Рибопереключатель SAM-IV - SAM-IV riboswitch

Рибопереключатель S-аденозилметионина (SAM),
ЗУР-IV вторичная структура.jpg
Идентификаторы
СимволЗРК-IV
РфамRF00634 CL00012
Прочие данные
РНК типСнг; рибопереключатель
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

Рибопереключатели SAM-IV своего рода рибопереключатель что конкретно связывает S-аденозилметионин (СЭМ),[1] кофактор, используемый во многих реакциях метилирования. Первоначально идентифицировано биоинформатика,[2] Рибопереключатели SAM-IV в основном ограничены Актиномицеты, порядок Бактерии. Сохраненные особенности рибопереключателя SAM-IV и эксперименты предполагают, что они, вероятно, имеют общий сайт связывания SAM с другим классом рибопереключателей SAM-IV, называемым Рибопереключатели SAM-I. Однако каркасы этих двух типов рибопереключателей выглядят совершенно разными.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Регульски Э., Хаммонд М.С. и др. (2008). «Ядро аптамера рибопереключателей SAM-IV имитирует сайт связывания лиганда рибопереключателей SAM-I». РНК. 14 (5): 822–828. Дои:10.1261 / rna.988608. ЧВК  2327355. PMID  18369181.
  2. ^ Вайнберг З., Баррик Дж. Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 кандидатных структурированных РНК в бактериях с использованием системы сравнительной геномики CMfinder». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (14): 4809–4819. Дои:10.1093 / нар / гкм487. ЧВК  1950547. PMID  17621584.

внешняя ссылка