Домен вилки - Fork head domain

Домен вилки
PDB 2hfh EBI.jpg
Структура белка крылатой спирали Генезис.[1]
Идентификаторы
СимволFork_head
PfamPF00250
ИнтерПроIPR001766
УМНАЯSM00339
PROSITEPDOC00564
SCOP22hfh / Объем / СУПФАМ
CDDcd00059

В домен головки вилки это тип белковый домен что часто встречается в факторы транскрипции и чья цель - связать ДНК.[2]

Функция

Белок головки вилки Drosophila melanogaster, фактор транскрипции, который способствует терминальному, а не сегментарному развитию, не содержит ни гомеодомены ни цинковые пальцы характеристика других факторов транскрипции.[3] Вместо этого он содержит особый тип ДНК-связывающая область, содержащий около 100 аминокислот, которые с тех пор были идентифицированы в ряде факторов транскрипции (включая D. melanogaster FD1-5, млекопитающее HNF3, человек HTLF, Saccharomyces cerevisiae HCM1 и др.). Это называется доменом головки вилки, но также известен как "крылатая спираль ".[3][4][5] Домен головки вилки связывает B-ДНК как мономер,[4] но не проявляет сходства с ранее идентифицированным ДНК-связывающим мотивы. Хотя этот домен обнаружен в нескольких различных факторах транскрипции, их общей функцией является их участие в решениях о судьбе клеток на раннем этапе развития. эмбриогенез.[5] Члены класса O факторов транскрипции боксов вилки (FoxO) играют важную роль в метаболизме, клеточной пролиферации, стрессоустойчивости и, вероятно, продолжительности жизни.[6]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Марсден И., Джин С., Ляо Х (май 1998 г.). «Структурные изменения в области, непосредственно примыкающей к ДНК-связывающей спирали, подчеркивают возможный механизм, объясняющий наблюдаемые изменения в последовательном связывании белков крылатой спирали». J. Mol. Биол. 278 (2): 293–9. Дои:10.1006 / jmbi.1998.1703. PMID  9571051.
  2. ^ Кауфманн Э., Кнёхель В. (июнь 1996 г.). «Пять лет на крыльях вилочной головы». Мех. Dev. 57 (1): 3–20. Дои:10.1016/0925-4773(96)00539-4. PMID  8817449. S2CID  18056224.
  3. ^ а б Weigel D, Jürgens G, Küttner F, Seifert E, Jäckle H (май 1989 г.). «Головка вилки гомеотического гена кодирует ядерный белок и экспрессируется в концевых областях эмбриона дрозофилы». Клетка. 57 (4): 645–58. Дои:10.1016/0092-8674(89)90133-5. PMID  2566386.
  4. ^ а б Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (июль 1993 г.). «Сокристаллическая структура ДНК-распознавающего мотива HNF-3 / вилки головы напоминает гистон H5». Природа. 364 (6436): 412–20. Дои:10.1038 / 364412a0. PMID  8332212. S2CID  4363526.
  5. ^ а б Häcker U, Grossniklaus U, Gehring WJ, Jäckle H (сентябрь 1992 г.). "Онтогенетически регулируемое семейство генов дрозофилы, кодирующих домен головы вилки". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (18): 8754–8. Дои:10.1073 / пнас.89.18.8754. ЧВК  49999. PMID  1356269.
  6. ^ ван дер Хорст А., Burgering BM (июнь 2007 г.). «Подчеркивая роль белков FoxO в продолжительности жизни и болезнях». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 8 (6): 440–50. Дои:10.1038 / nrm2190. PMID  17522590. S2CID  31546098.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001766