OPN1LW - Википедия - OPN1LW

OPN1LW
Идентификаторы
ПсевдонимыOPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, опсин 1 (пигменты колбочек), чувствительный к длинным волнам, опсин 1, чувствительный к длинным волнам
Внешние идентификаторыOMIM: 300822 MGI: 1097692 ГомолоГен: 68064 Генные карты: OPN1LW
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение OPN1LW
Геномное расположение OPN1LW
ГруппаXq28Начинать154,144,243 бп[1]
Конец154,159,032 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE OPN1LW 221327 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5956

14539

Ансамбль

ENSG00000102076

ENSMUSG00000031394

UniProt

н / д

O35599

RefSeq (мРНК)

NM_020061

NM_008106

RefSeq (белок)

н / д

NP_032132

Расположение (UCSC)Chr X: 154.14 - 154.16 МбChr X: 74.13 - 74.15 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

OPN1LW это ген на Х-хромосоме, который кодирует чувствительность к длинным волнам (LWS) опсин, или красный конус фотопигмент.[5] Он отвечает за восприятие видимого света в желто-зеленом диапазоне на экране. видимый спектр (около 500-570 нм).[6][7] Ген содержит 6 экзонов, вариабельность которых вызывает сдвиги в спектральном диапазоне.[8] OPN1LW подвергается гомологичной рекомбинации с OPN1MW, поскольку оба имеют очень похожие последовательности.[8] Эти рекомбинации могут привести к различным проблемам со зрением, таким как красно-зеленая дальтонизм и синяя монохромность.[9] Кодируемый белок представляет собой Рецептор, связанный с G-белком со встроенным 11-СНГ-ретинальный, чье световое возбуждение вызывает цис-транс конформационное изменение, которое запускает процесс передачи химических сигналов в мозг.[10]

Ген

OPN1LW производит опсин, чувствительный к красному цвету, в то время как его аналоги, OPN1MW и OPN1SW, производят чувствительный к зеленому цвету и чувствительный к синему опсин соответственно.[7] OPN1LW и OPN1MW находятся на Х хромосома в позиции Xq28.[11] Они в тандемный массив, состоящий из одного гена OPN1LW, за которым следует один или несколько генов OPN1MW.[11] В область контроля локуса (LCR; ОПСИН-LCR ) регулирует экспрессию обоих генов, при этом только ген OPN1LW и соседние с ним гены OPN1MW экспрессируются и вносят вклад в фенотип цветового зрения.[11] LCR не может дойти дальше первого или второго гена OPN1MW в массиве.[11] Небольшая разница в спектрах поглощения OPN1LW и OPN1MW связана с небольшими аминокислотными различиями между двумя очень похожими генами.[8]

Экзоны

OPN1LW и OPN1MW имеют шесть экзоны.[8] Аминокислота диморфизм экзона 5 в положениях 277 и 285 оказывает наибольшее влияние на спектральные различия, наблюдаемые между пигментами LWS и MWS.[8] В экзоне 5 для OPN1LW и OPN1MW есть 3 замены аминокислот, которые вносят вклад в спектральный сдвиг, наблюдаемый между их соответствующими опсинами: OPN1MW имеет фенилаланин на позициях 277 и 309, и аланин на 285; OPN1LW есть тирозин в позиции 277 и 309, и треонин на позиции 285.[8] Идентичность аминокислот в этих положениях в экзоне 5 определяет, что ген относится к классу M или L.[8] В экзоне 3 в позиции 180 оба гена могут содержать серин или аланин, но присутствие серина вызывает более длинноволновую чувствительность.[8] Экзон 4 имеет два положения спектральной настройки: 230 для изолейцин (более длинная пиковая длина волны) или треонин и 233 для аланина (более длинная пиковая длина волны) или серина.[8]

