Белок, связывающий витамин D - Vitamin D-binding protein

GC
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1J78, 1J7E, 1кВт2, 1KXP, 1 лот, 1MA9
Идентификаторы
Псевдонимы	GC, DBP, DBP / GRD3, HEL-S-51, VDBG, VDBP, Gc-MAF, GcMAF, белок, связывающий витамин D, DBP-maf, VDB, GC, белок, связывающий витамин D
Внешние идентификаторы	OMIM: 139200 MGI: 95669 ГомолоГен: 486 Генные карты: GC
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	71,804,041 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	89,457,898 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание витамина D; • связывание кальцидиола; • связывание актина; • активность трансмембранного переносчика витаминов;
Сотовый компонент	• микрочастица крови; • внеклеточная область; • просвет лизосомы; • внеклеточная экзосома; • внеклеточный; • цитозоль;
Биологический процесс	• метаболический процесс витамина D; • транспорт витаминов; • транспорт; • трансмембранный транспорт витаминов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2638
	14473
	ENSG00000145321
	ENSMUSG00000035540
	P02774
	P21614
	NM_000583; NM_001204306; NM_001204307
	NM_008096
	NP_000574; NP_001191235; NP_001191236
	NP_032122
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий витамин D (DBP), также / первоначально известный как gc-глобулин (гспецифичный для группы cкомпонент), является белок что у людей кодируется GC ген.^[5]^[6]

Структура

Человеческий GC представляет собой гликозилированный альфа-глобулин размером ~ 58 кДа. Его 458 аминокислот кодируются 1690 нуклеотидами на хромосоме 4 (4q11 – q13). Первичная структура содержит 28 остатков цистеина, образующих множественные дисульфидные связи. GC содержит 3 домена. Домен 1 состоит из 10 альфа-спиралей, домен 2 из 9 и домен 3 из 4.^[7]

Функция

Белок, связывающий витамин D, относится к альбумин генная семья, вместе с человеческий сывороточный альбумин и альфа-фетопротеин. Это многофункциональный белок, содержащийся в плазме, асцитическая жидкость, спинномозговая жидкость и на поверхности многих типов клеток.

Он способен связывать различные формы Витамин Д в том числе эргокальциферол (Витамин Д₂) и холекальциферол (Витамин Д₃), 25-гидроксилированные формы (кальцифедиол ) и активный гормональный продукт 1,25-дигидроксивитамин D (кальцитриол ). Основная часть витамина D в крови связана с этим белком. Он переносит метаболиты витамина D между кожей, печенью и почками, а затем к различным тканям-мишеням.^[6]^[8]

Так как Фактор активации макрофагов, производный от белка Gc это Фактор активации макрофагов (MAF), который был протестирован для использования в качестве лечения рака, которое активирует макрофаги против раковых клеток.^[9]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. ^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )]]

Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )

^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «VitaminDSynthesis_WP1531».

Производство

Он синтезируется печеночные паренхиматозные клетки и спрятан в кровь тираж.^[8]

Генетическая изменчивость

Многие генетические варианты GC ген известны. Производят 6 основных гаплотипы и 3 основных варианта белка (Gc1S, Gc1F и Gc2).^[10] Генетические вариации связаны с различиями в уровнях циркулирующего 25-гидроксивитамина D.^[11] Они были предложены для объяснения некоторых различий в статусе витамина D у разных этнических групп,^[12] и было обнаружено, что они коррелируют с реакцией на добавку витамина D.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145321 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Миккельсен М., Якобсен П., Хеннингсен К. (июль 1977 г.). «Возможная локализация Gc-системы на хромосоме 4. Потеря материала длинной руки 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри Gc-системы». Человеческая наследственность. 27 (2): 105–7. Дои:10.1159/000152857. PMID 558959.
^ ^а ^б «Ген Entrez: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)».
^ Verboven C, Rabijns A, De Maeyer M, Van Baelen H, Bouillon R, De Ranter C (февраль 2002 г.). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого витамин D-связывающего белка». Структурная биология природы. 9 (2): 131–6. Дои:10.1038 / nsb754. PMID 11799400. S2CID 38990672.
^ ^а ^б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья». Американский журнал клинического питания. 88 (2): 491S – 499S. Дои:10.1093 / ajcn / 88.2.491S. PMID 18689389.
^ Ямамото Н., Суяма Н., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с использованием фактора активации макрофагов, производного от белка Gc, GcMAF» ([PDF]). Трансляционная онкология. 1 (2): 65–72. Дои:10.1593 / tlo.08106. ЧВК 2510818. PMID 18633461.
^ ^а ^б Малик С., Фу Л., Джурас Д.Д., Кармали М., Вонг Б.И., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Общие варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья». Критические обзоры в клинических лабораторных науках. 50 (1): 1–22. Дои:10.3109/10408363.2012.750262. ЧВК 3613945. PMID 23427793.
^ МакГрат Дж. Дж., Саха С., Берн Т. Х., Эйлс Д. В. (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между общими однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии. 121 (1–2): 471–7. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2010.03.073. PMID 20363324. S2CID 20057294.
^ Powe CE, Evans MK, Wenger J, Zonderman AB, Berg AH, Nalls M., Tamez H, Zhang D, Bhan I., Karumanchi SA, Powe NR, Thadhani R (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих американцев и белых американцев». Медицинский журнал Новой Англии. 369 (21): 1991–2000. Дои:10.1056 / NEJMoa1306357. ЧВК 4030388. PMID 24256378.

