NDUFAF1 - NDUFAF1

NDUFAF1
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFAF1, CGI65, CIA30, CGI-65, NADH: фактор сборки комплекса убихинон оксидоредуктазы 1, MC1DN11
Внешние идентификаторы	OMIM: 606934 MGI: 1916952 ГомолоГен: 32289 Генные карты: NDUFAF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	41,402,519 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	119,662,827 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• развернутое связывание с белками; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• митохондриальная внутренняя мембрана; • митохондриальный комплекс дыхательной цепи I; • митохондрия; • цитозоль; • митохондриальный матрикс;
Биологический процесс	• транспорт электронов в митохондриях, НАДН в убихинон; • сборка комплекса I митохондриальной дыхательной цепи; • сборка макромолекулярного комплекса;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	51103
	69702
	ENSG00000137806
	ENSMUSG00000027305
	Q9Y375
	Q9CWX2
	NM_016013
	NM_027175; NM_001356467
	NP_057097
	NP_081451; NP_001343396
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Комплекс I промежуточно-ассоциированный белок 30, митохондриальный (CIA30), или же Фактор сборки 1 альфа субкомплекса НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 (NDUFAF1), это белок что у людей кодируется NDUFAF1 или же CIA30 ген.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9] В NDUFAF1 ген кодирует человека гомолог из Neurospora crassa белок, участвующий в сборке комплекс I.^[7] Белок NDUFAF1 представляет собой фактор сборки НАДН-дегидрогеназа (убихинон) также известный как комплекс I, расположенный в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.^[10] Варианты NDUFAF1 ген связаны с гипертрофическая кардиомиопатия, лейкодистрофия и кардиоэнцефаломиопатия.^[11]^[12]^[13]

Структура

NDUFAF1 расположен на q рука хромосомы 15 в позиции 15.1.^[7] В NDUFAF1 Ген продуцирует белок 37,8 кДа, состоящий из 327 аминокислот.^[14]^[15] NDUFAF1 ассоциирован с комплексами 600 и 700 кДа.^[8] Комплекс I имеет двудольную L-образную конфигурацию, которая состоит из периферийного плеча матрицы, состоящего из флавопротеины и железо-серные белки участвует в переносе электронов, и мембранное плечо, состоящее из кодируемых мтДНК субъединиц, участвующих в убихинон восстановление и протонная накачка.^[13] NDUFAF1, как было показано, взаимодействует с промежуточными соединениями сборки и может играть роли в правильной сборке и комбинации периферического плеча с полным плечом мембраны, а также в стабилизации и каркасе этих промежуточных продуктов посредством этих тесных взаимодействий.^[8]

Функция

NDUFAF1 - фактор сборки, который важен для правильной сборки НАДН-дегидрогеназа (убихинон). Он обеспечивает правильное сочетание сложных промежуточных продуктов и необходим для правильного функционирования НАДН-дегидрогеназы (убихинона). В частности, NDUFAF1 связывается с большим промежуточным звеном мембраны и участвует в комбинации малых и больших промежуточных звеньев мембраны комплекса I. Также было высказано предположение, что NDUFAF1 участвует в стабилизации и формировании каркаса промежуточных продуктов сборки и что эта роль может быть более заметным, чем его часть в промежуточной комбинации.^[8]

Клиническое значение

Мутации в NDUFAF1 может привести к митохондриальной недостаточности и связанным с ней нарушениям. Расстройство митохондриальная дыхательная цепь может вызывать широкий спектр клинических проявлений от летального неонатального заболевания до развития у взрослых нейродегенеративные расстройства. Фенотипы включают макроцефалия с прогрессивным лейкодистрофия, неспецифический энцефалопатия, кардиомиопатия, миопатия, болезнь печени, Синдром Ли, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, и некоторые формы болезнь Паркинсона.^[16]

У пациента с миссенс-мутации в NDUFAF1, летальный детский гипертрофическая кардиомиопатия был поставлен диагноз. В данном случае разборка комплекса I привела к митохондриальной кардиомиопатии с выраженным лактоацидоз.^[11] У другого пациента, ребенка с сложной гетерозиготной мутацией (c.278A> G; c.247G> A) в экзоне 2 гена NDUFAF1, была диагностирована лейкодистрофия, связанная с дефицитом митохондриального комплекса I. Признаки и симптомы включали регресс умственного и моторного развития, поражения белого вещества, периферическая невропатия с высоким напряжением мышц и гиперрефлексия конечностей и высокий уровень лактата и креатинкиназа. Было установлено, что родители являются гетерозиготными носителями мутации.^[12] У третьего пациента была обнаружена мутация в обоих аллели гена NDUFAF1 и был диагностирован кардиоэнцефаломиопатия и снижение уровня и активности комплекса I.^[13]

Взаимодействия

Помимо ко-комплексов, NDUFAF1 имеет белок-белковые взаимодействия с PNLIPRP1,^[17] TMEM97,^[18] TMEM86B,^[19] YIPF6,^[20] SLC30A2,^[21] ATIC,^[22] и MAGEA11.^[23]

