ЭНДОГ - ENDOG

ЭНДОГ
Идентификаторы
ПсевдонимыЭНДОГ, эндонуклеаза G
Внешние идентификаторыOMIM: 600440 MGI: 1261433 ГомолоГен: 55823 Генные карты: ЭНДОГ
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное местоположение для ENDOG
Геномное местоположение для ENDOG
Группа9q34.11Начинать128,818,500 бп[1]
Конец128,822,676 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ENDOG 204824 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004435

NM_007931

RefSeq (белок)

NP_004426

NP_031957

Расположение (UCSC)Chr 9: 128,82 - 128,82 МбChr 2: 30.17 - 30.17 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эндонуклеаза G, митохондриальная является фермент что у людей кодируется ЭНДОГ ген.[5][6] Этот белок в первую очередь участвует в каспазно-независимом апоптозе через деградацию ДНК при перемещении из митохондрии в ядро ​​в условиях окислительного стресса.[7] В результате EndoG был вовлечен в рак, старение и нейродегенеративные заболевания Такие как Болезнь Паркинсона (PD). Таким образом, регулирование уровней его экспрессии имеет потенциал для лечения или улучшения этих состояний.[7][8]

Структура

Фермент, кодируемый этим геном, является членом консервативного семейства неспецифических ДНК / РНК ββα-Me-finger нуклеаз и обладает уникальной селективностью по участку поли (dG) .poly (dC) последовательностей в двухцепочечных ДНК. Изначально белок синтезируется в виде неактивного 33 кДа. предшественник. Этот предшественник активируется протеолитическое расщепление из митохондриальная нацеливающая последовательность, таким образом продуцируя зрелый фермент массой 28 кДа, который перемещается в митохондриальную межмембранное пространство, где он образует активный гомодимер.[9][10][11] Мотив H-N-N (His-141, Asn-163, Asn-172) имеет решающее значение для белка каталитический функция и субстратная специфичность, и His-141 аминокислота необходимо для магний координация. Аминокислота Asn-251 также является каталитической, а Glu-271 - еще одним магнием. лиганд, но оба расположены далеко от мотива H-N-N и, таким образом, их взаимодействия неясны.[11]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой кодируемую ядром эндонуклеазу, локализованную в межмембранном пространстве митохондрий.[6][12] Кодируемый белок широко распространен среди животных и расщепляет ДНК по участкам GC. Этот белок способен генерировать праймеры РНК, необходимые для ДНК-полимеразы гамма, чтобы инициировать репликацию митохондриальная ДНК.[6]В некоторых путях апоптоза EndoG высвобождается из митохондрии и мигрирует в ядро, где разрушается. хроматин с помощью других ядерных белков.[7][9][11] На одном таком пути каспаза -независимый апоптоз, E3 лигаза C-терминал белка взаимодействующего с Hsc-70 (CHIP), регулятора экспрессии EndoG, действует как защитный механизм против окислительного стресса. В нормальных условиях EndoG остается связанным с Hsp70 и CHIP; однако при окислительном стрессе EndoG диссоциирует от Hsp70 и CHIP и перемещается в ядро, где разрушает ДНК, вызывая апоптоз. Следовательно, поддержание низких уровней EndoG может предотвратить гибель клеток, вызванную стрессовыми условиями.[13] В эпителиальных клетках ядерная локализация и проапоптотическая функция EndoG заставляет его играть роль в клеточном старении.[10]Помимо деградации ДНК, EndoG также стимулирует ингибиторы белков апоптоза (IAP) к белкам-мишеням для протеасомная деградация.[14]

