Тахион (программное обеспечение) - Википедия - Tachyon (software)

Тахион
Оригинальный автор (ы)Джон Э. Стоун
Написано вC
Типтрассировка лучей /3D рендеринг программного обеспечения
Интернет сайтджедай.ks.uiuc.edu/ ~ Джонс/ тахион/
Спутниковая молекулярная графика вируса табачной мозаики произведена в VMD и визуализирован с использованием Tachyon. Сцена показана с комбинацией прямого освещения и окружающая окклюзия освещение для улучшения видимости карманов и полостей. Оси VMD показаны как пример визуализации немолекулярной геометрии.
Intel iPSC / 860 32-узловой параллельный компьютер, на котором выполняется тест производительности Tachyon. 22 августа 1995 г.

Тахион это параллельный / многопроцессорный трассировка лучей программного обеспечения. Это библиотека параллельной трассировки лучей для использования на параллельных компьютерах с распределенной памятью, компьютерах с общей памятью и кластерах рабочих станций. Tachyon реализует такие функции рендеринга, как окружающее освещение, размытие фокуса с глубиной резкости, тени, отражения и другие. Первоначально он был разработан для Intel iPSC / 860 Джона Стоуна для его M.S. защитил диссертацию в Университете Миссури-Ролла.[1] Впоследствии Tachyon стал более функциональным и полным движком трассировки лучей, и теперь он включен в ряд других программных пакетов с открытым исходным кодом, таких как VMD, и SageMath. Tachyon выпущен под разрешающей лицензией (включен в архив).

Эволюция и особенности

Тахион изначально был разработан для Intel iPSC / 860, параллельный компьютер с распределенной памятью, основанный на топологии межсоединений гиперкуба на базе Intel i860, раннего RISC-процессора с архитектурой VLIW и. Первоначально Tachyon был написан с использованием проприетарного интерфейса передачи сообщений NX Intel для серии iPSC, но вскоре после этого в 1995 году он был перенесен на самые ранние версии MPI. Tachyon был адаптирован для работы на Intel Paragon платформу с использованием Paragon XP / S 150 МП в Национальной лаборатории Ок-Ридж. ORNL XP / S 150 MP была первой платформой, поддерживаемой Tachyon, которая сочетала в себе передачу крупномасштабных сообщений распределенной памяти между узлами и многопоточность совместно используемой памяти внутри узлов. Затем последовала адаптация Tachyon к множеству традиционных платформ рабочих станций на базе Unix и ранних кластеров, включая перенос на IBM SP2. Тахион был включен в PARAFLOW CFD код, позволяющий проводить объемную визуализацию потоков сверхзвуковой камеры сгорания на Paragon XP / S в Исследовательском центре NASA в Лэнгли, обеспечивая значительный прирост производительности по сравнению с традиционными подходами к визуализации после обработки, которые использовались ранее.[2] Начиная с 1999 года, поддержка Tachyon была включена в программу молекулярной графики. VMD, и это положило начало непрерывному периоду совместной разработки Tachyon и VMD, когда многие новые функции Tachyon были добавлены специально для молекулярной графики. Тахион использовался для рендеринга изображений, победивших в конкурсе NSF 2004 Visualization Challenge.[3] В 2007 году Tachyon добавила поддержку освещения окружающей окклюзии, что стало одной из функций, сделавших его все более популярным для молекулярной визуализации в сочетании с VMD. VMD и Tachyon постепенно адаптировались для поддержки рутинных задач визуализации и анализа на кластерах, а затем и на больших суперкомпьютерах с петафокальным масштабом. Тахион использовался для создания фигур, фильмов и природы. обложка атомной структуры капсида ВИЧ-1, решенной Zhao et al. в 2013 году на Суперкомпьютер Blue Waters petascale в NCSA, штат Иллинойс.[4][5]

Использование в демонстрациях, обучении и тестировании параллельных вычислений

Отчасти благодаря своей переносимости на широкий спектр платформ, Tachyon использовался в качестве тестового примера для множества статей о параллельных вычислениях и компиляторах.

