ARHGEF4 - ARHGEF4

ARHGEF4
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2DX1, 2PZ1, 3NMX, 3НМЗ
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF4, ASEF, ASEF1, GEF4, STM6, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 4, SMIM39
Внешние идентификаторы	OMIM: 605216 MGI: 2442507 ГомолоГен: 49414 Генные карты: ARHGEF4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	131,047,263 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	34,813,309 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rac; • GO: 0001948 связывание с белками; • специфическое связывание белкового домена; • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов; • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • мембрана с оборками; • цитозоль; • клеточная мембрана; • проекция клетки; • мембрана;
Биологический процесс	• сборка филоподиума; • регуляция передачи сигнала белка Rho; • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала; • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase; • ламеллиподиум в сборе; • положительная регуляция апоптотического процесса; • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	50649
	226970
	ENSG00000136002
	ENSMUSG00000037509
	Q9NR80
	Q7TNR9
NM_015320; NM_032995; NM_001367493; NM_001375900; NM_001375901;
	NM_001375902; NM_001375903; NM_001375904
	NM_183019; NM_001368773
NP_056135; NP_001354422; NP_001362829; NP_001362830; NP_001362831;
	NP_001362832; NP_001362833
	NP_898840; NP_001355702
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 4 это белок что у людей кодируется ARHGEF4 ген.^[5]^[6]

Функция

Rho GTPases играют фундаментальную роль во многих клеточных процессах, которые инициируются внеклеточными стимулами, которые работают через G-белковые рецепторы. Кодируемый белок может образовывать комплекс с G-белками и стимулировать Rho-зависимые сигналы. Этот белок похож на крысиный коллибистин белок. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует два варианта транскрипта, которые кодируют разные изоформы. Кроме того, для этого гена существует возможность использования нескольких сайтов полиаденилирования.^[6]

Модельные организмы

*Arhgef4* нокаутный фенотип мыши
Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный^[7]
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология	Нормальный^[8]
Лимфоциты периферической крови	Аномальный^[9]
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный^[10]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный^[11]
Все тесты и анализы от^[12]^[13]

Модельные организмы были использованы при изучении функции ARHGEF4. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Arhgef4^{tm1a (КОМП) Wtsi}^[14]^[15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[16]^[17]^[18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[12]^[19] Было проведено двадцать два испытания на гомозиготный мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: у самцов нетипичные лимфоцит периферической крови параметры, в том числе уменьшенные В клетка число и увеличенное гранулоцит номер.^[12]

Взаимодействия

ARHGEF4 было показано взаимодействовать с APC.^[20]

внешняя ссылка

Человек ARHGEF4 расположение генома и ARHGEF4 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
Курагути М., Ван ХР, Бронсон Р.Т. и др. (2006). «Аденоматозный полипоз кишечной палочки (APC) необходим для нормального развития кожи и тимуса». PLOS Genet. 2 (9): e146. Дои:10.1371 / journal.pgen.0020146. ЧВК 1564426. PMID 17002498.
Ватанабе Т., Ван С., Норитаке Дж. И др. (2005). «Взаимодействие с IQGAP1 связывает APC с Rac1, Cdc42 и актиновыми филаментами во время поляризации и миграции клеток». Dev. Клетка. 7 (6): 871–83. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.10.017. PMID 15572129.
Кавасаки Ю., Сато Р., Акияма Т. (2003). «Мутировавшие APC и Asef участвуют в миграции клеток колоректальной опухоли». Nat. Cell Biol. 5 (3): 211–5. Дои:10.1038 / ncb937. PMID 12598901. S2CID 22276128.
Кавасаки Ю., Сенда Т., Ишидате Т. и др. (2000). «Asef, связь между супрессором опухолей APC и передачей сигналов G-белка». Наука. 289 (5482): 1194–7. Дои:10.1126 / science.289.5482.1194. PMID 10947987.

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136002 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037509 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10873612-5] Thiesen S, Kübart S, Ropers HH, Nothwang HG (июль 2000 г.). «Выделение двух новых человеческих RhoGEFs, ARHGEF3 и ARHGEF4, в 3p13-21 и 2q22». Biochem Biophys Res Commun. 273 (1): 364–9. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2925. PMID 10873612.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: ARHGEF4 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 4».

[Dysmorphology-7] «Данные дисморфологии для Arhgef4». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[Haematology-8] «Гематологические данные для Arhgef4». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[Peripheral_blood_lymphocytes-9] «Данные лимфоцитов периферической крови для Arhgef4». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[''Salmonella''_infection-10] "Сальмонелла данные о заражении для Arhgef4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[''Citrobacter''_infection-11] "Citrobacter данные о заражении для Arhgef4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[mgp_reference-12] а ^б ^c Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.

[13] Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.

[allele_ref-14] «Международный консорциум нокаут-мышей».

[mgi_allele_ref-15] "Информатика генома мыши".

[pmid21677750-16] Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.

[mouse_library-17] Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.

[mouse_for_all_reasons-18] Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.

[pmid21722353-19] ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.

[pmid10947987-20] Кавасаки Ю., Сенда Т., Ишидате Т., Кояма Р., Моришита Т., Иваяма Ю., Хигучи О, Акияма Т. (2000). «Asef, связь между супрессором опухолей APC и передачей сигналов G-белка». Наука. 289 (5482): 1194–7. Дои:10.1126 / science.289.5482.1194. PMID 10947987.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]