TNFAIP3 - TNFAIP3

TNFAIP3
Белок TNFAIP3 PDB 2EQE.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTNFAIP3, A20, OTUD7C, TNFA1P2, AISBL, TNF альфа-индуцированный белок 3
Внешние идентификаторыOMIM: 191163 MGI: 1196377 ГомолоГен: 4582 Генные карты: TNFAIP3
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TNFAIP3
Геномное расположение TNFAIP3
Группа6q23.3Начните137,867,214 бп[1]
Конец137,883,312 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TNFAIP3 202644 s в формате fs.png

PBB GE TNFAIP3 202643 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001270507
NM_001270508
NM_006290

NM_001166402
NM_009397

RefSeq (белок)

NP_001257436
NP_001257437
NP_006281

NP_001159874
NP_033423

Расположение (UCSC)Chr 6: 137,87 - 137,88 МбChr 10:19 - 19.02 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор некроза опухоли, альфа-индуцированный белок 3 или A20 это белок что у людей кодируется TNFAIP3 ген.[5][6]

Этот ген был идентифицирован как ген, экспрессия которого быстро индуцируется фактором некроза опухоли (TNF). Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок цинковых пальцев и деубиквитинирующий фермент, и было показано, что он подавляет NF-каппа B активация, а также TNF-опосредованная апоптоз. Белок A20 - древний, а белок гомолог можно найти еще в книдария (кораллы, медуза, анемоны ) с сохраненным белковый домен сочинение. [7] Использование нокаутных мышиных моделей TNFAIP3 и его репрессора транскрипции (т.е. КЧИП3 ), TNFAIP3, как было показано, имеет решающее значение для ограничения воспаления за счет прекращения индуцированных эндотоксином и TNF ответов NF-каппа B.[8][9] Вкратце, было показано, что функция деубиквитиназы TNFAIP3 удаляет убиквитиновые цепи из VE-кадгерин для предотвращения потери VE-кадгерина в эндотелиальном прилипает к стыкам. [8]

Взаимодействия

TNFAIP3 был показан взаимодействовать с участием TNIP1,[10] TRAF1,[11][12] TRAF2,[11] ИКБКГ,[13] TAX1BP1,[14] YWHAB,[15] YWHAZ,[15][16] TRAF6[12][17] и YWHAH.[15][16]

Связь с ревматоидным артритом

Локус TNFAIP3 участвует в качестве положительно ассоциированного фактора в ревматоидный артрит (РА). RS5029937 (T) и RS6920220 (A) SNP увеличивают риск РА от 20 до 40% соответственно.[18] Третий SNP, rs10499194 (T), встречается реже при ревматоидном артрите, но эта отрицательная связь может не иметь статистической значимости.