В 1999 году Джон Стоун помог Биллу Магро адаптировать Tachyon для поддержки ранних версий стандарта параллельных вычислений на основе директив OpenMP с использованием компилятора Kuck and Associates. Tachyon был показан как демонстрация интерактивной трассировки лучей на рабочих станциях DEC Alpha с использованием KCC и OpenMP.

В 2000 году Intel приобрела Kuck and Associates Inc.,[6] и Tachyon продолжали использоваться в качестве демонстрации OpenMP. Позднее Intel использовала Tachyon для разработки различных примеров программирования для своей системы параллельного программирования Threading Building Blocks (TBB), в которой старая версия программы продолжает использоваться в качестве примера по сей день.[7][8]

В 2006 году Тахион был выбран SPEC HPG для включения в SPEC MPI 2007 набор тестов.[9][10]

Помимо типичного использования Tachyon в качестве инструмента для рендеринга высококачественных изображений, вероятно, из-за его переносимости и включения в SPEC MPI 2007, он также использовался в качестве тестового примера и точки сравнения для множества исследовательских проектов, связанных с параллельным рендерингом и визуализацией.[11][12][13][14][15][16][17][18][19] облачные вычисления,[20][21][22][23][24] и параллельные вычисления,[25][26][27] компиляторы,[28][29][30][31] системы исполнения,[32][33] и компьютерная архитектура,[34][35][36] инструменты анализа производительности,[37][38][39] и энергоэффективность систем HPC.[40][41][42]

