CPSF3 - CPSF3
Субъединица 3 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования это белок что у людей кодируется CPSF3 ген.[5][6]
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при изучении функции CPSF3. Условный нокаутирующая мышь линия называется Cpsf3tm1b (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[7] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[8] для определения последствий удаления.[9][10][11][12] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[13]
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на сайте.[8][13] | |
| Инсулин | Нормальный |
| Гомозиготная жизнеспособность на P14 | Аномальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Аномальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормальный |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный |
| Состав эпидермального иммунитета | Нормальный |
| Проблема гриппа | Нормальный |
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119203 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000054309 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Дженни А., Минвьель-Себастия Л., Прекер П.Дж., Келлер В. (декабрь 1996 г.). «Сходство последовательности между 73-килодальтонным белком CPSF млекопитающих и субъединицей дрожжевого фактора полиаденилирования I». Наука. 274 (5292): 1514–7. Дои:10.1126 / science.274.5292.1514. PMID 8929409. S2CID 12958377.
- ^ «Ген Entrez: специфический фактор 3 расщепления CPSF3 и полиаденилирования, 73 кДа».
- ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
- ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
внешняя ссылка
- Человек CPSF3 расположение генома и CPSF3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Мурти К.Г., Мэнли Дж. Л. (1995). «Субъединица 160 кДа фактора специфичности расщепления-полиаденилирования человека координирует образование 3'-конца пре-мРНК». Genes Dev. 9 (21): 2672–83. Дои:10.1101 / gad.9.21.2672. PMID 7590244.
- Дженни А., Хаури HP, Келлер В. (1994). «Характеристика фактора специфичности расщепления и полиаденилирования и клонирование его 100-килодальтонной субъединицы». Мол. Клетка. Биол. 14 (12): 8183–90. Дои:10.1128 / MCB.14.12.8183. ЧВК 359357. PMID 7969155.
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Thuresson AC, Aström J, Aström A, et al. (1994). «Множественные формы поли (А) полимераз в клетках человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (3): 979–83. Дои:10.1073 / пнас.91.3.979. ЧВК 521437. PMID 8302877.
- Маккракен С., Фонг Н., Янкулов К. и др. (1997). «С-концевой домен РНК-полимеразы II связывает процессинг мРНК с транскрипцией». Природа. 385 (6614): 357–61. Дои:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523. S2CID 4307073.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Такагаки Y, Мэнли JL (2000). «Сложные белковые взаимодействия в аппарате полиаденилирования человека определяют новый компонент». Мол. Клетка. Биол. 20 (5): 1515–25. Дои:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. ЧВК 85326. PMID 10669729.
- de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W. и др. (2000). «Фактор расщепления пре-мРНК человека II (m) содержит гомологи дрожжевых белков и связывает два других фактора расщепления». EMBO J. 19 (21): 5895–904. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5895. ЧВК 305781. PMID 11060040.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Кауфманн I, Мартин Г., Фридляйн А. и др. (2005). «Человеческий Fip1 представляет собой субъединицу CPSF, которая связывается с U-богатыми элементами РНК и стимулирует поли (А) полимеразу». EMBO J. 23 (3): 616–26. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600070. ЧВК 1271804. PMID 14749727.
- Кальзадо М.А., Санчо Р., Муньос Э. (2004). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Tat увеличивает экспрессию 73-килодальтонной субъединицы фактора специфичности расщепления и полиаденилирования, модулируя клеточную и вирусную экспрессию». Дж. Вирол. 78 (13): 6846–54. Дои:10.1128 / JVI.78.13.6846-6854.2004. ЧВК 421638. PMID 15194760.
- Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Mandel CR, Kaneko S, Zhang H, et al. (2007). «Фактор полиаденилирования CPSF-73 представляет собой эндонуклеазу пре-мРНК, обрабатывающую 3'-конец». Природа. 444 (7121): 953–6. Дои:10.1038 / природа05363. ЧВК 3866582. PMID 17128255.
- де ла Вега Л., Санчес-Даффуэз Г., Фресно М. и др. (2007). «Субъединица 73 кДа комплекса CPSF связывается с промотором LTR ВИЧ-1 и действует как негативный регуляторный фактор, который ингибируется белком Tat ВИЧ-1». J. Mol. Биол. 372 (2): 317–30. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.06.075. PMID 17669424.
PDB галерея | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |