Воспалительный фактор аллотрансплантата 1 - Allograft inflammatory factor 1

AIF1
Белок AIF1 PDB 2d58.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыAIF1, AIF-1, IBA1, IRT-1, IRT1, воспалительный фактор 1 аллотрансплантата
Внешние идентификаторыOMIM: 601833 MGI: 1343098 ГомолоГен: 1226 Генные карты: AIF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение AIF1
Геномное расположение AIF1
Группа6п21.33Начинать31,615,217 бп[1]
Конец31,617,021 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE AIF1 215051 x at fs.png

PBB GE AIF1 209901 x в формате fs.png

PBB GE AIF1 213095 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001623
NM_004847
NM_032955
NM_001318970

NM_019467
NM_001361501
NM_001361502

RefSeq (белок)

NP_001305899
NP_001614
NP_116573
NP_001614.3

NP_062340
NP_001348430
NP_001348431

Расположение (UCSC)Chr 6: 31,62 - 31,62 МбChr 17: 35.17 - 35.18 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Воспалительный фактор аллотрансплантата 1 (АиФ-1) также известный как ионизированная молекула-адаптер, связывающая кальций 1 (IBA1) это белок что у людей кодируется AIF1 ген.[5][6]

Ген

Ген AIF1 расположен в сегменте главный комплекс гистосовместимости класс III регион. Было показано, что этот ген сильно экспрессируется в семенниках, селезенке и головном мозге, но слабо экспрессируется в легких и почках. Среди клеток мозга ген Iba1 сильно и специфически экспрессируется в микроглии. Циркулирующие макрофаги также экспрессируют Iba1.

Функция

AIF1 - это белок, который существует в цитоплазма, и он очень эволюционно сохраняется. Он также, возможно, идентичен трем другим белкам, Iba-2, MRF-1 (фактор ответа микроглии) и даинтейну. Однако полные функциональные профили всех трех белков и то, как они перекрываются, неизвестны.[7] IBA1 - это 17-кДа EF рука белок, который специфически экспрессируется в макрофаги / микроглия и активируется во время активации этих клеток. Экспрессия Iba1 активируется в микроглии после повреждения нерва,[8] ишемия центральной нервной системы и ряд других заболеваний головного мозга.

AIF1 был первоначально обнаружен в атеросклеротический поражения на крысиной модели хронического аллотрансплантат сердечное отторжение. Было обнаружено, что он активирован в макрофаги и нейтрофилы в ответ на цитокин IFN-γ.[9] Было замечено, что экспрессия AIF1 увеличивается в сосудистой ткани в ответ на повреждение артерии, в частности, она обнаруживается в активированных клетках гладких мышц сосудов в ответ на IFN-γ, ИЛ-1β и среды, кондиционированные Т-клетками.[10] В гладкие мышцы сосудов клеток, активация отвечает за утолщение артерий в аллотрансплантатах за счет чрезмерной пролиферации. Было обнаружено, что AIF1 усиливает рост и способствует пролиферации гладкомышечных клеток сосудов за счет нарушения регуляции клеточного цикла. Это достигается за счет укорачивания клеточного цикла и изменения экспрессии циклинов.[11] Хотя гистологически различается, AIF1 также способствует пролиферации и активации эндотелиальный клетки (ЭК). Активация ЭК приводит к пролиферации и миграции клеток, которая участвует во многих нормальных сосудистых процессах, таких как атеросклероз, ангиогенез и заживление ран. В настоящее время предполагается, что AIF1 контролирует пролиферацию и миграцию эндотелиальных клеток посредством действия в преобразование сигнала пути.[12] Он имеет особенности цитоплазматического сигнального белка, включая несколько доменов, которые позволяют связываться с мультибелковыми комплексами, называемыми PDZ домены.[13] В эндотелиальных клетках AIF1, как было специально показано, регулирует васкулогенез, включая образование разрастаний аорты и трубчатых образований. Было показано, что AIF1 взаимодействует с киназой p44 / 42 и PAK1, две ранее известные молекулы сигнальной трансдукции, регулирующие эти процессы. AIF1 также демонстрирует явные различия в путях, с помощью которых он регулирует эндотелиальные клетки, макрофаги и гладкомышечные клетки сосудов.[12]

