VPS29 - Википедия - VPS29

VPS29
Белок VPS29 PDB 1w24.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыVPS29, DC15, PEP11, DC7, VPS29 компонент ретромерного комплекса, компонент ретромерного комплекса
Внешние идентификаторыOMIM: 606932 MGI: 1928344 ГомолоГен: 9433 Генные карты: VPS29
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение для VPS29
Геномное расположение для VPS29
Группа12q24.11Начинать110,491,083 бп[1]
Конец110,502,111 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001282150
NM_001282151
NM_016226
NM_057180

NM_019780
NM_001347453
NM_001359226

RefSeq (белок)

NP_001269079
NP_001269080
NP_057310
NP_476528

NP_001334382
NP_062754
NP_001346155

Расположение (UCSC)Chr 12: 110,49 - 110,5 МбChr 5: 122.35 - 122.36 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

VPS29 человек ген кодирование сортировки вакуолярного белка белок Vps29, компонент ретромер сложный.[5]

Гомолог дрожжей

Гомологичный белок (тот, который выполняет ту же функцию) в дрожжах: Вакуолярный гомолог сортировки белков 29 (S. cerevisiae).[6]

Функция

VPS29 принадлежит к группе генов, кодирующих белки вакуолярной сортировки белков (VPS), которые при функциональном нарушении нарушают эффективную доставку вакуолярный гидролазы.[7] Белок, кодируемый этим геном, Vps29, является компонентом большого мультимерного комплекса, называемого ретромер комплекс, который участвует в ретроградном транспорте белков от эндосом к сеть транс-Гольджи. Vps29 может участвовать в формировании внутренней оболочки ретромерной оболочки ретроградных пузырьков, покидающих предвакуолярный компартмент.[8] Альтернативный стык варианты, кодирующие разные изоформы, и использование нескольких полиаденилирование были найдены сайты для этого гена.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111237 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029462 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Эдгар AJ, Полак JM (ноябрь 2000 г.). «Человеческие гомологи дрожжевого вакуолярного белка сортировки 29 и 35». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 277 (3): 622–30. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3727. PMID  11062004.
  6. ^ а б «Ген Entrez: гомолог 29 вакуолярного сортировочного белка VPS29 (S. cerevisiae)».
  7. ^ Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, Lesniak MA, Barr VA, Taylor SI (декабрь 2000 г.). «Ортологи дрожжевых белков, сортирующих вакуумный белок Vps26, 29 и 35: сборка в мультимерные комплексы». Мол. Биол. Клетка. 11 (12): 4105–16. Дои:10.1091 / mbc.11.12.4105. ЧВК  15060. PMID  11102511.
  8. ^ Бонифачино Дж. С., Херли Дж. Х. (август 2008 г.). «Ретромер». Curr. Мнение. Cell Biol. 20 (4): 427–36. Дои:10.1016 / j.ceb.2008.03.009. ЧВК  2833274. PMID  18472259.

дальнейшее чтение