SMURF1 - SMURF1

SMURF1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LAZ, 2LB0, 2LB1, 2LTX, 3PYC
Идентификаторы
Псевдонимы	SMURF1, SMAD-специфическая E3-убиквитин-протеинлигаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605568 MGI: 1923038 ГомолоГен: 10712 Генные карты: SMURF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	99,144,100 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	144,965,847 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• Привязка R-SMAD; • Привязка I-SMAD; • связывание активина; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание фосфолипидов; • трансферазная активность; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • мембрана; • клеточная мембрана; • нуклеоплазма; • аксон; • тело нейрональной клетки; • митохондрия; • внеклеточная экзосома;
Биологический процесс	• дифференциация клеток; • поглощение цели аутофагосомой; • развитие эктодермы; • полиубиквитинирование белков; • BMP сигнальный путь; • рецепторный катаболический процесс; • убиквитин-зависимый катаболический процесс белка SMAD; • отрицательное регулирование окостенения; • локализация белка на поверхности клетки; • нацеливание белка на вакуоль, участвующую в аутофагии; • положительная регуляция убиквитинирования белков, участвующих в убиквитин-зависимом катаболическом процессе белков; • убиквитинирование белков; • экспорт белка из ядра; • положительное регулирование расширения дендритов; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • отрицательная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста; • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста; • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток; • Паркин-опосредованная стимуляция митофагии в ответ на митохондриальную деполяризацию; • локализация субстрата на аутофагосоме; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • отрицательная регуляция сигнального пути BMP; • локализация белка на плазматической мембране; • положительная регуляция белкового катаболического процесса;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	57154
	75788
	ENSG00000284126; ENSG00000198742
	ENSMUSG00000038780
	Q9HCE7
	Q9CUN6
	NM_001199847; NM_020429; NM_181349
	NM_001038627; NM_029438
	NP_001186776; NP_065162; NP_851994
	NP_001033716; NP_083714
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза SMURF1 является фермент что у людей кодируется SMURF1 ген.^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует убиквитинлигаза что специфично для регулируемых рецептором SMAD белки в костном морфогенетическом белке (BMP ) путь. Аналогичный белок в Xenopus участвует в формировании эмбрионального рисунка. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. Был идентифицирован дополнительный вариант транскрипта, но его полноразмерная последовательность не определена.^[6]

