TRIM63 - TRIM63

TRIM63
Белок TRIM63 PDB 2d8u.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, трехчастный мотив, содержащий 63
Внешние идентификаторыOMIM: 606131 MGI: 2447992 ГомолоГен: 41878 Генные карты: TRIM63
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение TRIM63
Геномное расположение TRIM63
Группа1п36.11Начинать26,051,304 бп[1]
Конец26,068,436 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRIM63 gnf1h00833 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_032588

NM_001039048
NM_001369245

RefSeq (белок)

NP_115977

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 26.05 - 26.07 МбChr 4: 134,32 - 134,33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM63, также известный как «MuRF1», является фермент что у людей кодируется TRIM63 ген.[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства белков цинковых пальцев RING, обнаруженный в поперечно-полосатых мышцах и радужной оболочке. Продукт этого гена локализован в решетках Z-линии и M-линии миофибрилл, где N-концевые и C-концевые области тайтина соответственно связываются с саркомером. Исследования связывания in vitro показали, что этот белок также связывается непосредственно с тайтином рядом с областью активности киназы, содержащей тайтин. Другой член этого семейства белков связывается с микротрубочками. Поскольку эти члены семейства могут образовывать гетеродимеры, это предполагает, что эти белки могут служить связующим звеном между тайтинкиназой и микротрубочко-зависимыми сигнальными путями в мышцах.[7]

Белок, кодируемый геном Trim63, также называется MuRF1. MuRF1 - это название, наиболее часто используемое в литературе, оно расшифровывается как «Muscle RING Finger 1». Структурно существует два тесно связанных MuRF, MuRF2 и MuRF3. У них также есть коды TRIM: MuRF2 - TRIM55; MuRF3 - это TRIM54.

Взаимодействия

Trim63 / MuRF1 оказался Убиквитинлигаза E3. Его основной субстрат - тяжелая цепь миозина. MuRF1 активируется во время атрофии скелетных мышц - и, следовательно, деградации тяжелой цепи миозина, которая является основным компонентом саркомер, является важным механизмом разрушения скелетных мышц в условиях атрофии. Было показано, что MuRF1 активируется во время денервации, введения глюкокортикоидов, иммобилизации и гипсовой повязки (когда на конечность накладывается гипсовая повязка для ее обездвиживания). Все эти методы лечения вызывают атрофию скелетных мышц.

TRIM63 был показан взаимодействовать с Титин,[5] GMEB1[8] и SUMO2.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158022 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028834 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Центнер Т., Яно Дж., Кимура Е., МакЭлхинни А.С., Пелин К., Витт С.К., Банг М.Л., Тромбитас К., Гранзье Х., Грегорио С.К., Соримачи Х., Лабейт С. (март 2001 г.). «Идентификация специфичных для мышц белков безымянного пальца как потенциальных регуляторов домена тайтинкиназы». Дж Мол Биол. 306 (4): 717–26. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4448. PMID  11243782.
  6. ^ а б Дай К.С., Лев CC (июнь 2001 г.). «Новый белок цинкового пальца RING поперечно-полосатой мышцы человека, SMRZ, взаимодействует с SMT3b через свой домен RING». J Biol Chem. 276 (26): 23992–9. Дои:10.1074 / jbc.M011208200. PMID  11283016.
  7. ^ а б "Entrez Gene: TRIM63 трехчастный мотив, содержащий 63".
  8. ^ McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (апрель 2002 г.). «Мышечно-специфический RING finger-1 взаимодействует с тайтином для регулирования саркомерной M-линии и структуры толстых филаментов и может выполнять ядерные функции посредством взаимодействия с глюкокортикоидным модулирующим элементом, связывающим белок-1». J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. Дои:10.1083 / jcb.200108089. ЧВК  2173255. PMID  11927605.

дальнейшее чтение