LysM домен - LysM domain

LysM домен
PDB 1e0g EBI.jpg
Идентификаторы
СимволLysM
PfamPF01476
ИнтерПроIPR000644
УМНЫЙLysM
PROSITEPS51782
SCOP21e0g / Объем / СУПФАМ
CDDcd00118
Мембранома1306

В молекулярная биология то LysM домен это белковый домен найдено в самых разных внеклеточный белки и рецепторы. Домен LysM назван в честь мотива Lysin, который был первоначальным названием, данным мотив последовательности идентифицированы в бактериальных белках. Этот регион был первоначально идентифицирован как C-концевой повтор, обнаруженный в Enterococcus hirae мурамидаза.[1] Домен LysM обнаружен в широком спектре микробных внеклеточных белков, причем предполагается, что домен LysM обеспечивает закрепление за внеклеточными белками. полисахариды такие как пептидогликан и хитин. Домены LysM также обнаруживаются в рецепторах растений, включая NFP, рецептор для Нод-фактор что необходимо для корневой узелок симбиоз между бобовыми и симбиотические бактерии.[2] Домен LysM обычно имеет длину от 44 до 65 аминокислотных остатков.[3] Структура домена LysM показала, что он состоит из пары антипараллельных бета-цепей, разделенных парой коротких альфа спирали.[4]

Смотрите также

Нод-фактор

использованная литература

  1. ^ Джорис Б., Энглеберт С., Чу С.П., Карияма Р., Данео-Мур Л., Шокман Г.Д., Гуизен Дж.М. (март 1992 г.). «Модульная конструкция мурамидазы-2 Enterococcus hirae и автолизина Streptococcus faecalis». Письма о микробиологии FEMS. 70 (3): 257–64. Дои:10.1016 / 0378-1097 (92) 90707-у. PMID  1352512.
  2. ^ Арриги, Жан-Франсуа; Барре, Анник; Бен Амор, Бесма; Берсоулт, Энн; Сориано, Лидия Кампос; Мирабелла, Россана; де Карвалью-Нибель, Фернанда; Журне, Этьен-Паскаль; Герарди, Мишель; Юге, Тьерри; Geurts, Рене (2006). «Семейство генов киназ, подобных рецептору лизина, мотива Medicago truncatula, включает в себя NFP и новые гены, экспрессирующие узелки». Физиология растений. 142 (1): 265–279. Дои:10.1104 / стр.106.084657. ISSN  0032-0889. ЧВК  1557615. PMID  16844829.
  3. ^ Buist G, Steen A, Kok J, Kuipers OP (май 2008 г.). «LysM, широко распространенный белковый мотив для связывания с (пептидо) гликанами». Молекулярная микробиология. 68 (4): 838–47. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2008.06211.x. PMID  18430080.
  4. ^ Бейтман А., Байкрофт М. (июнь 2000 г.). «Структура домена LysM из мембраносвязанной литической муреинтрансгликозилазы D (MltD) E. coli». Журнал молекулярной биологии. 299 (4): 1113–9. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3778. PMID  10843862.