SYBR Green I - Википедия - SYBR Green I

SYBR Зеленый I
SYBR Green I.png
Имена
Название ИЮПАК
N ', N'-диметил-N- [4 - [(E) - (3-метил-1,3-бензотиазол-2-илиден) метил] -1-фенилхинолин-1-иум-2-ил] -N-пропилпропан-1,3-диамин
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭМБЛ
Характеристики
C32ЧАС37N4S+
Молярная масса509.73 грамм /моль
РастворимостьОбычно поставляется в растворенном виде диметилсульфоксид
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
☒N проверять (что проверитьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

SYBR Зеленый I (SG) является асимметричным цианиновый краситель[1] используется как нуклеиновая кислота пятно в молекулярная биология. Семейство красителей SYBR производится Molecular Probes Inc., теперь принадлежит Thermo Fisher Scientific. SYBR Green I связывается с ДНК. Полученный комплекс ДНК-краситель лучше всего поглощает синий свет с длиной волны 497 нм (λМаксимум = 497 нм) и излучает зеленый свет (λМаксимум = 520 нм). Краситель предпочтительно связывается с двухцепочечной ДНК, но окрашивает одноцепочечную (ss) ДНК с меньшей эффективностью. SYBR Green также может окрашивать РНК с более низкой производительностью, чем оцДНК.

Образец спермы сельди, окрашенный SYBR Green в кювета освещенный синим светом в эпифлуоресцентный микроскоп. Зеленый цвет SYBR в образце связывается с ДНК сперматозоидов и после связывания флуоресцирует, испуская зеленый свет при освещении синим светом.
Спектрограмма SYBR Green I

Использует

SYBR Green находит применение в нескольких областях биохимия и молекулярная биология. Он используется в качестве красителя для количественного определения двунитевой ДНК в некоторых методах количественная ПЦР.[2] Он также используется для визуализации ДНК в гель-электрофорез. Для окрашивания можно использовать более высокие концентрации SYBR Green. агарозные гели чтобы визуализировать присутствующую ДНК. Помимо мечения чистых нуклеиновых кислот SYBR Green также можно использовать для мечения ДНК внутри клеток для проточной цитометрии и флуоресцентная микроскопия. В этих случаях РНКаза лечение может потребоваться для снижения фона от РНК в клетках.

Безопасность

SYBR Green I продается как замена этидиум бромид, потенциальный человек мутаген, поскольку одновременно с этим безопаснее работать и избавиться от сложных проблем утилизации отходов этидия. Однако любые малая молекула способный связывать ДНК с высокой аффинностью. канцероген, в том числе SYBR Green.

В исследовании с использованием Тест Эймса, который измеряет способность химических веществ вызывать мутации, при анализе в той же концентрации не было четкой картины относительной мутагенности бромистого этидия и SYBR green I.[3] Бромид этидия был более мутагенным при более высоких концентрациях.

Похожие цианиновые красители

Смотрите также

Примечания и ссылки

  1. ^ Молния H; Brunner H; Бернхаген Дж; Vitzthum F (2004). «Исследования интеркаляции ДНК и поверхностного связывания с помощью SYBR Green I, определение его структуры и методологические последствия». Исследования нуклеиновых кислот. 32 (12): e103. Дои:10.1093 / nar / gnh101. ЧВК  484200. PMID  15249599.
  2. ^ Mackay IM; Arden KE; Ниче А (март 2002 г.). «ПЦР в реальном времени в вирусологии». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (6): 1292–305. Дои:10.1093 / nar / 30.6.1292. ЧВК  101343. PMID  11884626.
  3. ^ Певица ВЛ; Лоулор TE; Юэ С. (февраль 1999 г.). «Сравнение мутагенности геля, окрашивающего нуклеиновую кислоту SYBR Green I, и мутагенности бромистого этидия в анализе обратной мутации сальмонелл / микросом млекопитающих (тест Эймса)». Мутационные исследования. 439 (1): 37–47. Дои:10.1016 / с 1383-5718 (98) 00172-7. PMID  10029672.