MED26 - MED26
| Med26 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура раствора n-концевого домена i мышиного фактора элонгации транскрипции s-ii белка 3 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | N-концевой домен Med26 | ||||||||
| Pfam | PF08711 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR017923 | ||||||||
| |||||||||
| Медиаторная субъединица 26 Средний домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Med26_M | ||||||||
| Pfam | PF15694 | ||||||||
| |||||||||
| Медиаторная субъединица 26 С-концевой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Med26_C | ||||||||
| Pfam | PF15693 | ||||||||
| |||||||||
Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 26 является фермент что у людей кодируется MED26 ген.[5][6]Он является частью Медиаторный комплекс.
Активация транскрипции генов - это многоступенчатый процесс, который запускается факторами, распознающими сайты энхансеров транскрипции в ДНК. Эти факторы работают с коактиваторами, направляя инициацию транскрипции аппаратом РНК-полимеразы II. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса CRSP (кофактор, необходимый для активации SP1), который, наряду с TFIID, необходим для эффективной активации SP1. Этот белок также является компонентом других мультисубъединичных комплексов, например. Белки, связанные с рецептором тироидного гормона (TR-), которые взаимодействуют с TR и облегчают функцию TR на матрице ДНК в сочетании с факторами инициации и кофакторами.[6]
Мероприятия
MED26 - это транскрипция коэффициент удлинения что увеличивает общий транскрипция скорость РНК полимераза II путем реактивации транскрипция комплексы удлинения, которые задержали транскрипция. Он делает это посредством рекрутирования комплексов, содержащих ELL / EAF и P-TEFb, на промоторы через прямое взаимодействие с N-концевым доменом (NTD). MED26 NTD также связывает TFIID, а TFIID и комплексы элонгации взаимодействуют с MED26 через перекрывающиеся сайты связывания.[7]MED26 NTD может функционировать как молекулярный переключатель, способствующий переходу Pol II в продуктивную элонгацию.
Три структурные области TFIIS являются консервированный из дрожжи к человек. 80 или около того N-терминал остатки сформировать белок взаимодействие домен содержащий консервативный мотив, который получил название LW мотив из-за инварианта лейцин и триптофан остатки, которые он содержит. Хотя N-концевой домен не нужен для транскрипционный деятельность, аналогичная последовательность был обнаружен в других факторы транскрипции и белки которые преимущественно ядерный локализованный ,:[8][9]
- MED26 (также известный как CRSP70 и ARC70), субъединица комплекса медиатора, которая необходима для активности энхансер-связывающего белка Sp1.
- Элонгин А, субъединица фактора элонгации транскрипции, ранее известного как SIII. Он увеличивает скорость транскрипции, подавляя временную паузу в элонгации. сложный.
- PPP1R10, ядерный регулирующий субъединица белка фосфатаза 1, который ранее был известен как p99, FB19 или PNUTS.
- PIBP, небольшой гипотетический белок, который может быть фосфоинозитид привязка белок.
- IWS1, который, как считается, работает в обоих инициация транскрипции и удлинение. N-концевой домен TFIIS представляет собой компактный четырехспиральный пучок. В гидрофобное ядро остатки спирали 2, 3 и 4 хорошо сохраняются среди доменов TFIIS, хотя спираль 1 менее консервативен.[9]
Взаимодействия
MED26 был показан взаимодействовать с MED8,[10] Циклинзависимая киназа 8,[10] POLR2A,[10] MED12[10] и MED28.[10] Он также действует синергетически, опосредуя взаимодействие между ОТДЫХ (фактор транскрипции «цинковые пальцы» типа Круппеля, который связывается с элементом сайленсинга RE1 длиной 21 п.н., присутствующим в более чем 900 генах человека) и медиатор.[11]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105085 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045248 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Рю С., Чжоу С., Ladurner AG, Tjian R (февраль 1999 г.). «Транскрипционный кофакторный комплекс CRSP необходим для активности энхансер-связывающего белка Sp1». Природа. 397 (6718): 446–50. Дои:10.1038/17141. PMID 9989412. S2CID 4405569.
