PPP3R1 - PPP3R1

PPP3R1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1AUI, 1М63, 1MF8, 2П6Б, 3LL8, 4F0Z, 4OR9, 4ORA, 4ORC, 4ORB
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP3R1, CALNB1, CNB, CNB1, регуляторная субъединица B протеинфосфатазы 3, альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 601302 MGI: 107172 ГомолоГен: 68099 Генные карты: PPP3R1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	68,256,237 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	17,200,375 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов кальция; • специфическое связывание белкового домена; • связывание ионов металлов; • связывание кальмодулина; • GO: 0001948 связывание с белками; • кальций-зависимая активность протеин-серин / треонинфосфатазы; • связывание циклоспорина А; • фосфопротеинфосфатазная активность; • связывание фосфатазы;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • мембрана; • клеточная мембрана; • нуклеоплазма; • сарколемма; • кальциневриновый комплекс; • митохондрия;
Биологический процесс	• Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • дефосфорилирование белков; • Сигнальный путь Wnt, путь модуляции кальция; • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов; • эпителиально-мезенхимальный переход; • развитие сердца; • Развитие шванновских клеток; • миелинизация периферической нервной системы; • сигнальный каскад кальциневрин-NFAT; • локализация белка в ядре; • дифференцировка эпителиальных клеток легких; • импорт белка в ядро; • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5534
	19058
	ENSG00000221823
	ENSMUSG00000033953
	P63098
	Q63810
	NM_000945
	NM_024459
	NP_000936
	NP_077779
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица B кальциневрина типа 1 также известен как регуляторная субъединица 1 протеинфосфатазы 2B это белок что у людей кодируется PPP3R1 ген.^[5]^[6]^[7]

Клиническое значение

Наличие однонуклеотидный полиморфизм rs1868402 в PPP3R1 ген сильно коррелирует с быстрым прогрессом Болезнь Альцгеймера.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000221823 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033953 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Ван М.Г., Йи Х., Герини Д., Кли CB, МакБрайд О.В. (январь 1997 г.). «Кальциневрин А альфа (PPP3CA), кальциневрин А бета (PPP3CB) и кальциневрин B (PPP3R1) расположены на хромосомах человека 4, 10q21 → q22 и 2p16 → p15 соответственно». Cytogenet Cell Genet. 72 (2–3): 236–41. Дои:10.1159/000134198. PMID 8978785.
^ Guerini D, Krinks MH, Sikela JM, Hahn WE, Klee CB (март 1990 г.). «Выделение и последовательность клона кДНК кальциневрина B человека, Са2 + -связывающей субъединицы Са2 + / кальмодулин-стимулированной протеинфосфатазы». ДНК. 8 (9): 675–82. Дои:10.1089 / dna.1.1989.8.675. PMID 2558868.
^ «Ген Entrez: протеинфосфатаза 3 PPP3R1 (ранее 2B), регуляторная субъединица B, альфа-изоформа».
^ Cruchaga C, Kauwe JS, Mayo K, Spiegel N, Bertelsen S и др. (2010). Майерс AJ (ред.). "SNP, связанные с уровнями фосфо-тау в спинномозговой жидкости, влияют на скорость снижения при болезни Альцгеймера". PLOS Genet. 6 (9): e1001101. Дои:10.1371 / journal.pgen.1001101. ЧВК 2940763. PMID 20862329.