дальнейшее чтение

Свасти Дж., Курски А., Беннет А., Боуман Б. Х. (апрель 1979 г.). «Молекулярная основа для трех основных форм человеческого сывороточного белка, связывающего витамин D (группоспецифический компонент)». Биохимия. 18 (8): 1611–7. Дои:10.1021 / bi00575a036. PMID 218624.
Браун А., Бихлмайер Р., Клив Г. (июнь 1992 г.). «Молекулярный анализ гена человеческого витамин D-связывающего белка (группоспецифический компонент): аллельные различия общих генетических типов GC». Генетика человека. 89 (4): 401–6. Дои:10.1007 / BF00194311. PMID 1352271. S2CID 1913655.
Эстебан К., Гойскенс М., Эна Дж. М., Мишал З., Мачо А., Торрес Дж. М., Уриэль Дж. (Май 1992 г.). «Рецептор-опосредованное поглощение и процессинг витамин D-связывающего белка в человеческих B-лимфоидных клетках». Журнал биологической химии. 267 (14): 10177–83. PMID 1374401.
Шпирер К., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам MQ, Леван Г., Шпирер Дж. (Июнь 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика. 13 (2): 293–300. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-Н. PMID 1535333.
Доусон С.Дж., Белый Лос-Анджелес (май 1992 г.). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». Журнал инфекции. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Ян Ф., Бержерон Дж. М., Лайнехан Л. А., Лалли П. А., Сакагучи А. Ю., Боуман Б. Х. (август 1990 г.). «Картирование и сохранение гена специфического компонента у мышей». Геномика. 7 (4): 509–16. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90193-Х. PMID 1696927.
Ян Ф., Луна В.Дж., Маканелли Р.Д., Наберхаус К.Х., Купплс Р.Л., Боуман Б.Х. (ноябрь 1985 г.). «Эволюционные и структурные отношения между специфическим для группы компонентом, альбумином и альфа-фетопротеином». Исследования нуклеиновых кислот. 13 (22): 8007–17. Дои:10.1093 / nar / 13.22.8007. ЧВК 322106. PMID 2415926.
Ян Ф., Брюн Дж. Л., Нейлор С. Л., Купплс Р. Л., Наберхаус К. Х., Боуман Б. Х. (декабрь 1985 г.). «Человеческий групповой специфический компонент (Gc) является членом семейства альбуминов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 82 (23): 7994–8. Дои:10.1073 / пнас.82.23.7994. ЧВК 391428. PMID 2415977.
Кук NE, Дэвид EV (декабрь 1985 г.). «Сывороточный витамин D-связывающий белок является третьим членом семейства генов альбумина и альфа-фетопротеина». Журнал клинических исследований. 76 (6): 2420–4. Дои:10.1172 / JCI112256. ЧВК 424397. PMID 2416779.
Schoentgen F, Metz-Boutigue MH, Jollès J, Constans J, Jollès P (июнь 1986). «Полная аминокислотная последовательность человеческого витамин D-связывающего белка (группоспецифический компонент): свидетельство трехкратной внутренней гомологии, как у сывороточного альбумина и альфа-фетопротеина». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 871 (2): 189–98. Дои:10.1016/0167-4838(86)90173-1. PMID 2423133.
McNearney TA, Odell C, Holers VM, Spear PG, Atkinson JP (ноябрь 1987 г.). «Гликопротеины вируса простого герпеса gC-1 и gC-2 связываются с третьим компонентом комплемента и обеспечивают защиту от опосредованной комплементом нейтрализации вирусной инфекционности». Журнал экспериментальной медицины. 166 (5): 1525–35. Дои:10.1084 / jem.166.5.1525. ЧВК 2189652. PMID 2824652.
Ян Ф, Наберхаус К. Х., Адриан Г. С., Гарделла Дж. М., Бриссенден Дж. Э., Боуман Б. Х. (1987). «Ген витамин D-связывающего белка содержит консервативные нуклеотидные последовательности, которые отвечают на тяжелые металлы, адипоциты и митотические сигналы». Ген. 54 (2–3): 285–90. Дои:10.1016/0378-1119(87)90499-9. PMID 2958390.
Кук NE, Уиллард Х.Ф., Дэвид Э.В., Джордж Д.Л. (июль 1986 г.). «Прямое региональное отнесение гена связывающего витамин D белка (Gc-глобулин) к человеческой хромосоме 4q11-q13 и идентификация ассоциированного полиморфизма ДНК». Генетика человека. 73 (3): 225–9. Дои:10.1007 / BF00401232. PMID 3015768. S2CID 38816588.
Нестлер Дж. Э., Маклеод Дж. Ф., Ковальский М. А., Штраус Дж. Ф., Хаддад Дж. Г. (май 1987 г.). «Обнаружение белка, связывающего витамин D, на поверхности цитотрофобластов, выделенных из плаценты человека». Эндокринология. 120 (5): 1996–2002. Дои:10.1210 / эндо-120-5-1996. PMID 3552627.
Пирс Э.А., Дама М.С., Буйон Р., Ван Бэлен Х., ДеЛука Х.Ф. (декабрь 1985 г.). «Моноклональные антитела к человеческому витамин D-связывающему белку». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 82 (24): 8429–33. Дои:10.1073 / пнас.82.24.8429. ЧВК 390929. PMID 3936035.
Вутен М.В., Нел А.Е., Гольдшмидт-Клермон П.Дж., Гэлбрейт Р.М., Ренн Р.В. (октябрь 1985 г.). «Идентификация основного эндогенного субстрата для фосфолипид / Са2 + -зависимой киназы в ацинусах поджелудочной железы как Gc (витамин D-связывающий белок)». Письма FEBS. 191 (1): 97–101. Дои:10.1016/0014-5793(85)81001-2. PMID 4054306. S2CID 29613843.
Констанс Дж., Оксман Ф., Виау М. (август 1981 г.). «Связывание апо и холо форм сывороточного витамин D-связывающего белка с цитоплазмой и мембраной лимфоцитов человека путем непрямой иммунофлуоресценции». Письма иммунологии. 3 (3): 159–62. Дои:10.1016/0165-2478(81)90120-6. PMID 7026425.
Браун А., Кофлер А., Моравиц С., Клив Н. (декабрь 1993 г.). «Последовательность и организация гена человеческого витамин D-связывающего белка». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1216 (3): 385–94. Дои:10.1016 / 0167-4781 (93) 90005-х. PMID 7505619.
Свами Н., Рой А., Чанг Р., Бриссон М., Рэй Р. (апрель 1995 г.). «Аффинная очистка человеческого витамин D-связывающего белка плазмы». Экспрессия и очистка белков. 6 (2): 185–8. Дои:10.1006 / преп.1995.1023. PMID 7606167.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P02774 (Витамин D-связывающий белок) в PDBe-KB.