Гомологичная рекомбинация

Расположение OPN1LW и OPN1MW, а также высокое сходство этих двух генов позволяет часто рекомбинация между двумя.[8] Неравномерная рекомбинация женских Х-хромосом во время мейоз является основной причиной различного количества генов OPN1LW и OPN1MW у людей, а также является причиной унаследованных нарушений цветового зрения.[8] События рекомбинации обычно начинаются с несовпадения гена OPN1LW с геном OPN1MW и сопровождаются определенным типом кроссовера, который может привести к множеству различных аномалий генов. Кроссовер в областях между генами OPN1LW и OPN1MW может продуцировать хромосомные продукты с дополнительными генами OPN1LW или OPN1MW на одной хромосоме и уменьшенными генами OPN1LW или OPN1MW на другой хромосоме.[8] Если кроссовер происходит в несовмещенных генах OPN1LW и OPN1MW, то на каждой хромосоме будет создан новый массив, состоящий только из частичных частей двух генов.[8] Это привело бы к нарушению цветового зрения, если бы любая хромосома была передана потомству мужского пола.[8]

Протеин

Опсин LWS типа I представляет собой Рецептор, связанный с G-белком (GPCR) белок со встроенным 11-СНГ сетчатка.[11] Это трансмембранный белок который имеет семь мембранных доменов, причем N-конец является внеклеточным, а C-конец - цитоплазматическим.[5] Пигмент LWS имеет максимальное поглощение около 564 нм с диапазоном поглощения около 500-570 нм.[6] Этот опсин известен как красный опсин, потому что он наиболее чувствителен к красному свету из трех типов опсинов колбочек, а не потому, что его пиковая чувствительность предназначена для красного света.[7] Пиковое поглощение 564 нм фактически приходится на желто-зеленую часть видимый световой спектр.[7] Когда белок вступает в контакт со светом с длиной волны в его спектральном диапазоне, 11-СНГ-ретинальный хромофор становится возбужденным.[10] Количество энергии в свете нарушает пи бонд который удерживает хромофор в его цис-конфигурации, что вызывает фотоизомеризация и переход на транс конфигурацию.[10] Этот сдвиг - то, что начинает последовательность химической реакции, ответственной за передачу сигнала конуса LWS в мозг.[10]

Функция

Опсин LWS находится в дисках внешнего сегмента колбочек LWS, которые опосредуют фотопическое зрение вместе с конусами MWS и SWS.[10][12] Конусное представление в сетчатка существенно меньше стержневого представления, при этом большинство конусов локализовано в ямка.[12] Когда свет в спектральном диапазоне LWS опсина достигает сетчатки, 11-СНГ-ретинальный хромофор в белке опсина становится возбужденным.[10] Это возбуждение вызывает конформационное изменение белка и запускает серию химических реакций.[10] Эта реакционная серия переходит из ячеек конуса LWS в горизонтальные ячейки, биполярные клетки, амакриновые клетки, и наконец ганглиозные клетки прежде чем перейти к мозгу через Зрительный нерв.[10] Ганглиозные клетки компилируют сигнал от колбочек LWS со всеми другими сигналами колбочек, которые возникли в ответ на свет, который был замечен, и передают общий сигнал в зрительный нерв.[6] Сами колбочки не обрабатывают цвет, это мозг решает, какой цвет будет виден по комбинации сигналов, которые он получает от ганглиозных клеток.[10]

Эволюционная история

До того, как люди превратились в трехцветный видов, наше видение было двухцветный и состоял только из генов OPN1LW и OPN1SW.[8] Считается, что OPN1LW подвергся дупликации, которая привела к появлению дополнительной копии гена, который затем независимо развился и стал OPN1MW.[8] OPN1LW и OPN1MW разделяют почти все свои последовательности ДНК, тогда как OPN1LW и OPN1SW разделяют менее половины, что позволяет предположить, что гены длинных и средних волн разошлись друг от друга гораздо позже, чем с OPN1SW.[11] Появление OPN1MW напрямую связано с переходом от дихроматии к трихроматии.[6] Присутствие как LSW, так и MSW опсинов улучшает время распознавания цвета, запоминание цветных объектов и различение в зависимости от расстояния, давая трехцветным организмам эволюционное преимущество перед двухцветными организмами при поиске богатых питательными веществами источников пищи.[6]Конические пигменты являются продуктом зрительных пигментов предков, которые состояли только из колбочек, а не стержневые клетки.[10] Эти наследственные колбочки эволюционировали, чтобы стать известными нам сегодня колбочками (LWS, MWS, SWS), а также палочковидными клетками.[10]