Взаимодействия

SMURF1 был показан взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Врана Дж. Л., Аттисано Л. (2000). «Путь Смада». Фактор роста цитокинов Rev. 11 (1–2): 5–13. Дои:10.1016 / S1359-6101 (99) 00024-6. PMID 10708948.
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (4): 273–81. Дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID 10997877.
Эбисава Т., Фукути М., Мураками Г., Чиба Т., Танака К., Имамура Т., Миядзоно К. (2001). «Smurf1 взаимодействует с рецептором трансформирующего фактора роста-бета типа I через Smad7 и вызывает деградацию рецептора». J. Biol. Chem. 276 (16): 12477–80. Дои:10.1074 / jbc.C100008200. PMID 11278251.
Судзуки К., Мураками Дж., Фукучи М., Шимануки Т., Шикаучи Ю., Имамура Т., Миядзоно К. (2002). «Smurf1 регулирует ингибирующую активность Smad7, направляя Smad7 на плазматическую мембрану». J. Biol. Chem. 277 (42): 39919–25. Дои:10.1074 / jbc.M201901200. PMID 12151385.
Таджима Й., Гото К., Йошида М., Шиномия К., Секимото Т., Йонеда Ю., Миядзоно К., Имамура Т. (2003). «Зависимое от поддержания 1 хромосомной области (CRM1) ядерный экспорт Smad-убиквитина регуляторного фактора 1 (Smurf1) необходим для отрицательной регуляции передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета с помощью Smad7». J. Biol. Chem. 278 (12): 10716–21. Дои:10.1074 / jbc.M212663200. PMID 12519765.
Коинума Д., Шинозаки М., Комуро А., Гото К., Сайто М., Ханю А., Эбина М., Нукива Т., Миядзава К., Имамура Т., Миядзоно К. (2004). «Аркадия усиливает передачу сигналов надсемейства TGF-бета посредством деградации Smad7». EMBO J. 22 (24): 6458–70. Дои:10.1093 / emboj / cdg632. ЧВК 291827. PMID 14657019.
Ван Х.Р., Чжан Й., Оздамар Б., Огунджими А.А., Александрова Э., Томсен Г.Х., Врана Д.Л. (2003). «Регулирование полярности клеток и образование выпячиваний путем нацеливания на RhoA для деградации». Наука. 302 (5651): 1775–9. Дои:10.1126 / science.1090772. PMID 14657501. S2CID 21530222.
Асано Й, Ин Х, Ямане К., Кубо М, Тамаки К. (2004). «Нарушение опосредованной Smad7-Smurf негативной регуляции передачи сигналов TGF-бета в фибробластах склеродермии». J. Clin. Вкладывать деньги. 113 (2): 253–64. Дои:10.1172 / JCI16269. ЧВК 310747. PMID 14722617.
Джин YH, Jeon EJ, Li QL, Lee YH, Choi JK, Kim WJ, Lee KY, Bae SC (2004). «Трансформирующий бета-фактор роста стимулирует p300-зависимое ацетилирование RUNX3, что ингибирует опосредованное убиквитинирование деградацию». J. Biol. Chem. 279 (28): 29409–17. Дои:10.1074 / jbc.M313120200. PMID 15138260.
Ширвин-Уайатт Л.М., Браун Д.Л., Уайли Ф.Г., Стоу Дж.Л., Кумар С. (2005). «N4WBP5A (Ndfip2), белок, взаимодействующий с Nedd4, локализуется в мультивезикулярных телах и Гольджи, и имеет потенциальную роль в торговле белками». J. Cell Sci. 117 (Pt 16): 3679–89. Дои:10.1242 / jcs.01212. PMID 15252135.
Брайан Б., Цай И, Райтон К., Ву Г., Фэн XH, Лю М. (2005). «Убиквитинирование RhoA с помощью Smurf1 способствует разрастанию нейритов». FEBS Lett. 579 (5): 1015–9. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.12.074. PMID 15710384. S2CID 36440933.
Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзулдж Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Врана JL (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9HCE7 (Убиквитин-протеинлигаза E3 SMURF1) на PDBe-KB.

Этот белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000198742 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000284126, ENSG00000198742 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038780 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10458166-5] Чжу Х., Кавсак П., Абдолла С., Врана Дж. Л., Томсен Г. Х. (сентябрь 1999 г.). «Убиквитинлигаза SMAD нацелена на путь BMP и влияет на формирование эмбрионального паттерна». Природа. 400 (6745): 687–93. Дои:10.1038/23293. PMID 10458166. S2CID 204995261.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: SMURF1 SMAD-специфическая E3-убиквитин-протеин-лигаза 1».

[pmid18208356-7] Ямагути К., Охара О, Андо А., Нагасе Т. (апрель 2008 г.). «Smurf1 непосредственно нацелен на hPEM-2, GEF для Cdc42, посредством новой комбинации модулей взаимодействия белков в пути убиквитин-протеасома». Биол. Chem. 389 (4): 405–13. Дои:10.1515 / BC.2008.036. PMID 18208356. S2CID 27505034.

[pmid18641638-8] Лу К, Инь Х, Вен Т, Си С, Ли Л, Син Дж, Ченг Х, Ян Х, Чжан Л., Хэ Ф (август 2008 г.). "Нацеливание на линкер WW-доменов убиквитинлигазы HECT-типа Smurf1 для активации с помощью CKIP-1". Nat. Cell Biol. 10 (8): 994–1002. Дои:10,1038 / ncb1760. PMID 18641638. S2CID 19216909.

[pmid18927080-9] Фукунага Е., Иноуэ Й, Комия С., Хоригучи К., Гото К., Сайто М., Миядзава К., Коинума Д., Ханю А., Имамура Т. (декабрь 2008 г.). «Smurf2 индуцирует убиквитин-зависимую деградацию Smurf1 для предотвращения миграции клеток рака груди». J. Biol. Chem. 283 (51): 35660–7. Дои:10.1074 / jbc.M710496200. PMID 18927080.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

SMURF1 - SMURF1

Содержание

Функция

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка