RTN1 - RTN1

RTN1
Идентификаторы
ПсевдонимыRTN1, НСП, ретикулон 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600865 MGI: 1933947 ГомолоГен: 49654 Генные карты: RTN1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение RTN1
Геномное расположение RTN1
Группа14q23.1Начните59,595,976 бп[1]
Конец59,870,776 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RTN1 210222 s в формате fs.png

PBB GE RTN1 203485 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

6252

104001

Ансамбль

ENSG00000139970

ENSMUSG00000021087

UniProt

Q16799

Q8K0T0

RefSeq (мРНК)

NM_001243115
NM_021136
NM_206852
NM_206857
NM_001363702

NM_001007596
NM_001286448
NM_153457

RefSeq (белок)

NP_066959
NP_996734
NP_001350631

NP_001007597
NP_001273377
NP_703187

Расположение (UCSC)Chr 14: 59,6 - 59,87 МбChr 12: 72.21 - 72.41 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ретикулон-1 также известен как нейроэндокринно-специфический белок (NSP) - это белок что у людей кодируется RTN1 ген.[5][6]

Этот ген принадлежит к семейству сетка -кодирующие гены. Ретикулоны связаны с эндоплазматический ретикулум, и участвуют в нейроэндокринной секреции или в мембранном переносе нейроэндокринных клеток. Альтернативно сращивание Были идентифицированы варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. По-видимому, в это разнообразие вовлечены множественные промоторы, а не альтернативный сплайсинг внутренних экзонов.[6]

Взаимодействия

RTN1 был показан взаимодействовать с участием BCL2-подобный 1[7] и UGCG.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000139970 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021087 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Kools PF, Roebroek AJ, Van de Velde HJ, Marynen P, Bullerdiek J, Van de Ven WJ (февраль 1994 г.). «Региональное картирование гена NSP человека в хромосомной области 14q21 → q22 с помощью флуоресцентного анализа гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 66 (1): 48–50. Дои:10.1159/000133662. PMID  8275708.
  6. ^ а б "Entrez Gene: RTN1 ретикулон 1".
  7. ^ Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (ноябрь 2000 г.). «Новый белок, RTN-XS, взаимодействует как с Bcl-XL, так и с Bcl-2 в эндоплазматическом ретикулуме и снижает их антиапоптотическую активность». Онкоген. 19 (50): 5736–46. Дои:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.
  8. ^ Ди Сано Ф., Фази Б., Ситро Дж., Ловат П. Е., Чезарени Дж., Пьячентини М. (июль 2003 г.). «Глюкозилцерамидсинтаза и ее функциональное взаимодействие с RTN-1C регулируют химиотерапевтический апоптоз в клетках нейроэпителиомы». Рак Res. 63 (14): 3860–5. PMID  12873973.

дальнейшее чтение

  • Зенден Н.Х., ван де Велде Х. Дж., Броерс Дж. Л., Тиммер Э. Д., Робрук А. Дж., Ван де Вен В. Дж., Рамакерс ФК (1994). «Антитела против рака легких Cluster-10 распознают NSP, новые нейроэндокринные белки, связанные с мембранами эндоплазматического ретикулума». Int. J. Cancer Suppl. 8: 84–8. Дои:10.1002 / ijc.2910570718. PMID  7515034.
  • Робрук AJ, ван де Велде HJ, Ван Боховен A, Broers JL, Ramaekers FC, Ван де Вен WJ (1993). «Клонирование и экспрессия альтернативных транскриптов нового нейроэндокринного специфического гена и идентификация его продукта трансляции 135 кДа». J. Biol. Chem. 268 (18): 13439–47. PMID  7685762.
  • ван де Вельде Х.Дж., Робрук А.Дж., Сенден Н.Х., Рамакерс ФК, Ван де Вен WJ (1995). «NSP-кодируемые ретикулоны, нейроэндокринные белки нового семейства генов, связанных с мембранами эндоплазматического ретикулума». J. Cell Sci. 107 (9): 2403–16. PMID  7844160.
  • ван де Вельде Х. Дж., Сенден Н. Х., Роскамс Т. А., Броерс Дж. Л., Рамаекерс ФК, Робрук А. Дж., Ван де Вен В. Дж. (1994). «Ретикулоны, кодируемые NSP, являются нейроэндокринными маркерами новой категории в диагностике рака легких человека». Рак Res. 54 (17): 4769–76. PMID  8062278.
  • Робрук А.Дж., Аюби Т.А., Ван де Велде Х.Дж., Шонмакерс Э.Ф., Паули И.Г., Ван де Вен WJ (1997). «Геномная организация человеческого гена NSP, прототип нового семейства генов, кодирующих ретикулоны». Геномика. 32 (2): 191–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0105. PMID  8833145.
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
  • Зенден Н.Х., Тиммер Э.Д., Бурс Дж. Э., ван де Вельде Х. Дж., Робрук А. Дж., Ван де Вен В. Дж., Броерс Дж. Л., Рамаекерс ФК (1996). «Нейроэндокрин-специфический протеин C (NSP-C): субклеточная локализация и дифференциальная экспрессия по отношению к NSP-A». Евро. J. Cell Biol. 69 (3): 197–213. PMID  8900485.
  • Хенс Дж., Нюйденс Р., Гиртс Х., Сенден Н.Х., Ван де Вен В.Дж., Робрук А.Дж., ван де Велде Х.Дж., Рамакерс ФК, Броерс Дж.Л. «Дифференцировка нейронов сопровождается экспрессией NSP-C». Клеточная ткань Res. 292 (2): 229–37. Дои:10.1007 / s004410051054. PMID  9560466.
  • Тагами С., Эгути Ю., Киношита М., Такеда М., Цудзимото Ю. (2001). «Новый белок, RTN-XS, взаимодействует как с Bcl-XL, так и с Bcl-2 в эндоплазматическом ретикулуме и снижает их антиапоптотическую активность». Онкоген. 19 (50): 5736–46. Дои:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.
  • Oertle T, Klinger M, Stuermer CA, Schwab ME (2003). «Ретикулярная рапсодия: филогенетическая эволюция и номенклатура генного семейства RTN / Nogo». FASEB J. 17 (10): 1238–47. CiteSeerX  10.1.1.124.969. Дои:10.1096 / fj.02-1166hyp. PMID  12832288.
  • Ди Сано Ф., Фази Б., Ситро Дж., Ловат ПЭ, Чезарени Дж., Пьячентини М. (2003). «Глюкозилцерамидсинтаза и ее функциональное взаимодействие с RTN-1C регулируют химиотерапевтический апоптоз в клетках нейроэпителиомы». Рак Res. 63 (14): 3860–5. PMID  12873973.
  • Ивахаси Дж., Хамада Н. (2004). «Человеческие ретикулоны 1-A и 1-B взаимодействуют со средней цепью адапторного комплекса AP-2». Cell. Мол. Биол. (Шумный-ле-гран). 49 Интернет-паб: OL467–71. PMID  14995077.
  • Ху Y, Фанг X, Данхэм С.М., Prada C, Stachowiak EK, Stachowiak MK (2004). «Рибосомная киназа S6 массой 90 кДа является прямой мишенью для рецептора ядерного фактора роста фибробластов 1 (FGFR1): роль в передаче сигналов FGFR1». J. Biol. Chem. 279 (28): 29325–35. Дои:10.1074 / jbc.M311144200. PMID  15117958.
  • He W, Lu Y, Qahwash I, Hu XY, Chang A, Yan R (2004). «Члены семейства ретикулонов модулируют активность BACE1 и образование пептида бета-амилоида». Nat. Med. 10 (9): 959–65. Дои:10,1038 / нм 1088. PMID  15286784.
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
  • Маннан А.Ю., Бем Дж., Заутер С.М., Раубер А., Бирн П.С., Нисен Дж., Энгель В. (2007). «Спастин, наиболее часто мутируемый белок при наследственной спастической параплегии, взаимодействует с ретикулоном 1, белком эндоплазматического ретикулума». Нейрогенетика. 7 (2): 93–103. Дои:10.1007 / s10048-006-0034-4. PMID  16602018.