Смотрите также

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ Стоун, Джон Э. (январь 1998 г.). «Эффективная библиотека для параллельной трассировки лучей и анимации». Магистерские диссертации.
  2. ^ Stone, J .; Андервуд, М. (1996). «Визуализация численного моделирования потоков с использованием MPI». Ход работы. Вторая конференция разработчиков MPI. С. 138–141. CiteSeerX  10.1.1.27.4822. Дои:10.1109 / MPIDC.1996.534105. ISBN  978-0-8186-7533-1.
  3. ^ Эмад Тайхоршид; Клаус Шультен. «Проникновение воды через аквапорины». Группа теоретической и вычислительной биофизики, Иллинойсский университет в Урбана-Шампейн.
  4. ^ Чжао, Гунпу; Perilla, Juan R .; Юфенюй, Эрнест Л .; Мэн, Синь; Чен, Бо; Нин, Цзиин; Ан, Джин Ву; Gronenborn, Angela M .; Шультен, Клаус (2013). «Структура зрелого капсида ВИЧ-1 с помощью криоэлектронной микроскопии и всеатомной молекулярной динамики». Природа. 497 (7451): 643–646. Bibcode:2013Натура.497..643Z. Дои:10.1038 / природа12162. ЧВК  3729984. PMID  23719463.
  5. ^ Стоун, Джон Э .; Изралевиц, Барри; Шультен, Клаус (2013). «Ранний опыт масштабирования задач молекулярной визуализации и анализа VMD в голубой воде». Семинар по экстремальному масштабированию 2013 г. (XSW 2013). С. 43–50. CiteSeerX  10.1.1.396.3545. Дои:10.1109 / XSW.2013.10. ISBN  978-1-4799-3691-5.
  6. ^ «Intel приобретает Kuck & Associates. Приобретение расширяет возможности Intel в области инструментов разработки программного обеспечения для многопроцессорных вычислений». Получено 30 января, 2016.
  7. ^ «Строительные блоки Intel® Threading (Intel® TBB)». Получено 30 января, 2016.
  8. ^ "Параллель для -Тахион". Корпорация Intel. 2009-03-09. Получено 30 января, 2016.
  9. ^ "122.tachyon Описание эталонного теста SPEC MPI2007". Получено 30 января, 2016.
  10. ^ Мюллер, Маттиас С .; Ван Ваверен, Маттейс; Либерман, Рон; Уитни, Брайан; Сайто, Хидеки; Кумаран, Калян; Барон, Джон; Брантли, Уильям С .; Пэррот, Крис; Элкен, Том; Фэн, Хуйюй; Вдумайтесь, Карл (2009). «SPEC MPI2007 - набор тестов приложений для параллельных систем, использующих MPI». Параллелизм и вычисления: практика и опыт: н / д. Дои:10.1002 / cpe.1535.
  11. ^ Розенберг, Роберт О .; Lanzagorta, Marco O .; Ччелканова, Альмадена; Хохлов, Алексей (2000). «Параллельная визуализация больших наборов данных». Визуальное исследование и анализ данных VII. 3960. С. 135–143. Дои:10.1117/12.378889.
  12. ^ Лоулор, Орион Скай. «ИМПОСТОРЫ ДЛЯ ПАРАЛЛЕЛЬНОЙ ИНТЕРАКТИВНОЙ КОМПЬЮТЕРНОЙ ГРАФИКИ» (PDF). Магистр наук, Иллинойсский университет в Урбана-Шампейн, 2001 г.. Получено 30 января, 2016.
  13. ^ "Лоулор, Орион Скай, Мэтью Пейдж и Джон Генетти." MPIglut: программирование Powerwall стало проще "(2008)" (PDF). Получено 30 января, 2016.
  14. ^ Макгиган, Майкл (2008-01-09). «К шкале Тьюринга графики на суперкомпьютере Blue Gene». arXiv:0801.1500 [cs.GR ].
  15. ^ «Лоулор, Орион Скай и Джо Генетти.« Интерактивный объемный рендеринг полярного сияния на графическом процессоре ». (2011)» (PDF).
  16. ^ Гроттель, Себастьян; Крона, Майкл; Шарновски, Катрин; Эртл, Томас (2012). «Окклюзия объектно-пространственного окружения для молекулярной динамики». Симпозиум IEEE Pacific Visualization 2012. С. 209–216. Дои:10.1109 / PacificVis.2012.6183593. ISBN  978-1-4673-0866-3.
  17. ^ Стоун, Джон Э .; Изралевиц, Барри; Шультен, Клаус (2013). «Ранний опыт масштабирования задач молекулярной визуализации и анализа VMD в голубой воде». Семинар по экстремальному масштабированию 2013 г. (XSW 2013). С. 43–50. CiteSeerX  10.1.1.396.3545. Дои:10.1109 / XSW.2013.10. ISBN  978-1-4799-3691-5.
