Белок-регулятор метаболизма жирных кислот FadR - Википедия - Fatty acid metabolism regulator protein FadR
| С-концевой домен FadR | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 fadr, фактор транскрипции, чувствительный к жирным кислотам из e. coli в комплексе с оператором fadb | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | FadR_C | ||||||||
| Pfam | PF07840 | ||||||||
| Pfam клан | CL0388 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR008920 | ||||||||
| SCOP2 | 1х9г / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии белок регулятора метаболизма жирных кислот FadR, это бактериальный фактор транскрипции.
Бактерии регулируют мембрана плавность, манипулируя относительными уровнями насыщенный и ненасыщенные жирные кислоты в пределах фосфолипиды их мембранных бислоев. В кишечная палочка, фактор транскрипции, FadR, функционирует как переключатель, который координирует регулирует оборудование, необходимое для жирная кислота бета-окисление и выражение ключа фермент в биосинтез жирных кислот. Этот единственный [репрессор контролирует транскрипция всего причуда регулон.[1] Связывание fadR специфически ингибируется длинноцепочечными жирными ацил-КоА соединения.
В Кристальная структура FadR обнаруживает два домен димерный молекула где N-концевой домен крылатой спирали связывает ДНК, а C-терминал домен связывает ацил-КоА.[1] Связывание ацил-КоА с С-концевым доменом приводит к конформационное изменение который влияет на аффинность связывания ДНК N-концевого домена.[2]
FadR является членом Семья GntR из бактериальный регуляторы транскрипции. ДНК-связывающий домен в порядке консервированный для этого семейства, тогда как C-концевой эффектор-связывающий домен более вариабелен и, следовательно, используется для определения подсемейств GntR.[3] Группа FadR является самой крупной подгруппой и характеризуется полностьюспиральный С-концевой домен состоит из 6-7 альфа спирали.[2]
Рекомендации
- ^ а б Сюй Й, Хит Р.Дж., Ли З., Рок-Колледж, Уайт-ЮЗ (май 2001 г.). «Комплекс FadR.DNA. Транскрипционный контроль метаболизма жирных кислот у Escherichia coli». J. Biol. Chem. 276 (20): 17373–9. Дои:10.1074 / jbc.M100195200. PMID 11279025.
- ^ а б van Aalten DM, DiRusso CC, Knudsen J, Wierenga RK (октябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура FadR, фактора транскрипции, чувствительного к жирным кислотам, с новой складкой связывания ацилкофермента А». EMBO J. 19 (19): 5167–77. Дои:10.1093 / emboj / 19.19.5167. ЧВК 302096. PMID 11013219.
- ^ Ригали С., Деруо А., Джаннотта Ф., Дусарт Дж. (Апрель 2002 г.). «Подразделение семейства бактериальных регуляторов GntR спираль-поворот-спираль в подсемейства FadR, HutC, MocR и YtrA». J. Biol. Chem. 277 (15): 12507–15. Дои:10.1074 / jbc.M110968200. PMID 11756427.