[WikiPathways-10] Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «VitaminDSynthesis_WP1531».

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145321 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid558959-5] Миккельсен М., Якобсен П., Хеннингсен К. (июль 1977 г.). «Возможная локализация Gc-системы на хромосоме 4. Потеря материала длинной руки 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри Gc-системы». Человеческая наследственность. 27 (2): 105–7. Дои:10.1159/000152857. PMID 558959.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)».

[pmid11799400-7] Verboven C, Rabijns A, De Maeyer M, Van Baelen H, Bouillon R, De Ranter C (февраль 2002 г.). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого витамин D-связывающего белка». Структурная биология природы. 9 (2): 131–6. Дои:10.1038 / nsb754. PMID 11799400. S2CID 38990672.

[Norman2008-8] а ^б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья». Американский журнал клинического питания. 88 (2): 491S – 499S. Дои:10.1093 / ajcn / 88.2.491S. PMID 18689389.

[9] Ямамото Н., Суяма Н., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с использованием фактора активации макрофагов, производного от белка Gc, GcMAF» ([PDF]). Трансляционная онкология. 1 (2): 65–72. Дои:10.1593 / tlo.08106. ЧВК 2510818. PMID 18633461.

[Malik-2013-11] а ^б Малик С., Фу Л., Джурас Д.Д., Кармали М., Вонг Б.И., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Общие варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья». Критические обзоры в клинических лабораторных науках. 50 (1): 1–22. Дои:10.3109/10408363.2012.750262. ЧВК 3613945. PMID 23427793.

[12] МакГрат Дж. Дж., Саха С., Берн Т. Х., Эйлс Д. В. (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между общими однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии. 121 (1–2): 471–7. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2010.03.073. PMID 20363324. S2CID 20057294.

[13] Powe CE, Evans MK, Wenger J, Zonderman AB, Berg AH, Nalls M., Tamez H, Zhang D, Bhan I., Karumanchi SA, Powe NR, Thadhani R (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих американцев и белых американцев». Медицинский журнал Новой Англии. 369 (21): 1991–2000. Дои:10.1056 / NEJMoa1306357. ЧВК 4030388. PMID 24256378.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[§ 1]

[10]

[11]

[12]