Связанный с патогенезом белок - Pathogenesis-related protein

Белки, связанные с патогенезом (PR) находятся белки произведено в растения в случае возбудитель атака.[1] Они есть индуцированный как часть системная приобретенная резистентность. Инфекции активируют гены, производящие белки PR. Некоторые из этих белков являются антимикробными и атакуют молекулы клеточной стенки бактерии или грибка. Другие могут действовать как сигналы, которые распространяют «новости» об инфекции в соседние клетки. Инфекции также стимулируют сшивание молекул в клеточной стенке и отложение лигнин, ответные меры, которые создают локальную баррикаду, которая замедляет распространение патогена на другие части растения.[2]

Салициловая кислота играет роль в сопротивление к патогенам, индуцируя производство белков, связанных с патогенезом.[3] Много белки в вине являются белками, связанными с патогенами винограда.[4] К ним относятся тауматин -подобные белки и хитиназы.

Многие семейства белков, связанных с патогенезом, также совпадают с группами аллергенов человека, хотя аллергия может не иметь ничего общего с защитной функцией белков.[5] Группирование этих белков по признакам их последовательностей позволяет находить потенциально аллергенные белки из секвенированных геномов растений, область исследований, получившая название "аллергеномика ".[6]

Классификация

По состоянию на 2014 г., Названы 17 семейств PR белков:[5]

Идентифицированы различные семейства PR-белков и аллергены
СемьяКлассификация доменовБелкиФункцииАллергены
PR-1IPR034111

IPR001283

ПР-1 а, ПР-1 б и ПР-1 вПротивогрибковое (КОЛПАЧОК )Cuc m 3 (дыня; P83834) - синдром оральной аллергии.
PR-2(GH17 )β-1,3-глюканазыРасщепляет β-1,3-глюканы
  • Hev b 2 (латекс; P52407) - контактный дерматит
  • Оле е 9 (оливковое) - респираторная аллергия.
  • Mus a 5 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-3IPR016283Типы хитиназы I, II, IV, V, VI и VIIЭндохитиназа
  • Pers a 1 (авокадо) - воспаление глаз или носа, астма, отек и т. Д.
  • Mus a 2 (банан) - пищевая аллергия, например отек губ, анафилаксия и т. Д.
PR-4IPR001153Домен Барвин хитиназа I / IIПротивогрибковые и хитиназыPro-heveins: Hev b 6 - контактный дерматит.
PR-5IPR001938Тауматин -подобноПротивогрибковый
  • Jun a 3 (горный кедр), Cry j 1 (японский кедр) и Cup a 3 (аризонский кипарис) - ринит, конъюнктивит и астма.
  • Pru av 2 (вишня), Mal d 2 (яблоко), Cap a 1 (болгарский перец), Act d 2 (киви) и Mus a 4 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-6IPR000864Картофельная протеаза IИнгибитор протеиназы
PR-7(Субтилизин -подобно)Эндопротеиназа томата P69 (O82007)Эндопротеиназа
PR-8(GH18 )Хитиназа огурцаХитиназа III
  • Гевамин (латекс, P23472) - контактный дерматит.
  • Ziz m 1 (мармелад индийский, Q2VST0) - синдром оральной аллергии.
  • Cof a 1 (кофе, D7REL9) - аллергия на глаза и дыхательные пути
PR-9(Пероксидаза гема III)Табачная лигнин-образующая пероксидаза (P11965)Пероксидаза
PR-10IPR024949

IPR000916

Петрушка "ПР-1"Рибонуклеазоподобный
  • Bet v 1 (пыльца березы) - аллергический риноконъюнктивит и астма
  • Pru av 1 (вишня), Mal d 1 (яблоко), Api g 1 (сельдерей) и Dau c 1 (морковь) - синдром оральной аллергии.
  • Gly m 4 (соя), Vig r 1 (маш), Cor a 1 (лесной орех) и Cas s 1 (каштан), Act c 8 (золотой киви), Act d 8 (зеленый плод киви) - оральная аллергия синдром
PR-11(GH18 )Табачная хитиназа V (Q43576)Хитиназа
PR-12IPR008176Редис Rs-AFP3 (O24332)Растительный дефенсин
PR-13IPR001010Arabidopsis THI2.1 (Q42596)Тионин
PR-14IPR000528Белки-переносчики липидовПеремещение фосфолипидов и жирных кислот
  • Par j 1 (сорняк; P43217) - ринит и астма
  • Pru p 3 (персик), Mal d 3 (яблоко), Pru av 3 (вишня), Pru ar 3 (абрикос), Cor a 8 (лесной орех), Cas s 8 (каштан) и Zea m 14 (кукуруза) - синдром оральной аллергии
PR-15IPR001929Ячмень OxOa (P45850)росток; Оксалатоксидаза
PR-16IPR001929OxOLP ячменя (O49871)зародышевый
PR-17IPR007541Табак NtPRp27 (Q9XIY9)фитофтороз (?)[7]