Клиническое значение

Фермент эндонуклаза G является важным компонентом апоптотической передачи сигналов и окислительный стресс, особенно как часть пути гибели митохондрий и передачи сигналов апоптоза сердечных миоцитов.[15] Запрограммированная гибель клеток - это отдельный генетический и биохимический путь, необходимый для многоклеточных животных. Для успешного эмбрионального развития и поддержания нормального тканевого гомеостаза необходим интактный путь смерти. Доказано, что апоптоз тесно связан с другими важными клеточными путями. Выявление критических контрольных точек на пути клеточной смерти дало фундаментальное понимание фундаментальной биологии, а также предоставило рациональные цели для новых терапевтических средств. эмбриологический процессов или во время повреждения клеток (например, ишемия-реперфузия во время сердечные приступы и удары ) или во время разработки и процессов в рак, апоптотическая клетка претерпевает структурные изменения, включая сжатие клеток, образование пузырей плазматической мембраны, ядерную конденсацию и фрагментацию ДНК и ядро. Далее следует фрагментация на апоптотические тельца, которые быстро удаляются фагоциты, тем самым предотвращая воспалительный отклик.[16] Это способ гибели клеток, определяемый характерными морфологическими, биохимическими и молекулярными изменениями. Сначала он был описан как «усадочный некроз», а затем этот термин был заменен на апоптоз, чтобы подчеркнуть его противоположную роль. митоз в кинетике тканей. На более поздних стадиях апоптоза вся клетка становится фрагментированной, образуя ряд апоптотических тел, связанных с плазматической мембраной, которые содержат ядерные и / или цитоплазматические элементы. Ультраструктурный вид некроз Совершенно иначе, основными признаками которого являются набухание митохондрий, разрушение плазматической мембраны и распад клеток. Апоптоз встречается во многих физиологический и патологический процессы. Он играет важную роль во время эмбриональный развитие как запрограммированная гибель клеток и сопровождает множество нормальных инволюционных процессов, в которых оно служит механизмом для удаления «нежелательных» клеток.

Путь BNIP3 включает высвобождение митохондрий и ядерную транслокацию эндонуклеазы G.[17][18] Однако неясно, как BNIP3 взаимодействует с митохондриями. Было показано, что BNIP3 взаимодействует с зависимый от напряжения анионный канал (VDAC), чтобы напрямую вызвать митохондриальный выброс и ядерную транслокацию эндонуклеазы G. Данные идентифицировали VDAC как взаимодействующего партнера BNIP3 и предоставляют прямые доказательства того, что EndoG является медиатором пути гибели клеток BNIP3.[19] В частности, эноднуклеаза G играет ключевую роль во время окислительного стресса, вызванного ишемией-реперфузионным повреждением, особенно в миокарде как части острое сердечно-сосудистое заболевание (также известен как ишемическая болезнь сердца ). Ишемическая болезнь сердца, возникающая в результате окклюзия одного из главных коронарные артерии, в настоящее время по-прежнему является основной причиной болезненность и смертность в западном обществе.[20][21] Во время ишемической реперфузии высвобождение АФК вносит существенный вклад в повреждение и гибель клеток посредством прямого воздействия на клетки, а также посредством сигналов апоптоза. В последнее время эндонуклеаза G считается определяющим фактором гипертрофии сердца. Была установлена ​​связь между эндонуклеазой G и митохондриальной функцией во время гипертрофии сердца, отчасти за счет эффектов Endo G на Mfn2 и Jp2, и была выявлена ​​роль эндонуклеазы G в перекрестных помехах между процессами, контролируемыми Mfn2 и Jp2 в неадаптивной сердечная гипертрофия.[22]

В предыдущих исследованиях сообщалось о большей эффективности противоопухолевых препаратов при использовании в сочетании с высокими уровнями EndoG. Таким образом, регуляторы EndoG, такие как CHIP, могут служить терапевтическими мишенями для вызванной окислительным стрессом гибели клеток при раке и старении.[13] Благодаря своей ассоциации со старением эпителиальных клеток, EndoG также может способствовать возрастному сосудистые заболевания Такие как атеросклероз.[10] По аналогии, миоядерный локализация EndoG коррелирует с атрофированный старение скелетные мышцы, что приводит к усилению апоптотических сигналов и потере мышечной массы. EndoG также вовлечен в болезнь Паркинсона (БП), поскольку он вызывает фрагментацию ДНК в нейронах при перемещении из митохондрий в ядра. Этот механизм включает кинурениновый путь и поры перехода проницаемости; как таковые, нацеленные молекулы в этом пути могут предотвращать опосредованную EndoG гибель клеток и эффективно помогать в лечении БП у пациентов.[8] Аналогично EndoG сбить у мышей смягчены травматические оскорбления; таким образом, терапевтические стратегии ингибирования или подавления EndoG могут помочь защитить ткани во время травм и болезней. Пока что два ингибитора EndoG, PNR-3-80 (5 - ((1- (2-нафтоил) -5-хлор-1H-индол-3-ил) метилен) -2-тиоксодигидропиримидин-4,6 (1H, 5H) -дион) и PNR-3-82 (5 - ((1- (2-нафтоил) -5-метокси-1H-индол-3-ил) метилен) -2-тиоксодигидропиримидин-4,6 (1H, 5H ) -dione, были протестированы и подтверждены.[9]

