SAP30 - SAP30

SAP30
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSAP30, Sin3A-ассоциированный белок 30
Внешние идентификаторыOMIM: 603378 MGI: 1929129 ГомолоГен: 2869 Генные карты: SAP30
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение для SAP30
Геномное расположение для SAP30
Группа4q34.1Начните173,369,969 бп[1]
Конец173,377,532 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SAP30 204900 x в формате fs.png

PBB GE SAP30 204899 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003864

NM_021788

RefSeq (белок)

NP_003855

NP_068560.1

Расположение (UCSC)Chr 4: 173.37 - 173.38 МбChr 8: 57.48 - 57.49 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Sin3A-ассоциированный белок, 30 кДа, также известен как SAP30, это белок который у человека кодируется SAP30 ген.[5]

Функция

Гистон ацетилирование играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируются многосубъединичными комплексами. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом гистоновая деацетилаза комплекс, который включает SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс активен в деацетилировании октамеров коровых гистонов, но неактивен в деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 3.[5]

У млекопитающих есть один паралог SAP30, названный SAP30-like (SAP30L ), который на 70% идентичен последовательностям SAP30.[6] SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо консервативное семейство белков SAP30. Также SAP30L взаимодействует с несколькими компонентами корепрессорного комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции посредством рекрутирования Sin3A и гистоновых деацетилаз.[7]

Белки семейства SAP30 (белки SAP30) обладают функциональным ядрышковый сигнал локализации, и они способны нацеливать Sin3A на ядрышко.[7] Белки SAP30 имеют независимый от последовательности контакт с ДНК посредством своего N-концевого цинк-зависимого модуля, а их кислая центральная область вносит вклад во взаимодействия гистонов и нуклеосом. Связывание белков SAP30 с ДНК регулируется ядерными сигнальными липидами, фосфоинозитидами (PI).[8] Белки SAP30 представляют собой первый пример, в котором ДНК и ИП, по-видимому, находятся во взаимно антагонистических взаимоотношениях в отношении их взаимодействия с цинковый палец белков и, таким образом, иллюстрирует молекулярный механизм того, как эти липиды могут способствовать регуляции генов.[8][9]

Взаимодействия

SAP30 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164105 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031609 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: SAP30 Sin3A-ассоциированный белок, 30 кДа».
  6. ^ Линдфорс К., Виири К.М., Нийттинен М., Хейнонен Т.Ю., Мяки М., Кайнулайнен Х. (декабрь 2003 г.). «TGF-бета индуцирует экспрессию SAP30L, нового ядерного белка». BMC Genomics. 4 (1): 53. Дои:10.1186/1471-2164-4-53. ЧВК  319701. PMID  14680513.
  7. ^ а б Виири К.М., Коркеамаки Х., Кукконен М.К., Ниеминен Л.К., Линдфорс К., Петерсон П., Мяки М., Кайнулайнен Х., Лохи О. (2006). «SAP30L взаимодействует с членами корепрессорного комплекса Sin3A и направляет Sin3A на ядрышко». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (11): 3288–98. Дои:10.1093 / нар / gkl401. ЧВК  1500868. PMID  16820529.
  8. ^ а б Виири К.М., Янис Дж., Сиггерс Т., Хейнонен Т.Ю., Вальякка Дж., Булык М.Л., Мяки М., Лохи О. (январь 2009 г.). «ДНК-связывающая и изгибающая активности SAP30L и SAP30 опосредуются цинк-зависимым модулем и монофосфоинозитидами». Молекулярная и клеточная биология. 29 (2): 342–56. Дои:10.1128 / MCB.01213-08. ЧВК  2612513. PMID  19015240.
  9. ^ http://acta.uta.fi/teos.php?id=11179
  10. ^ а б Хуан Н.Э., Линь СН, Лин Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 267–75. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 00966-5. PMID  12788099.
  11. ^ а б c d е Чжан Ю., Сунь З. В., Иратни Р., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный для человека и дрожжей, является компонентом гистондеацетилазного комплекса». Молекулярная клетка. 1 (7): 1021–31. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80102-1. PMID  9651585.
  12. ^ а б c d е Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК  316920. PMID  10444591.
  13. ^ Суонсон К.А., Ноепфлер П.С., Хуанг К., Кан Р.С., Коули С.М., Лаэрти С.Д., Эйзенман Р.Н., Радхакришнан И. (август 2004 г.). «Репрессоры HBP1 и Mad1 связывают корепрессорный домен PAH2 Sin3 с противоположными спиральными ориентациями». Структурная и молекулярная биология природы. 11 (8): 738–46. Дои:10.1038 / nsmb798. PMID  15235594. S2CID  44324333.
  14. ^ а б Yochum GS, Ayer DE (июль 2001 г.). «Pf1, новый белок цинкового пальца PHD, который связывает корепрессор TLE с комплексом mSin3A-гистондеацетилаза». Молекулярная и клеточная биология. 21 (13): 4110–8. Дои:10.1128 / MCB.21.13.4110-4118.2001. ЧВК  87072. PMID  11390640.
  15. ^ а б c d е ж Кузьмичев А., Чжан Ю., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистондеацетилаза в регуляции роста кандидатом в супрессор опухоли p33 (ING1)». Молекулярная и клеточная биология. 22 (3): 835–48. Дои:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. ЧВК  133546. PMID  11784859.
  16. ^ а б Лаэрти CD, Биллин А.Н., Лавинский Р.М., Йочум Г.С., Буш А.С., Сан Дж. М., Маллен Т. М., Дэви Дж. Р., Роуз Д. В., Гласс С. К., Розенфельд М. Г., Эйер Д. Е., Эйзенман Р. Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в N-CoR-опосредованной репрессии специфическими факторами транскрипции». Молекулярная клетка. 2 (1): 33–42. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80111-2. PMID  9702189.
  17. ^ Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (Декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI / SNF млекопитающих и корепрессор KAP-1». Журнал биологической химии. 275 (51): 40463–70. Дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID  11013263.
  18. ^ Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / mcb.23.10.3456-3467.2003. ЧВК  164750. PMID  12724404.

дальнейшее чтение