Идентификация

Поскольку белки PR продуцируются при стрессе растительной ткани, используются различные способы передачи сигналов стресса, чтобы «приманить» растение к экспрессии генов PR для идентификации. Полезные факторы стресса включают фактическую инфекцию или просто защитные сигналы, такие как салицилат и метилжасмонат. Белки могут быть идентифицированы путем выделения, расщепления пептидов и сопоставления с геномными последовательностями (секвенирование белков ). Затем полученные последовательности можно проверить на соответствие известным семействам белков PR для категоризации.[8][9]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Loon LC (1985). «Белки, связанные с патогенезом». Молекулярная биология растений. 4 (2–3): 111–116. Дои:10.1007 / BF02418757. PMID  24310747.
  2. ^ Кэмпбелл, Н.А. и Рис, Дж. Б. (2005). Биология (7-е изд). Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс.
  3. ^ Van Huijsduijnen RAMH; Alblas SW; Де Райк Р.Х .; Бол Дж. Ф. (1986). «Индукция салициловой кислотой белков, связанных с патогенезом, и устойчивость к инфекции вируса мозаики люцерны у различных видов растений». Журнал общей вирусологии. 67 (10): 2135–2143. Дои:10.1099/0022-1317-67-10-2135.
  4. ^ Уотерс EJ, Ширли NJ, Уильямс PJ (1996). «Мешающие белки вина являются белками, связанными с патогенезом винограда». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии. 44 (1): 3–5. Дои:10.1021 / jf9505584.
  5. ^ а б Синха, Мау; Сингх, Рашми Прабха; Кушваха, Гаджрадж Сингх; Икбал, Насир; Сингх, Авинаш; Кошик, Санкет; Каур, Пунит; Шарма, Суджата; Сингх, Тедж П. (2014). «Текущий обзор аллергенов семейств белков, связанных с патогенезом растений». Научный мировой журнал. 2014: 543195. Дои:10.1155/2014/543195. ЧВК  3947804. PMID  24696647. CC-BY icon.svg Эта статья содержит цитаты из этого источника, который доступен под Лицензия Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) лицензия.
  6. ^ Ди Джироламо, Ф; Muraca, M; Маццина, О; Ланте, я; Дахда, Л. (июнь 2015 г.). «Протеомные приложения при пищевой аллергии: пищевая аллергеномика». Текущее мнение в области аллергии и клинической иммунологии. 15 (3): 259–66. Дои:10.1097 / ACI.0000000000000160. PMID  25899690.
  7. ^ Ши, X; Тиан, Z; Лю, Дж; ван дер Фоссен, EA; Се, К. (февраль 2012 г.). «Ген белка, связанного с патогенезом картофеля, StPRp27, вносит вклад в расовую неспецифическую устойчивость против Phytophthora infestans». Отчеты по молекулярной биологии. 39 (2): 1909–16. Дои:10.1007 / s11033-011-0937-5. PMID  21667110.
  8. ^ Эльвира, М. И .; Гальдеано, М. М .; Gilardi, P .; Гарсия-Луке, I .; Серра, М. Т. (19 марта 2008 г.). «Протеомный анализ белков, связанных с патогенезом (PR), индуцированных совместимыми и несовместимыми взаимодействиями вируса легкой крапчатости перца (PMMoV) в растениях Capsicum chinense L3». Журнал экспериментальной ботаники. 59 (6): 1253–1265. Дои:10.1093 / jxb / ern032. PMID  18375936.
  9. ^ Sabater-Jara, AB; Альмагро, Л; Бельчи-Наварро, S; Barceló, AR; Педреньо, Массачусетс (март 2011 г.). «Метилжасмонат индуцирует внеклеточные белки, связанные с патогенезом, в культурах клеток Capsicum chinense». Сигнализация и поведение растений. 6 (3): 440–2. Дои:10.4161 / psb.6.3.14451. ЧВК  3142433. PMID  21346408.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст Мау Синха, Рашми Прабха Сингх, Гаджрадж Сингх Кушваха, Насир Икбал, Авинаш Сингх, Санкет Кошик, Пунит Каур, Суджата Шарма и Тедж П. Сингх, доступные под CC BY 3.0 лицензия.

внешняя ссылка