- ^ а б «Ген Entrez: кофактор CRSP7, необходимый для активации транскрипции Sp1, субъединица 7, 70 кДа».
- ^ Такахаши Х., Пармели Т.Дж., Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Конг С.Е. и др. (2011). «Человеческая медиаторная субъединица MED26 функционирует как стыковочный сайт для факторов элонгации транскрипции». Клетка. 146 (1): 92–104. Дои:10.1016 / j.cell.2011.06.005. ЧВК 3145325. PMID 21729782.
- ^ Стенд V, Кот CM, Эдвардс AM, Эроусмит CH (октябрь 2000 г.). «Структура консервативного домена, общего для факторов транскрипции TFIIS, элонгина А и CRSP70». J. Biol. Chem. 275 (40): 31266–8. Дои:10.1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- ^ а б Линь Y, Смит AJ, Морган GT (2006). «Мотив последовательности, консервативный в различных ядерных белках, идентифицирует домен взаимодействия белков, используемый для ядерного нацеливания TFIIS человека». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (8): 2219–29. Дои:10.1093 / нар / gkl239. ЧВК 1450333. PMID 16648364.
- ^ а б c d е Сато С., Томомори-Сато К., Пармели Т.Дж., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Суонсон С.К., Бэнкс Калифорния, Джин Дж., Цай Й., Уошберн М.П., Конавей Д.В., Конавей Р.К. (июнь 2004 г.). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Мол. Клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- ^ Динг Н., Томомори-Сато К., Сато С., Конавей Р.С., Конавей Д.В., Бойер Т.Г. (январь 2009 г.). «MED19 и MED26 являются синергетическими функциональными мишенями фактора транскрипции, подавляющего подавление RE1, при эпигенетическом подавлении экспрессии нейрональных генов». J. Biol. Chem. 284 (5): 2648–56. Дои:10.1074 / jbc.M806514200. ЧВК 2631966. PMID 19049968.
дальнейшее чтение
- Näär AM, Beaurang PA, Zhou S и др. (1999). «Комбинированный коактиватор ARC опосредует активацию транскрипции, направленную на хроматин». Природа. 398 (6730): 828–32. Дои:10.1038/19789. PMID 10235267. S2CID 23646963.
- Стенд V, Кот CM, Эдвардс AM, Эроусмит CH (2000). «Структура консервативного домена, общего для факторов транскрипции TFIIS, элонгина А и CRSP70». J. Biol. Chem. 275 (40): 31266–8. Дои:10.1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- Näär AM, Taatjes DJ, Zhai W и др. (2002). «CRSP человека взаимодействует с CTD РНК-полимеразы II и принимает специфическую конформацию, связанную с CTD». Genes Dev. 16 (11): 1339–44. Дои:10.1101 / gad.987602. ЧВК 186316. PMID 12050112.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния и др. (2004). «Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster в млекопитающем интерсексе является субъединицей медиаторного комплекса млекопитающих». J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
- Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, et al. (2004). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Мо Х, Ковенц-Лойц Э, Сюй Х., Лойц А (2004). «Ras индуцирует обмен медиаторного комплекса на C / EBP beta». Мол. Клетка. 13 (2): 241–50. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00521-5. PMID 14759369.
- Сато С., Томомори-Сато С., Пармели Т.Дж. и др. (2004). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Мол. Клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- Чжан X, Крутчинский А., Фукуда А. и др. (2005). «MED1 / TRAP220 существует преимущественно в субпопуляции TRAP / медиатора, обогащенной РНК-полимеразой II, и необходим для ER-опосредованной транскрипции». Мол. Клетка. 19 (1): 89–100. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.05.015. PMID 15989967.
- Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.