Аэропирум перникс - Aeropyrum pernix
| Аэропирум перникс | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | А. перникс |
| Биномиальное имя | |
| Аэропирум перникс Sako et al. 1996 г. | |
Аэропирум перникс это разновидность экстремофил архей в архейском типе Crenarchaeota. Это обязательно теплолюбивый разновидность. Первые экземпляры были выделены из отложения в море у побережья Япония.
Открытие
Аэропирум перникс был первым строго аэробный гипертермофильный Археи быть обнаруженным. Первоначально он был изолирован от нагретых морских отложений и сточных вод, собранных в 1996 г. сольфатарный выход на остров Кодакарадзима в Кюсю, Япония.[1]
Структура генома
Его полный геном был секвенирован в 1999 году и имеет размер 1669 килобаз, из которых 2694 возможных гены обнаружен.[2] Были обнаружены все гены цикла TCA, кроме гена α-кетоглутаратдегидрогеназа. Вместо этого были идентифицированы гены, кодирующие две субъединицы 2-оксокислоты: ферредоксин оксидоредуктаза.
Характеристики
Ячейки Аэропирум перникс имеют сферическую форму и примерно 1 мкм в диаметре. Оболочка, окружающая клетки Aeropyrum имеет ширину около 25 нм. Организмы растут при температуре от 70 до 100 ° C (оптимум от 90 до 95 ° C), при pH от 5 до 9 (оптимум, pH 7) и при соленость от 1,8 до 7% (оптимально, соленость 3,5%). Рост организмов не обнаруживается при 68 или 102 ° C. При солености ниже 1,5% клетки лизируются за счет низкого осмотического шока. Клетки организмов чувствительны к хлорамфениколу и нечувствительны к ампициллину, ванкомицину и циклосерину. Хорошо растет на белковый вещества, с время удвоения в этих условиях около 200 минут.[1]
Рекомендации
- ^ а б Сако Й., Номура Н., Учида А. и др. (1996). "Aeropyrum pernix gen. Nov., Sp. Nov., Новая аэробная гипертермофильная архея, растущая при температурах до 100 ° C" (PDF). Int. J. Syst. Бактериол. 46 (4): 1070–7. Дои:10.1099/00207713-46-4-1070. PMID 8863437. Архивировано из оригинал (PDF) на 2008-12-02. Получено 2007-11-23.
- ^ Каварабаяси Ю., Хино Ю., Хорикава Х. и др. (1999). «Полная последовательность генома аэробного гипертермофильного кренархея, Aeropyrum pernix K1» (PDF). ДНК Res. 6 (2): 83–101, 145–52. Дои:10.1093 / днарес / 6.2.83. PMID 10382966.
дальнейшее чтение
- Бхуия, Мохаммад Вадуд; Сурьяди, Джимми; Чжоу, Чжоли; Браун, Бернард Эндрю, II (5 августа 2013 г.). «Структура многофункционального белка Aeropyrum pernix L7Ae и понимание его экстремальной термостабильности». Acta Crystallographica Раздел F. 69 (Pt 9): 979–988. Дои:10.1107 / S1744309113021799. ЧВК 3758144. PMID 23989144.
- Дайфуку, Такаши; Ёсида, Такаши; Такаюки, Китамура; Кавайчи, Сатоши; Иноуэ, Такахиро; Номура, Кейго; Йошида, Юи; Куно, Сотаро; Сако, Ёсихико (19 июля 2013 г.). «Вариации связанных с вирусом элементов в синтетических геномах гипертермофильных Archaeon Aeropyrum». Appl. Environ. Микробиол. 79 (19): 5891–8. Дои:10.1128 / AEM.01089-13. ЧВК 3811351. PMID 23872576.
- Ли, Пён Чхон; Mijts, Benjamin N .; Петри, Ральф; Уоттс, Кевин Т .; Шмидт-Даннерт, Клаудиа (16 июня 2004 г.). «Изменение специфичности продукта фарнезилгеранилдифосфатсинтазы (Fgs) Aeropyrum pernix путем направленной эволюции». Разработка и отбор протеинов. 17 (11): 771–777. Дои:10.1093 / белок / gzh089. PMID 15548566.
- Ота, Ажда; Гмайнер, Деян; Sentijurc, Marjeta; Ульрих, Наташа Поклар (13 апреля 2012 г.). «Влияние pH среды выращивания Aeropyrum на структурные свойства и текучесть археосом». Археи. 2012: 9. Дои:10.1155/2012/285152. ЧВК 3384975. PMID 22778670.
- Сакураба, Харухико; Сатура, Такенори; Кавакам, Рюши; Ким, Кван; Кара, Юсуке; Йонеда, Казунари; Осима, Тосихиса (16 апреля 2012 г.). "Кристаллическая структура новой связанной с красителем L-пролиндегидрогеназы из гипертермофильных архей Aeropyrum Pernix". Журнал биологической химии. 287 (24): 20070–20080. Дои:10.1074 / jbc.M111.319038. ЧВК 3370190. PMID 22511758.