Взаимодействия

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167136 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015337 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Тиранти В., Росси Е., Руис-Каррильо А., Росси Г., Рокки М., ДиДонато С., Дзуффарди О., Зевиани М. (январь 1995 г.). «Хромосомная локализация митохондриального фактора транскрипции A (TCF6), одноцепочечного ДНК-связывающего белка (SSBP) и эндонуклеазы G (ENDOG), трех генов домашнего хозяйства человека, участвующих в митохондриальном биогенезе». Геномика. 25 (2): 559–64. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80058-Т. PMID  7789991.
  6. ^ а б c «Энтрез Ген: эндонуклеаза G ENDOG».
  7. ^ а б c Варжеча М., Потешилова М., Матула П., Козубек М. (апрель 2012 г.). «Эндонуклеаза G взаимодействует с гистоном H2B и ДНК-топоизомеразой II альфа во время апоптоза». Молекулярная и клеточная биохимия. 363 (1–2): 301–7. Дои:10.1007 / s11010-011-1182-х. PMID  22160858. S2CID  8274092.
  8. ^ а б Büttner S, Habernig L, Broeskamp F, Ruli D, Vögtle FN, Vlachos M, Macchi F, Küttner V, Carmona-Gutierrez D, Eisenberg T, Ring J, Markaki M, Taskin AA, Benke S, Ruckenstuhl C, Braun R, Ван ден Хауте С., Бамменс Т., ван дер Перрен А., Фрёлих К.Ю., Виндерикс Дж., Кремер Дж., Бекеландт В., Тавернаракис Н., Ковач Г. Г., Денгель Дж., Мейзингер С., Сигрист С. Дж., Мадео Ф (ноябрь 2013 г.). «Эндонуклеаза G опосредует цитотоксичность альфа-синуклеина при болезни Паркинсона». Журнал EMBO. 32 (23): 3041–54. Дои:10.1038 / emboj.2013.228. ЧВК  3844953. PMID  24129513.
  9. ^ а б c Jang DS, Penthala NR, Apostolov EO, Wang X, Crooks PA, Basnakian AG (февраль 2015 г.). «Новые цитопротективные ингибиторы апоптотической эндонуклеазы G». ДНК и клеточная биология. 34 (2): 92–100. Дои:10.1089 / dna.2014.2530. ЧВК  4308826. PMID  25401220.
  10. ^ а б c Динер Т., Нойхаус М., Козиль Р., Микуткова Л., Янсен-Дюрр П. (август 2010 г.). «Роль эндонуклеазы G в гибели эндотелиальных клеток человека, связанной со старением» (PDF). Экспериментальная геронтология. 45 (7–8): 638–44. Дои:10.1016 / j.exger.2010.03.002. PMID  20211237. S2CID  29458796.
  11. ^ а б c Wu SL, Li CC, Chen JC, Chen YJ, Lin CT, Ho TY, Hsiang CY (15 января 2009 г.). «Мутагенез определяет критические аминокислотные остатки человеческой эндонуклеазы G, участвующие в катализе, координации магния и субстратной специфичности». Журнал биомедицинских наук. 16: 6. Дои:10.1186/1423-0127-16-6. ЧВК  2653514. PMID  19272175.
  12. ^ Галлуцци Л., Джоза Н., Тасдемир Э., Майури М.С., Хенгартнер М., Абрамс Дж. М., Тавернаракис Н., Пеннингер Дж., Мадео Ф., Кремер Дж. (Июль 2008 г.). «Нет смерти без жизни: жизненные функции апоптозных эффекторов». Гибель клеток и дифференциация. 15 (7): 1113–23. Дои:10.1038 / cdd.2008.28. ЧВК  2917777. PMID  18309324.