Прочие болезни

Сообщалось также о связи с младенческим началом неизлечимого воспалительного заболевания кишечника.[19]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118503 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019850 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Opipari AW Jr; Богуски М.С.; Диксит В.М. (октябрь 1990 г.). «КДНК А20, индуцированная фактором некроза опухоли альфа, кодирует новый тип белка цинкового пальца». J Biol Chem. 265 (25): 14705–8. PMID  2118515.
  6. ^ «Ген Entrez: фактор некроза опухоли TNFAIP3, альфа-индуцированный белок 3».
  7. ^ Стаал Дж., Дриеж Й., Хэгман М., Борги А., Хюльпио П., Ливенс Л. и др. (2018). «Древнее происхождение CARD-Coiled Coil / Bcl10 / MALT1-подобного сигнального комплекса паракаспаза указывает на неизвестные критические функции». Границы иммунологии. 9: 1136. Дои:10.3389 / fimmu.2018.01136. ЧВК  5978004. PMID  29881386.
  8. ^ а б Soni D, Wang DM, Regmi SC, Mittal M, Vogel SM, Schlüter D, Tiruppathi C (май 2018 г.). «Деубиквитиназная функция A20 поддерживает и восстанавливает эндотелиальный барьер после повреждения сосудов легких». Открытие смерти клетки. 4 (60). Дои:10.1038 / s41420-018-0056-3. ЧВК  5955943. PMID  29796309.
  9. ^ Тируппати С., Сони Д., Ван Д.М. и др. (Март 2014 г.). «Фактор транскрипции DREAM подавляет A20 и опосредует воспаление». Нат Иммунол. 15 (3): 239–247. Дои:10.1038 / ni.2823. ЧВК  4005385. PMID  24487321.
  10. ^ Хайнинк, К; Де Валк Д; Vanden Berghe W; Ван Крикинг В; Contreras R; Fiers W; Haegeman G; Бейерт Р. (июнь 1999 г.). «Белок цинкового пальца A20 ингибирует TNF-индуцированную экспрессию NF-kappaB-зависимого гена путем вмешательства в сигнал трансактивации, опосредованный RIP или TRAF2, и напрямую связывается с новым ингибирующим NF-kappaB белком ABIN». J. Cell Biol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 145 (7): 1471–82. Дои:10.1083 / jcb.145.7.1471. ISSN  0021-9525. ЧВК  2133159. PMID  10385526.
  11. ^ а б Песня, H Y; Rothe M; Геддел Д. В. (июнь 1996 г.). «Белок цинкового пальца A20, индуцируемый фактором некроза опухоли, взаимодействует с TRAF1 / TRAF2 и ингибирует активацию NF-kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 93 (13): 6721–5. Bibcode:1996PNAS ... 93.6721S. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6721. ISSN  0027-8424. ЧВК  39093. PMID  8692885.
  12. ^ а б Хайнинк, К; Бейерт Р. (январь 1999 г.). «Цитокин-индуцируемый белок цинкового пальца А20 ингибирует индуцированную IL-1 активацию NF-kappaB на уровне TRAF6». FEBS Lett. НИДЕРЛАНДЫ. 442 (2–3): 147–50. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01645-7. ISSN  0014-5793. PMID  9928991. S2CID  19072203.
  13. ^ Zhang, S Q; Коваленко А; Cantarella G; Уоллах Д. (март 2000 г.). «Рекрутирование сигнаносомы IKK на рецептор TNF p55: RIP и A20 связываются с NEMO (IKKgamma) при стимуляции рецептора». Иммунитет. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 12 (3): 301–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80183-1. ISSN  1074-7613. PMID  10755617.
  14. ^ Де Валк, Д. Jin D Y; Heyninck K; Ван де Краен М; Contreras R; Fiers W; Jeang K T; Beyaert R (июль 1999 г.). «Белок цинкового пальца А20 взаимодействует с новым антиапоптотическим белком, который расщепляется специфическими каспазами». Онкоген. АНГЛИЯ. 18 (29): 4182–90. Дои:10.1038 / sj.onc.1202787. ISSN  0950-9232. PMID  10435631.
  15. ^ а б c Винченц, К; Диксит В. М. (август 1996 г.). «Белки 14-3-3 связываются с А20 специфическим для изоформы образом и действуют как шапероны и как адаптерные молекулы». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 271 (33): 20029–34. Дои:10.1074 / jbc.271.33.20029. ISSN  0021-9258. PMID  8702721.
  16. ^ а б Де Валк, Д. Heyninck K; Ван Крикинг В; Vandenabeele P; Fiers W; Бейерт Р. (сентябрь 1997 г.). «A20 ингибирует активацию NF-kappaB независимо от связывания с белками 14-3-3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 238 (2): 590–4. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7343. ISSN  0006-291X. PMID  9299557.
  17. ^ Evans, P.C; Тейлор Э. Р.; Coadwell J; Heyninck K; Beyaert R; Килшоу П. Дж. (Август 2001 г.). «Выделение и характеристика двух новых A20-подобных белков». Biochem. J. Англия. 357 (Пт 3): 617–23. Дои:10.1042/0264-6021:3570617. ISSN  0264-6021. ЧВК  1221992. PMID  11463333.
  18. ^ Шталь Э.А., Райчаудхури С., Реммерс Э.Ф. и др. (Июнь 2010 г.). «Полногеномный метаанализ исследования ассоциации выявил семь новых локусов риска ревматоидного артрита». Nat. Genet. 42 (6): 508–14. Дои:10,1038 / нг.582. ЧВК  4243840. PMID  20453842.
  19. ^ Zheng C, Huang Y, Ye Z, Wang Y, Tang Z, Lu J, Wu J, Zhou Y, Wang L, Huang Z, Yang H, Xue A (2018) Неизлечимое воспалительное заболевание кишечника с младенческим началом из-за новых гетерозиготных мутаций в TNFAIP3 (A20). Воспаление кишечника. Dis doi: 10.1093 / ibd / izy165.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P21580 (Белок 3, индуцированный фактором некроза опухоли альфа) на PDBe-KB.