дальнейшее чтение

Кавамура А., Су М.С. (1995). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином A в домене связывания субъединицы B». J. Biol. Chem. 270 (26): 15463–6. Дои:10.1074 / jbc.270.26.15463. PMID 7541044.
Киссинджер CR, Parge HE, Knighton DR и др. (1996). «Кристаллические структуры человеческого кальциневрина и человеческого комплекса FKBP12-FK506-кальциневрин». Природа. 378 (6557): 641–4. Дои:10.1038 / 378641a0. PMID 8524402. S2CID 4337105.
Фэн Б., Стеммер П.М. (1999). «Взаимодействие кальциневрина А, кальциневрина В и Ca2 +». Биохимия. 38 (38): 12481–9. Дои:10.1021 / bi990492w. PMID 10493818.
Стратакис CA, Тайманс SE (1999). «Структура гена, кодирующего кальциневрин B (PPP3R1), и картирование к D2S358-D2S1778 (хромосомная область 2p15)». ДНК Seq. 9 (4): 227–30. Дои:10.3109/10425179809105209. PMID 10520753.
Нишио Х., Мацуи К., Цуджи Х. и др. (2000). «Иммунолокализация кальциневрина и FKBP12, белка, связывающего FK506, в тельцах Хассалла тимуса и эпидермиса человека». Histochem. Cell Biol. 114 (1): 9–14. Дои:10.1007 / s004180000168. PMID 10959817. S2CID 21530150.
Sokal I, Li N, Verlinde CL, et al. (2001). «Са (2 +) - связывающие белки в сетчатке: от открытия до этиологии заболевания человека (1)». Биохим. Биофиз. Acta. 1498 (2–3): 233–51. Дои:10.1016 / S0167-4889 (00) 00099-9. PMID 11108966.
Graef IA, Chen F., Chen L, et al. (2001). «Сигналы, передаваемые Ca (2 +) / кальциневрин и NFATc3 / c4, формируют развивающуюся сосудистую сеть». Ячейка. 105 (7): 863–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00396-8. PMID 11439183. S2CID 5278706.
Аль-Дараджи В.И., Грант К.Р., Райан К. и др. (2002). «Локализация кальциневрина / NFAT в коже человека и псориаза и ингибирование активации кальциневрина / NFAT в кератиноцитах человека циклоспорином А». J. Invest. Дерматол. 118 (5): 779–88. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2002.01709.x. PMID 11982754.
Хуай Кью, Ким Х.Й., Лю И и др. (2002). «Кристаллическая структура кальциневрин-циклофилин-циклоспорин показывает общее, но отчетливое распознавание комплексов иммунофилин-лекарственное средство». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (19): 12037–42. Дои:10.1073 / pnas.192206699. ЧВК 129394. PMID 12218175.
Джин Л., Харрисон SC (2002). «Кристаллическая структура человеческого кальциневрина в комплексе с циклоспорином А и человеческим циклофилином». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (21): 13522–6. Дои:10.1073 / pnas.212504399. ЧВК 129706. PMID 12357034.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Беннасер Y, Баду А., Ткачук Дж., Бахрауи Э. (2003). «Сигнальные пути, запускаемые Tat ВИЧ-1 в человеческих моноцитах для индукции TNF-альфа». Вирусология. 303 (1): 174–80. Дои:10.1006 / viro.2002.1676. PMID 12482669.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Биттингер М.А., Маквинни Э., Мельцер Дж. И др. (2005). «Активация экспрессии гена, опосредованной элементом ответа цАМФ, регулируемым ядерным транспортом белков TORC». Curr. Биол. 14 (23): 2156–61. Дои:10.1016 / j.cub.2004.11.002. PMID 15589160. S2CID 5934014.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID 15815621.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Уинслоу М.М., Галло Е.М., Нейлсон Дж. Р., Крэбтри Г. Р. (2006). «Комплекс кальциневринфосфатазы модулирует иммуногенные В-клеточные ответы». Иммунитет. 24 (2): 141–52. Дои:10.1016 / j.immuni.2005.12.013. PMID 16473827.
Лю Кью, Уилкинс Б.Дж., Ли Ю.Дж. и др. (2006). «Прямое взаимодействие и реципрокная регуляция между ASK1 и кальциневрин-NFAT контролируют гибель и рост кардиомиоцитов». Мол. Cell. Биол. 26 (10): 3785–97. Дои:10.1128 / MCB.26.10.3785-3797.2006. ЧВК 1489013. PMID 16648474.

Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000221823 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033953 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8978785-5] Ван М.Г., Йи Х., Герини Д., Кли CB, МакБрайд О.В. (январь 1997 г.). «Кальциневрин А альфа (PPP3CA), кальциневрин А бета (PPP3CB) и кальциневрин B (PPP3R1) расположены на хромосомах человека 4, 10q21 → q22 и 2p16 → p15 соответственно». Cytogenet Cell Genet. 72 (2–3): 236–41. Дои:10.1159/000134198. PMID 8978785.

[pmid2558868-6] Guerini D, Krinks MH, Sikela JM, Hahn WE, Klee CB (март 1990 г.). «Выделение и последовательность клона кДНК кальциневрина B человека, Са2 + -связывающей субъединицы Са2 + / кальмодулин-стимулированной протеинфосфатазы». ДНК. 8 (9): 675–82. Дои:10.1089 / dna.1.1989.8.675. PMID 2558868.

[entrez-7] «Ген Entrez: протеинфосфатаза 3 PPP3R1 (ранее 2B), регуляторная субъединица B, альфа-изоформа».

[Cruchaga_2010-8] Cruchaga C, Kauwe JS, Mayo K, Spiegel N, Bertelsen S и др. (2010). Майерс AJ (ред.). "SNP, связанные с уровнями фосфо-тау в спинномозговой жидкости, влияют на скорость снижения при болезни Альцгеймера". PLOS Genet. 6 (9): e1001101. Дои:10.1371 / journal.pgen.1001101. ЧВК 2940763. PMID 20862329.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]