Клиническое значение

Воспалительный фактор 1 аллотрансплантата обнаружен в активированных макрофагах. Активированные макрофаги обнаруживаются в тканях с воспалением. Было обнаружено, что уровни AIF1 у здоровых людей положительно коррелируют с метаболическими показателями, такими как индекс массы тела, триглицериды и уровни глюкозы в плазме натощак. Обнаружено, что избыток жировой ткани у пациентов с ожирением вызывает хроническое воспаление с увеличением количества активированных макрофагов. Следовательно, AIF1 может быть точным индикатором активации макрофагов в организме.[14] Есть также свидетельства того, что AIF1 может быть маркером для диабетическая нефропатия при обнаружении в сыворотке.[15] Поскольку диабетическая нефропатия является следствием длительного диабета 1 и 2 типа, это согласуется с доказательствами того, что AIF1 может быть связан с другими аспектами диабета. Он находится в активированных макрофагах в островки поджелудочной железы, и было показано, что он снижает секрецию инсулина, одновременно нарушая выведение глюкозы.[16]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000235985, ENSG00000235588, ENSG00000234836, ENSG00000237727, ENSG00000204472 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000206428, ENSG00000235985, ENSG00000235588, ENSG00000S202348, ENSG000002348 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024397 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Аутьери М.В. (декабрь 1996 г.). «Клонирование кДНК воспалительного фактора-1 аллотрансплантата человека: тканевое распределение, индукция цитокинов и экспрессия мРНК в поврежденных сонных артериях крысы». Biochem Biophys Res Commun. 228 (1): 29–37. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1612. PMID  8912632.
  6. ^ «Ген Энтреза: воспалительный фактор 1 аллотрансплантата AIF1».
  7. ^ Дейнингер М. Х., Мейерманн Р., Шлюзенер Х. Дж. (Март 2002 г.). "Семейство белков воспалительного фактора-1 аллотрансплантата". FEBS Lett. 514 (2–3): 115–21. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02430-4. PMID  11943136. S2CID  34086133.
  8. ^ Ито Д., Имаи Ю., Осава К., Накадзима К., Фукуути Ю., Косака С. (июнь 1998 г.). «Специфическая для микроглии локализация нового связывающего кальций белка, Iba1». Brain Res. Мол. Brain Res. 57 (1): 1–9. Дои:10.1016 / s0169-328x (98) 00040-0. PMID  9630473.
  9. ^ Utans U, Arceci RJ, Yamashita Y, Russell ME (июнь 1995 г.). «Клонирование и характеристика воспалительного фактора-1 аллотрансплантата: новый фактор макрофагов, идентифицированный в сердечных аллотрансплантатах крыс с хроническим отторжением». J. Clin. Вкладывать деньги. 95 (6): 2954–62. Дои:10.1172 / JCI118003. ЧВК  295984. PMID  7769138.
  10. ^ Аутьери М.В., Карбон С, Му А (июль 2000 г.). «Экспрессия воспалительного фактора-1 аллотрансплантата является маркером активированных гладкомышечных клеток сосудов человека и повреждения артерий». Артериосклер. Тромб. Васк. Биол. 20 (7): 1737–44. Дои:10.1161 / 01.ATV.20.7.1737. PMID  10894811.
  11. ^ Аутьери М.В., Карбон СМ (сентябрь 2001 г.). «Сверхэкспрессия воспалительного фактора-1 аллотрансплантата способствует пролиферации гладкомышечных клеток сосудов за счет дерегуляции клеточного цикла». Артериосклер. Тромб. Васк. Биол. 21 (9): 1421–6. Дои:10.1161 / hq0901.095566. PMID  11557666.
  12. ^ а б Тиан Й., Джайн С., Келемен С.Е., Аутьери М.В. (февраль 2009 г.). «Экспрессия AIF-1 регулирует активацию эндотелиальных клеток, передачу сигнала и васкулогенез». Являюсь. J. Physiol., Cell Physiol.. 296 (2): C256–66. Дои:10.1152 / ajpcell.00325.2008. ЧВК  2643850. PMID  18787073.
  13. ^ Хун А.Ю., Шэн М. (февраль 2002 г.). «Домены PDZ: структурные модули для сборки белкового комплекса». J. Biol. Chem. 277 (8): 5699–702. Дои:10.1074 / jbc.R100065200. PMID  11741967.
  14. ^ Фукуи М., Танака М., Тода Х, Асано М., Ямадзаки М., Хасегава Г., Имаи С., Фудзинами А., Охта М., Накамура Н. (июль 2012 г.). «Сывороточная концентрация воспалительного фактора-1 аллотрансплантата коррелирует с параметрами метаболизма у здоровых людей». Метаб. Clin. Опыт. 61 (7): 1021–5. Дои:10.1016 / j.metabol.2011.12.001. PMID  22225958.
  15. ^ Фукуи М., Танака М., Асано М., Ямадзаки М., Хасэгава Г., Имаи С., Фудзинами А., Охта М., Обаяси Н., Накамура Н. (июль 2012 г.). «Воспалительный фактор-1 аллотрансплантата сыворотки - новый маркер диабетической нефропатии». Diabetes Res. Clin. Практика. 97 (1): 146–50. Дои:10.1016 / j.diabres.2012.04.009. PMID  22560794.
  16. ^ Chen ZW, Ahren B, Ostenson CG, Cintra A, Bergman T, Möller C, Fuxe K, Mutt V, Jörnvall H, Efendic S (декабрь 1997 г.). «Идентификация, выделение и характеристика даинтена (фактор 1 воспаления аллотрансплантата), полипептида макрофага, который влияет на секрецию инсулина и широко присутствует в поджелудочной железе крыс BB с преддиабетическим состоянием». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (25): 13879–84. Bibcode:1997PNAS ... 9413879C. Дои:10.1073 / пнас.94.25.13879. ЧВК  28401. PMID  9391121.

внешняя ссылка

  • Человек AIF1 расположение генома и AIF1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для воспалительного фактора 1 аллотрансплантата человека

дальнейшее чтение