Белок SecY - Википедия - SecY protein

Белок SecY / Sec61α
PDB 1rh5 EBI.jpg
Строение белок-проводящего канала.[1]
Идентификаторы
СимволSecY
PfamPF00344
ИнтерПроIPR002208
PROSITEPDOC00612
SCOP21rh5 / Объем / СУПФАМ
TCDB3.A.5
OPM суперсемейство19
Белок OPM1rh5
Мембранома165

В SecY белок это главный трансмембранный субъединица бактериального Sec или типа II секреторный путь и белок-секретирующая АТФаза комплекс, также известный как SecYEG Translocon. Гомологи комплекса SecYEG обнаружены в эукариоты, где субъединица известна как Sec61α, а у архей.[2]

Секреция некоторых белков, несущих сигнальный пептид через внутренняя мембрана в Грамотрицательные бактерии происходит через путь препротеин-транслоказ. Белки продуцируются в цитоплазме в качестве предшественников, и им требуется шаперонная субъединица, чтобы направлять их к компоненту транслоказы внутри мембраны.[3] Оттуда зрелые белки либо направляются на внешнюю мембрану, либо остаются в виде периплазматических белков. Белковые субъединицы транслоказы кодируются на бактериальной хромосоме.

Путь транслоказы включает 7 белков, в том числе шаперонный белок (SecB ), АТФаза (SecA ), интегральный мембранный комплекс (SecY, SecE и SecG) и два дополнительных мембранных белка, которые способствуют высвобождению зрелого пептида в периплазму (SecD и SecF).[3] Белок-шаперон SecB[4] представляет собой высококислотный гомотетрамерный белок, существующий в виде «димера димеров» в бактериальной цитоплазме. SecB поддерживает препротеины в развернутом состоянии после трансляции и направляет их на периферический мембранный белок АТФазу SecA для секреции.[5] Структура сборки SecYEG Escherichia coli выявила сэндвич из двух мембран, взаимодействующих через обширные цитоплазматические домены.[6] Каждая мембрана состоит из димеров SecYEG. Мономерный комплекс содержит 15 трансмембранных спиралей.

Белок SecY эубактерий взаимодействует с сигнальными последовательностями секреторных белков, а также с двумя другими компонентами системы транслокации белков: SecA и SecE. SecY является интегральным белком плазматической мембраны, состоящим из 419–492 аминокислотных остатков, который, по-видимому, содержит 10 трансмембранных (TM), 6 цитоплазматических и 5 периплазматических областей.[7]

Цитоплазматические области 2 и 3, а также TM-домены 1, 2, 4, 5, 7 и 10 хорошо консервативны: консервативные цитоплазматические области, как полагают, взаимодействуют с факторами цитоплазматической секреции, в то время как TM-домены могут участвовать в экспорте белка.[8] SecY также кодируется в геноме хлоропластов некоторых водорослей, где он может участвовать в системе экспорта белка, подобной прокариотам, через две мембраны эндоплазматического ретикулума хлоропластов (CER), который присутствует в хромофитных и криптофитных водорослях.[9]

Подсемейства

Белки человека, содержащие этот домен

SEC61A1; SEC61A2;

Рекомендации

  1. ^ Ван ден Берг Б., Клемонс В. М., Коллинсон И., Модис Ю., Хартманн Е., Харрисон С. К., Рапопорт Т. А. (январь 2004 г.). «Рентгеновское строение белок-проводящего канала». Природа. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004Натура 427 ... 36Б. Дои:10.1038 / природа02218. PMID  14661030. S2CID  4360143.
  2. ^ Ауэр Дж., Спикер Дж., Бёк А. (июнь 1991 г.). «Присутствие в архебактериях Methanococcus vannielii гена, гомологичного secY эубактерий». Биохимия. 73 (6): 683–8. Дои:10.1016/0300-9084(91)90048-6. PMID  1764515.
  3. ^ а б Бикер К.Л., Филлипс Г.Дж., Силхави Т.Дж. (июнь 1990 г.). «Гены sec и prl Escherichia coli». Журнал биоэнергетики и биомембран. 22 (3): 291–310. Дои:10.1007 / BF00763169. PMID  2202721. S2CID  10694864.
  4. ^ Дриссен AJ (май 2001 г.). «SecB, молекулярный шаперон с двумя лицами» (PDF). Тенденции в микробиологии. 9 (5): 193–6. Дои:10.1016 / S0966-842X (01) 01980-1. PMID  11336818.
  5. ^ Мюллер JP (июль 1999 г.). «Влияние сверхэкспрессии пре-белков на синтез SecB в Escherichia coli». Письма о микробиологии FEMS. 176 (1): 219–27. Дои:10.1016 / s0378-1097 (99) 00239-6. PMID  10418149.
  6. ^ Брейтон К., Хааз В., Рапопорт Т.А., Кюльбрандт В., Коллинсон И. (август 2002 г.). «Трехмерная структура бактериального комплекса транслокации белков SecYEG». Природа. 418 (6898): 662–5. Bibcode:2002Натура.418..662Б. Дои:10.1038 / природа00827. PMID  12167867. S2CID  4347664.
  7. ^ Ито К. (сентябрь 1992 г.). «SecY и интегральные мембранные компоненты системы транслокации белков Escherichia coli». Молекулярная микробиология. 6 (17): 2423–8. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x. PMID  1406280. S2CID  37452721.
  8. ^ Сух Дж. У., Бойлан С. А., Томас С. М., Долан К. М., Оливер Д. Б., Прайс CW (февраль 1990 г.). «Выделение гомолога secY из Bacillus subtilis: свидетельство общего пути экспорта белка в эубактериях». Молекулярная микробиология. 4 (2): 305–14. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1990.tb00597.x. PMID  2110998. S2CID  27373166.
  9. ^ Дуглас С.Е. (февраль 1992 г.). «Гомолог secY обнаружен в пластидном геноме Cryptomonas phi». Письма FEBS. 298 (1): 93–6. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 80029-G. PMID  1544427. S2CID  22351990.