  13. ^ а б Ли Дж.С., Со Т.В., Йи Дж.Х., Шин К.С., Ю С.Дж. (13 июня 2013 г.). «ЧИП играет защитную роль против вызванной окислительным стрессом гибели клеток посредством специфической регуляции эндонуклеазы G».. Смерть и болезнь клеток. 4 (6): e666. Дои:10.1038 / cddis.2013.181. ЧВК  3698548. PMID  23764847.
  14. ^ Seo TW, Lee JS, Yoo SJ (сентябрь 2014 г.). «Клеточный ингибитор белка апоптоза 1 убиквитинирует эндонуклеазу G, но не влияет на гибель клеток, опосредованную эндонуклеазой G». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 451 (4): 644–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.08.047. PMID  25139236.
  15. ^ Даниал Н.Н., Корсмейер С.Дж. (январь 2004 г.). «Смерть клетки: критические контрольные точки». Клетка. 116 (2): 205–19. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00046-7. PMID  14744432. S2CID  10764012.
  16. ^ Керр Дж. Ф., Уилли А. Х., Карри А. Р. (август 1972 г.). «Апоптоз: основное биологическое явление с широким спектром влияния на кинетику тканей». Британский журнал рака. 26 (4): 239–57. Дои:10.1038 / bjc.1972.33. ЧВК  2008650. PMID  4561027.
  17. ^ Zhao ST, Chen M, Li SJ, Zhang MH, Li BX, Das M, Bean JC, Kong JM, Zhu XH, Gao TM (8 сентября 2009 г.). «Митохондриальная активация BNIP3 предшествует транслокации эндонуклеазы G в нейронах гиппокампа после кислородно-глюкозной депривации». BMC Neuroscience. 10: 113. Дои:10.1186/1471-2202-10-113. ЧВК  2749049. PMID  19737385.
  18. ^ Чжан З., Ян Х, Чжан С., Ма Х, Конг Дж. (Май 2007 г.). «Повышение регуляции BNIP3 и транслокация EndoG в отсроченной гибели нейронов при инсульте и гипоксии». Инсульт: журнал церебрального кровообращения. 38 (5): 1606–13. Дои:10.1161 / STROKEAHA.106.475129. PMID  17379825.
  19. ^ Чжан X, Бянь X, Kong J (2014). «Проапоптотический белок BNIP3 взаимодействует с VDAC, вызывая митохондриальное высвобождение эндонуклеазы G». PLOS ONE. 9 (12): e113642. Дои:10.1371 / journal.pone.0113642. ЧВК  4249980. PMID  25436615.
  20. ^ Мюррей CJ, Лопес AD (май 1997 г.). «Альтернативные прогнозы смертности и инвалидности с разбивкой по причинам 1990-2020: Исследование глобального бремени болезней». Ланцет. 349 (9064): 1498–504. Дои:10.1016 / S0140-6736 (96) 07492-2. PMID  9167458. S2CID  10556268.
  21. ^ Браунвальд Э., Клонер Р.А. (ноябрь 1985 г.). «Реперфузия миокарда: палка о двух концах?». Журнал клинических исследований. 76 (5): 1713–9. Дои:10.1172 / JCI112160. ЧВК  424191. PMID  4056048.
  22. ^ Лян Х, Ма К., Рао Й, Хун Д., Хо З, Е З, Хуанг М., Чжан Х, Чжао Q (сентябрь 2015 г.). «Характеристика эндонуклеазы G и белков, связанных с митохондриально-саркоплазматическим ретикулумом во время сердечной гипертрофии». Die Pharmazie. 70 (9): 586–92. PMID  26492643.

дальнейшее чтение