дальнейшее чтение

Küffner R, Rohr A, Schmiede A, Krüll C, Schulte U (октябрь 1998 г.). «Вовлечение двух новых шаперонов в сборку митохондриального НАДН: убихинон оксидоредуктаза (комплекс I)». Журнал молекулярной биологии. 283 (2): 409–17. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2114. PMID 9769214.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514.
Vogel RO, Janssen RJ, van den Brand MA, Dieteren CE, Verkaart S, Koopman WJ, Willems PH, Pluk W, van den Heuvel LP, Smeitink JA, Nijtmans LG (март 2007 г.). «Цитозольный сигнальный белок Ecsit также локализуется в митохондриях, где он взаимодействует с шапероном NDUFAF1 и функционирует в сборке комплекса I.». Гены и развитие. 21 (5): 615–24. Дои:10.1101 / gad.408407. ЧВК 1820902. PMID 17344420.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
Фогель Р.О., ван ден Бранд М.А., Роденбург Р.Дж., ван ден Хеувел Л.П., Цунеока М., Смейтинк Д.А., Нийтманс Л.Г. (июнь 2007 г.). «Исследование шаперонов сборки комплекса I B17.2L и NDUFAF1 в когорте пациентов с дефицитом CI». Молекулярная генетика и метаболизм. 91 (2): 176–82. Дои:10.1016 / j.ymgme.2007.02.007. PMID 17383918.
Даннинг CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (июль 2007 г.). «Человеческий CIA30 участвует в ранней сборке митохондриального комплекса I, и мутации в его гене вызывают заболевание». Журнал EMBO. 26 (13): 3227–37. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601748. ЧВК 1914096. PMID 17557076.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137806 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027305 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11935339-5] Янссен Р., Смейтинк Дж., Смитс Р., ван Ден Хеувел Л. (март 2002 г.). "Фактор сборки комплекса I CIA30: кандидат на дефицит комплекса I человека?". Генетика человека. 110 (3): 264–70. Дои:10.1007 / s00439-001-0673-3. PMID 11935339.

[pmid10810093-6] Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (май 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Геномные исследования. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК 310876. PMID 10810093.

[entrez-7] а ^б ^c "Ген Entrez: NDUFAF1 NADH-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, фактор сборки 1".

[:0-8] а ^б ^c ^d Фогель Р.О., Янссен Р.Дж., Угальде С., Гровенштейн М., Хуйбенс Р.Дж., Виш Г.Дж., ван ден Хеувел Л.П., Виллемс П.Х., Зевиани М., Смейтинк Д.А., Нийтманс Л.Г. (октябрь 2005 г.). «Сборка митохондриального комплекса I человека опосредуется NDUFAF1». Журнал FEBS. 272 (20): 5317–26. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04928.x. PMID 16218961.

[9] «NDUFAF1 - комплекс I промежуточно-ассоциированный белок 30, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Human) - ген и белок NDUFAF1». www.uniprot.org. Получено 2018-07-23.

[10] Дональд., Воет (2013). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне. Воет, Джудит Г., Пратт, Шарлотта В. (Четвертое изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. ISBN 9780470547847. OCLC 738349533.

[:1-11] а ^б Фассоне Э., Таанман Дж. В., Харгривс И. П., Себир Нью-Джерси, Клири М. А., Берч М., Рахман С. (октябрь 2011 г.). «Мутации в митохондриальном комплексе I фактора сборки NDUFAF1 вызывают фатальную гипертрофическую кардиомиопатию у младенцев». Журнал медицинской генетики. 48 (10): 691–7. Дои:10.1136 / jmedgenet-2011-100340. PMID 21931170.

[:2-12] а ^б У Л, Пэн Дж, Ма И, Хе Ф, Дэн Х, Ван Г, Лифен И, Инь Ф (2016). «Лейкодистрофия, связанная с дефицитом митохондриального комплекса I из-за новой мутации в гене NDUFAF1». Митохондриальная ДНК, часть А. 27 (2): 1034–7. Дои:10.3109/19401736.2014.926543. PMID 24963768.

[:3-13] а ^б ^c Даннинг CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (июль 2007 г.). «Человеческий CIA30 участвует в ранней сборке митохондриального комплекса I, и мутации в его гене вызывают заболевание». Журнал EMBO. 26 (13): 3227–37. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601748. ЧВК 1914096. PMID 17557076.

[14] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йейтс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.

[15] Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках ". amino.heartproteome.org. Получено 2018-07-23.

[16] «Дефицит митохондриального комплекса I». www.uniprot.org. Получено 2018-07-23.

[17] "pnliprp1-ndufaf1-1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[18] "tmem97-ndufaf1-1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[19] "tmem86b-ndufaf1-1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[20] "yipf6-ndufaf1-1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[21] "slc30a2-ndufaf1-1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[22] "atic-ndufaf1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[23] "magea11-ndufaf1". Нетронутый. Получено 2018-07-23.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]