  18. ^ Стоун, Джон Э .; Vandivort, Kirby L .; Шультен, Клаус (2013). «Молекулярная визуализация с ускорением на GPU на суперкомпьютерных платформах с петауровнем». Труды 8-го международного семинара по ультрамасштабной визуализации - Ultra Vis '13. С. 1–8. Дои:10.1145/2535571.2535595. ISBN  9781450325004.
  19. ^ Сенер, Мелих; и другие. «Визуализация процессов преобразования энергии в светособирающей органелле на атомных деталях» (PDF). Получено 30 января, 2016.
  20. ^ Патчин, Филипп; Лагар-Кавилья, Х. Андрес; Де Лара, Эяль; Брудно, Майкл (2009). "Добавление простой кнопки в облако с помощью Snow Стадо и MPI ». Материалы 3-го семинара ACM по виртуализации системного уровня для высокопроизводительных вычислений - HPCVirt '09. С. 1–8. CiteSeerX  10.1.1.534.7880. Дои:10.1145/1519138.1519139. ISBN  9781605584652.
  21. ^ Нил, Ричард; Carloni, Luca P .; Шабаршин, Александр; Сигаев Валерий; Черепанов, Сергей (2011). «Виртуализация встроенного процессора для широкополосных сетевых вычислений». 2011 12-я Международная конференция IEEE / ACM по грид-вычислениям. С. 145–156. CiteSeerX  10.1.1.421.5483. Дои:10.1109 / Сетка.2011.27. ISBN  978-1-4577-1904-2.
  22. ^ «Механизм рабочего процесса для вычислительных облаков, Даниэль Франц, Джи Тао, Хольгер Мартен и Ахим Штрайт. ОБЛАЧНЫЕ ВЫЧИСЛЕНИЯ 2011: Вторая международная конференция по облачным вычислениям, GRID и виртуализации». 2011: 1–6. CiteSeerX  10.1.1.456.6480. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  23. ^ Тао, Цзе; и другие. (2012). «Подход к реализации комбинации межоблачных сервисов» (PDF). Международный журнал достижений в области программного обеспечения. 5 (1&2): 65–75.
  24. ^ Нил, Ричард В. (2013). «Гетерогенные облачные системы на основе широкополосных встроенных вычислений». Дои:10.7916 / d8hh6jg1. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  25. ^ Манджикян, Нараиг (2010). «Изучение проблем проектирования и реализации мультипроцессоров с помощью классных демонстраций». Труды Канадской ассоциации инженерного образования. Получено 30 января, 2016.
  26. ^ Ким, Уён; Восс, М. (01.01.2011). «Программирование многоядерных настольных компьютеров с использованием строительных блоков Intel Threading». Программное обеспечение IEEE. 28 (1): 23–31. Дои:10.1109 / MS.2011.12. ISSN  0740-7459.
  27. ^ Чибукджян, Марк; Каррибо, Патрик; Пераш, Марк (2012). «Иерархическое локальное хранилище: использование гибкого совместного использования пользовательских данных между задачами MPI». 26-й Международный симпозиум по параллельной и распределенной обработке, 2012 г., IEEE. С. 366–377. Дои:10.1109 / IPDPS.2012.42. ISBN  978-1-4673-0975-2.
  28. ^ Годрат, Мохаммед Али; Гиваргис, Тони; Николау, Алекс (2008). «Оптимизация потока управления в контурах с использованием интервального анализа». Материалы международной конференции 2008 г. «Компиляторы, архитектуры и синтез для встраиваемых систем» - CASES '08. п. 157. CiteSeerX  10.1.1.144.7693. Дои:10.1145/1450095.1450120. ISBN  9781605584690.
  29. ^ Герен, Ксавье (12 мая 2010 г.). "Герен, Ксавье. Эффективный подход к разработке встроенного программного обеспечения для многопроцессорной системы на кристалле. Дисс. Национальный политехнический институт Гренобля-INPG, 2010". Получено 30 января, 2016. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  30. ^ Миланез, Тео; Колланж, Сильвен; Кинтао Перейра, Фернанду Маньо; Мейра-младший, Вагнер; Феррейра, Ренато (01.10.2014). «Планирование потоков и объединение памяти для динамической векторизации рабочих нагрузок SPMD». Параллельные вычисления. 40 (9): 548–558. Дои:10.1016 / j.parco.2014.03.006.
  31. ^ Оджа, Давендар Кумар; Сикка, Гита (01.01.2014). Сатапати, Суреш Чандра; Avadhani, P. S .; Удгата, Сиба К .; Лакшминараяна, Садасивуни (ред.). Исследование методов векторизации для многоядерной архитектуры SIMD, предоставленное компиляторами. Достижения в интеллектуальных системах и вычислениях. Издательство Springer International. С. 723–728. Дои:10.1007/978-3-319-03107-1_79. ISBN  9783319031064.
