GTF2H5 - GTF2H5

GTF2H5
Белок GTF2H5 PDB 1ydl.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыGTF2H5, C6orf175, TFB5, TFIIH, TGF2H5, TTD, TTD-A, TTDA, bA120J8.2, TTD3, ​​субъединица 5 общего фактора транскрипции IIH
Внешние идентификаторыOMIM: 608780 MGI: 107227 ГомолоГен: 45635 Генные карты: GTF2H5
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение GTF2H5
Геномное расположение GTF2H5
Группа6q25.3Начинать158,168,350 бп[1]
Конец158,199,344 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GTF2H5 213357 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_207118

NM_181392
NM_001357804

RefSeq (белок)

NP_997001

NP_852057
NP_001344733

Расположение (UCSC)Chr 6: 158.17 - 158,2 МбChr 17: 6.08 - 6.09 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица 5 общего транскрипционного фактора IIH это белок что у людей кодируется GTF2H5 ген.[5][6]

Функция

В GTF2H5 (TTDA) ген кодирует небольшой (71 аминокислота) белок, который стабилизирует мульти-субъединицу фактор репарации транскрипции IIH (TFIIH). TFIIH играет ключевую роль в крупном Ремонт ДНК процесс, эксцизионная репарация нуклеотидов (NER), открывая двойную спираль ДНК после первоначального распознавания повреждения в одной цепи. За этим этапом следует иссечение поврежденной области для создания одноцепочечного разрыва, а затем репарационный синтез с использованием неповрежденной цепи в качестве матрицы для точного заполнения промежутка. Нарушение GTF2H5 (TTDA) ген в нокаутирующая мышь -модель полностью инактивирует NER.[7] У людей мутация в любом из четырех генов может вызвать трихотиодистрофия фенотип. Эти гены TTDN1, XPB, XPD и GTF2H5 (TTDA).[7]

Взаимодействия

GTF2H5 был показан взаимодействовать с GTF2H2[5][8] и XPB.[5]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000272047 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034345 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (июнь 2004 г.). «Новая десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А». Nat. Genet. 36 (7): 714–9. Дои:10,1038 / ng1387. PMID  15220921.
  6. ^ «Ген Entrez: общий фактор транскрипции GTF2H5 IIH, полипептид 5».
  7. ^ а б Тейл А.Ф., Hoeijmakers JH, Vermeulen W (2014). «TTDA: большое влияние маленького протеина». Exp. Cell Res. 329 (1): 61–8. Дои:10.1016 / j.yexcr.2014.07.008. PMID  25016283.
  8. ^ Vermeulen W, Bergmann E, Auriol J, Rademakers S, Frit P, Appeldoorn E, Hoeijmakers JH, Egly JM (ноябрь 2000 г.). «Сублимитирующая концентрация фактора транскрипции / репарации ДНК TFIIH вызывает трихотиодистрофическое расстройство TTD-A». Nat. Genet. 26 (3): 307–13. Дои:10.1038/81603. PMID  11062469. S2CID  25233797.

дальнейшее чтение