ГАЛНТ1 - GALNT1

ГАЛНТ1
Белок GALNT1 PDB 1xhb.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыГАЛНТ1, GALNAC-T1, полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602273 MGI: 894693 ГомолоГен: 8469 Генные карты: ГАЛНТ1
Расположение гена (человек)
Хромосома 18 (человек)
Chr.Хромосома 18 (человек)[1]
Хромосома 18 (человек)
Геномное расположение GALNT1
Геномное расположение GALNT1
Группа18q12.2Начните35,581,117 бп[1]
Конец35,711,834 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GALNT1 201722 s at fs.png

PBB GE GALNT1 201723 s at fs.png

PBB GE GALNT1 201724 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_020474

NM_001160404
NM_013814
NM_001361200

RefSeq (белок)

NP_065207

NP_001153876
NP_038842
NP_001348129

Расположение (UCSC)Chr 18: 35,58 - 35,71 МбChr 18: 24.21 - 24.29 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза 1 является фермент что в люди кодируется ГАЛНТ1 ген.[5][6][7]

Этот ген кодирует член UDP-N-ацетил-альфа-D-галактозамин:полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза Семейство ферментов (GalNAc-T). GalNAc-Ts инициировать муцин -тип O-связанный гликозилирование в аппарат Гольджи от катализирующий перенос GalNAc в серин и треонин остатки на мишени белки. Они характеризуются N-концевой трансмембранный домен, стволовая область, просвет каталитического домена, содержащий мотив GT1 и Gal / GalNAc трансфераза мотив, и С-конец рицин /лектин -подобный домен. GalNAc-Ts разные, но перекрывающиеся, особенности субстрата и образцы выражения. Варианты транскриптов, происходящие от этого гена, которые используют альтернативные сигналы полиА, описаны в литературе.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000141429 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000000420 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Белый Т., Беннетт Е.П., Такио К., Соренсен Т., Бондинг Н., Клаузен Х (декабрь 1995 г.). «Очистка и клонирование кДНК человеческого UDP-N-ацетил-альфа-D-галактозамина: полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансферазы». J Biol Chem. 270 (41): 24156–65. Дои:10.1074 / jbc.270.41.24156. PMID  7592619.
  6. ^ Тенно М., Тоба С., Кезды Ф.Дж., Эльхаммер А.П., Куросака А. (август 2002 г.). «Идентификация двух остатков цистеина, участвующих в связывании UDP-GalNAc с UDP-GalNAc: полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза 1 (GalNAc-T1)». Eur J Biochem. 269 (17): 4308–16. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.03123.x. PMID  12199709.
  7. ^ а б «Ген Entrez: GALNT1 UDP-N-ацетил-альфа-D-галактозамин: полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза 1 (GalNAc-T1)».

дальнейшее чтение