  32. ^ Канг, Микён; Канг, Донг-Ин; Ли, Сынвон; Ли, Джейдон (2013). «Системная структура и API для параллельного программного обеспечения, адаптируемого во время выполнения». Материалы исследования 2013 г. в области адаптивных и конвергентных систем на - RACS '13. С. 51–56. Дои:10.1145/2513228.2513239. ISBN  9781450323482.
  33. ^ Бисвас, Сусмит; Supinski, Bronis R. de; Шульц, Мартин; Франклин, Диана; Шервуд, Тимоти; Чонг, Фредерик Т. (2011). «Использование сходства данных для уменьшения объема памяти». 2011 Международный симпозиум по параллельной и распределенной обработке IEEE. С. 152–163. CiteSeerX  10.1.1.294.6312. Дои:10.1109 / IPDPS.2011.24. ISBN  978-1-61284-372-8.
  34. ^ Ман-Лап Ли; Сасанка, Р .; Adve, S.V .; Йен-Куанг Чен; Дебес, Э. (2005). «Тестовый набор ALPbench для сложных мультимедийных приложений». IEEE International. 2005 Труды симпозиума по характеристике рабочей нагрузки IEEE, 2005 г.. С. 34–45. CiteSeerX  10.1.1.79.42. Дои:10.1109 / IISWC.2005.1525999. ISBN  978-0-7803-9461-2.
  35. ^ Чжан, Цзяци; Чен, Вэнгуан; Тянь, Синьминь; Чжэн, Вэйминь (2008). «Изучение новых приложений для транзакционной памяти». 2008 Девятая Международная конференция по параллельным и распределенным вычислениям, приложениям и технологиям. С. 474–480. Дои:10.1109 / PDCAT.2008.77. ISBN  978-0-7695-3443-5.
  36. ^ "Альмалесс, Гассан и Франк Вайсбурт." О масштабируемости параллельных приложений обработки изображений и сигналов на новых многоядерных процессорах cc-NUMA "." Дизайн и архитектура для обработки сигналов и изображений (DASIP), Конференция 2012 г., IEEE, 2012 " (PDF).
  37. ^ Szebenyi, Zolt´n; Волк, Феликс; Уайли, Брайан Дж. (2011). «Анализ производительности долгоиграющих приложений». 2011 Международный симпозиум IEEE по параллельной и распределенной обработке, семинары и форум PHD. С. 2105–2108. Дои:10.1109 / IPDPS.2011.388. ISBN  978-1-61284-425-1.
  38. ^ Себени, Золтан; Wylie, Brian J. N .; Вольф, Феликс (27.06.2008). Кунев, Самуэль; Гортон, Ян; Сакс, Кай (ред.). Параллельный анализ производительности SCALASCA приложений SPEC MPI2007. Конспект лекций по информатике. Springer Berlin Heidelberg. С. 99–123. CiteSeerX  10.1.1.167.5445. Дои:10.1007/978-3-540-69814-2_8. ISBN  9783540698135.
  39. ^ Вагнер, Майкл; Knupfer, Андреас; Нагель, Вольфганг Э. (2013). «Методы иерархической буферизации памяти для расширения трассировки событий в памяти до формата Open Trace 2». 2013 42-я Международная конференция по параллельной обработке. С. 970–976. Дои:10.1109 / ICPP.2013.115. ISBN  978-0-7695-5117-3.
  40. ^ Вонён Ким; Gupta, Meeta S .; Вэй, Гу-Ён; Брукс, Дэвид (2008). «Анализ системного уровня быстрых DVFS на ядро ​​с использованием встроенных регуляторов переключения». 2008 14-й Международный симпозиум IEEE по архитектуре высокопроизводительных компьютеров. С. 123–134. CiteSeerX  10.1.1.320.879. Дои:10.1109 / HPCA.2008.4658633. ISBN  978-1-4244-2070-4.
  41. ^ Хакенберг, Даниэль; Шене, Роберт; Молка, Даниил; Мюллер, Маттиас С .; Кнюпфер, Андреас (2010). «Количественная оценка вариаций энергопотребления систем HPC с использованием тестов SPEC MPI». Компьютерные науки - Исследования и разработки. 25 (3–4): 155–163. Дои:10.1007 / s00450-010-0118-0.
  42. ^ Иоанну, Николас; Каушке, Майкл; Грис, Матиас; Синтра, Марсело (2011). «Поэтапное иерархическое управление питанием на основе приложений на одночиповом облачном компьютере». 2011 Международная конференция по параллельным архитектурам и методам компиляции. С. 131–142. CiteSeerX  10.1.1.644.9076. Дои:10.1109 / PACT.2011.19. ISBN  978-1-4577-1794-9.