пролиферирующих клеток. Экспрессия этого гена регулируется цитокинами в естественных киллерах и Т-клетках. Предполагается, что генный продукт играет роль в апоптозе, но конкретная роль еще не определена. Идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

PDCD4 показал себя взаимодействовать с участием RPS13^[8] , Рибосомный белок L5.^[8], p62, LC3 и убиквитин [9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000150593 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024975 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Аззони Л., Зацепина О., Абебе Б., Беннет И.М., Канакарадж П., Перуссия Б. (1998). «Дифференциальная регуляция транскрипции CD161 и нового гена 197 / 15a с помощью IL-2, IL-15 и IL-12 в NK и Т-клетках». Журнал иммунологии. 161 (7): 3493–500. PMID 9759869.
^ ^а ^б EntrezGene 27250
^ Франкель Л. Б., Кристофферсен Н. Р., Якобсен А., Линдоу М., Крог А., Лунд А. Х. (2008). «Запрограммированная гибель клеток 4 (PDCD4) является важной функциональной мишенью микроРНК miR-21 в клетках рака груди». Журнал биологической химии. 283 (2): 1026–33. Дои:10.1074 / jbc.M707224200. PMID 17991735.
^ ^а ^б Кан MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 293 (1): 617–21. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.

9. Manirujjaman M, Ozaki I., Murata Y, Guo J, Xia J, Nishioka K, Perveen R, Takahashi H, Anzai K, Matsuhashi S (2020). «Деградация опухолевого супрессора PDCD4 нарушается подавлением p62 / SQSTM1 и аутофагией». Ячейки. 9 (1): 218. doi.org/10.3390/cells9010218.

дальнейшее чтение

Гёке Р., Грегель С., Гёке А., Арнольд Р., Шмидт Х., Ланкат-Буттгерайт Б. (2004). «Белок запрограммированной гибели клеток 4 (PDCD4) действует как опухолевый супрессор в нейроэндокринных опухолевых клетках». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1014: 220–1. Дои:10.1196 / летопись.1294.024. PMID 15153438. S2CID 9284462.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Шибахара К., Асано М., Исида Ю., Аоки Т., Коике Т., Хондзё Т. (1995). «Выделение нового мышиного гена МА-3, который индуцируется запрограммированной гибелью клеток». Ген. 166 (2): 297–301. Дои:10.1016/0378-1119(95)00607-9. PMID 8543179.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной полной длиной и обогащенной 5'-концом». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Ёсинага Х., Мацухаши С., Фудзияма С., Масаки З. (1999). «Новый ген PDCD4 (H731) человека, экспрессируемый в пролиферативных клетках, экспрессируется в эпителиальных клетках малых протоков молочной железы, что выявлено с помощью антитела против H731». Патология Интернэшнл. 49 (12): 1067–77. Дои:10.1046 / j.1440-1827.1999.00995.x. PMID 10632927. S2CID 968499.
Soejima, H .; Miyoshi, O .; Yoshinaga, H .; Масаки, З .; Ozaki, I .; Kajiwara, S .; Niikawa, N .; Matsuhashi, S .; Мукаи, Т. (1999). "Назначение¹ гена запрограммированной гибели клеток 4 (PDCD4) в полосу хромосомы человека 10q24 путем гибридизации in situ ». Цитогенетические и геномные исследования. 87 (1–2): 113–4. Дои:10.1159/000015408. PMID 10640828. S2CID 34560093.
Кан MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 293 (1): 617–21. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.
Чен Ю., Кнёзель Т., Кристиансен Г., Пиетас А., Гарбер М.Э., Мацухаши С., Одзаки И., Петерсен И. (2003). «Потеря экспрессии PDCD4 при раке легких человека коррелирует с прогрессированием опухоли и прогнозом». Журнал патологии. 200 (5): 640–6. Дои:10.1002 / path.1378. PMID 12898601. S2CID 25899458.
Ян Х.С., Чо М.Х., Закович Х., Хегамиер Г., Зоненберг Н., Колберн Н.Х. (2004). «Новая функция доменов MA-3 в супрессоре трансформации и трансляции Pdcd4 имеет важное значение для его связывания с фактором инициации трансляции эукариот 4A». Молекулярная и клеточная биология. 24 (9): 3894–906. Дои:10.1128 / MCB.24.9.3894-3906.2004. ЧВК 387765. PMID 15082783.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Гёке Р., Барт П., Шмидт А., Саманс Б., Ланкат-Буттгерайт Б. (2004). «Белок 4 запрограммированной гибели клеток подавляет CDK1 / cdc2 посредством индукции p21Waf1 / Cip1». AJP: Клеточная физиология. 287 (6): C1541–6. Дои:10.1152 / ajpcell.00025.2004. PMID 15317660.
Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2004). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д. и др. (2005). «К протеомной карте сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Паламарчук А., Ефанов А., Максимов В., Акейлан Р. И., Кроче С. М., Пекарский Ю. (2005). «Akt фосфорилирует и регулирует белок-супрессор опухоли Pdcd4». Исследования рака. 65 (24): 11282–6. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-3469. PMID 16357133.
Ян Х.С., Мэтьюз С.П., Клер Т., Ван Кью, Бейкер А.Р., Ли СС, Тан ТХ, Колберн Н.Х. (2006). «Супрессор опухолевого процесса Pdcd4 подавляет экспрессию митоген-активированной протеинкиназы, киназы, киназы, киназы 1, для подавления инвазии клеток карциномы толстой кишки». Молекулярная и клеточная биология. 26 (4): 1297–306. Дои:10.1128 / MCB.26.4.1297-1306.2006. ЧВК 1367180. PMID 16449643.

Эта статья о ген на хромосома человека 10 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000150593 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024975 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9759869-5] Аззони Л., Зацепина О., Абебе Б., Беннет И.М., Канакарадж П., Перуссия Б. (1998). «Дифференциальная регуляция транскрипции CD161 и нового гена 197 / 15a с помощью IL-2, IL-15 и IL-12 в NK и Т-клетках». Журнал иммунологии. 161 (7): 3493–500. PMID 9759869.

[entrez-6] а ^б EntrezGene 27250

[7] Франкель Л. Б., Кристофферсен Н. Р., Якобсен А., Линдоу М., Крог А., Лунд А. Х. (2008). «Запрограммированная гибель клеток 4 (PDCD4) является важной функциональной мишенью микроРНК miR-21 в клетках рака груди». Журнал биологической химии. 283 (2): 1026–33. Дои:10.1074 / jbc.M707224200. PMID 17991735.

[pmid12054647-8] а ^б Кан MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 293 (1): 617–21. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]