Нарушения зрения

Красно-зеленая дальтонизм

Многие генетические изменения генов OPN1LW и / или OPN1MW могут вызывать красно-зеленая дальтонизм.[9] Большинство этих генетических изменений связаны с событиями рекомбинации между очень похожими генами OPN1LW и OPN1MW, что может привести к удаление одного или обоих этих генов.[9] Рекомбинация также может привести к созданию множества различных OPN1LW и OPN1MW. химеры, которые представляют собой гены, похожие на исходные, но имеющие разные спектральные свойства.[13] Изменения одной пары оснований в OPN1LW также может вызывать дальтонизм к красно-зеленому цвету, но это случается редко.[9] На степень потери зрения у красно-зеленого дальтоника влияет полиморфизм Ser180Ala.[13]

Протанопия

Протанопия вызывается дефектной или полной потерей функции гена OPN1LW, вызывая зрение, которое полностью зависит от OPN1MW и OPN1SW.[8] Больные имеют дихроматическое зрение с неспособностью полностью различать зеленый, желтый и красный цвет.[8]

Протаномалия

Протаномалия возникает, когда частично функциональный гибридный ген OPN1LW заменяет нормальный ген.[9] Опсины, полученные на основе этих гибридных генов, имеют аномальные спектральные сдвиги, которые ухудшают цветовое восприятие цветов в спектре OPN1LW.[9] Протаномалия - одна из форм аномальная трихроматия.[8]

Монохромность синего конуса

Монохромность синего конуса вызвано потерей функции как OPN1LW, так и OPN1MW.[9] Обычно это вызвано мутациями в LCR, которые не приводят к экспрессии OPN1LW или OPN1MW.[9] С этим нарушением зрения человек может видеть только цвета в спектре опсинов SWS, которые попадают в синий диапазон света.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102076 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031394 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «OPN1LW опсин 1, чувствительный к длинным волнам [Homo sapiens (человек)]». NCBI. Получено 16 ноября, 2017.
  6. ^ а б c d е Хофманн Л., Пальчевский К. (2015). «Успехи в понимании молекулярной основы первых шагов в области цветового зрения». Прогресс в исследованиях сетчатки и глаз. 49: 46–66. Дои:10.1016 / j.preteyeres.2015.07.004. ЧВК  4651776. PMID  26187035.
  7. ^ а б c d Мербс С.Л., Натанс Дж. (1992). «Спектры поглощения пигментов колбочек человека». Природа. 356 (6368): 433–5. Дои:10.1038 / 356433a0. PMID  1557124.
  8. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s Neitz J, Neitz M (2011). «Генетика нормального и дефектного цветового зрения». Исследование зрения. 51 (7): 633–51. Дои:10.1016 / j.visres.2010.12.002. ЧВК  3075382. PMID  21167193.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я «Ген OPN1LW». Национальная медицинская библиотека США. Домашний справочник по генетике. Получено 29 ноября, 2017.
  10. ^ а б c d е ж грамм час я j k Имамото Ю., Ситида Ю. (2014). «Конические визуальные пигменты». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1837 (5): 664–73. Дои:10.1016 / j.bbabio.2013.08.009. PMID  24021171.
  11. ^ а б c d е ж Диб СС (2006). «Генетика изменения цветового зрения человека и мозаика колбочек сетчатки». Текущее мнение в области генетики и развития. 16 (3): 301–7. Дои:10.1016 / j.gde.2006.04.002. PMID  16647849.
  12. ^ а б «Жезлы и колбочки человеческого глаза». Спросите биолога. Школа естественных наук АГУ. 14 апреля 2010 г.. Получено 29 ноября, 2017.
  13. ^ а б Диб, СС (2005). «Молекулярная основа изменения цветового зрения человека». Клиническая генетика. 67 (5): 369–377. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2004.00343.x. PMID  15811001.

дальнейшее чтение