Аминоксидаза (медьсодержащая) - Википедия - Amine oxidase (copper-containing)

аминоксидаза
Идентификаторы
Номер ЕС1.4.3.6
Количество CAS9001-53-0
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
Аминоксидаза меди, ферментный домен
3LOY.pdb.png
Кристаллическая структура медьсодержащей бензиламиноксидазы из Hansenula polymorpha.[1]
Идентификаторы
СимволCu_amine_oxid
PfamPF01179
ИнтерПроIPR015798
PROSITEPDOC00895
SCOP21oac / Объем / СУПФАМ
Мембранома252
N-концевой домен аминоксидазы меди
PDB 1d6u EBI.jpg
кристаллическая структура e. Аминоксидаза coli, анаэробно восстановленная бета-фенилэтиламином
Идентификаторы
СимволCu_amine_oxidN1
PfamPF07833
ИнтерПроIPR012854
SCOP21 гп / Объем / СУПФАМ
Аминоксидаза меди, домен N2
PDB 1ksi EBI.jpg
кристаллическая структура эукариотической (проростки гороха) медьсодержащей аминоксидазы с разрешением 2.2a
Идентификаторы
СимволCu_amine_oxidN2
PfamPF02727
Pfam кланCL0047
ИнтерПроIPR015800
PROSITEPDOC00895
SCOP21oac / Объем / СУПФАМ
Аминоксидаза меди, домен N3
PDB 2oqe EBI.jpg
кристаллическая структура аминоксидазы hansenula polymorpha в комплексе с xe до 1,6 ангстрем
Идентификаторы
СимволCu_amine_oxidN3
PfamPF02728
Pfam кланCL0047
ИнтерПроIPR015802
PROSITEPDOC00895
SCOP21oac / Объем / СУПФАМ

Аминоксидаза (медьсодержащая) (AOC) (ЕС 1.4.3.21 и ЕС 1.4.3.22; раньше ЕС 1.4.3.6 ) - это семья аминоксидаза ферменты который включает как первично-аминоксидаза и диаминоксидаза; эти ферменты катализируют окисление широкого спектра биогенных аминов, включая многие нейротрансмиттеры, гистамин и ксенобиотические амины. Они действуют как гомодимер с дисульфидной связью. Они катализируют окисление первичных аминов до альдегидов с последующим высвобождением аммиака и перекиси водорода, для чего требуется один ион меди на субъединицу и топахинон в качестве кофактора:[2]

RCH2NH2 + H2О + О2 RCHO + NH3 + H2О2

3 субстраты этого фермента первичные амины (RCH2NH2), ЧАС2О, и О2, а его 3 товары находятся RCHO, NH3, и ЧАС2О2.

Медьсодержащие аминоксидазы обнаружены у бактерий, грибов, растений и животных. У прокариот фермент позволяет использовать различные аминные субстраты в качестве источников углерода и азота.[3][4]

Этот фермент принадлежит к оксидоредуктазы особенно те, которые действуют на группу доноров CH-NH2 с кислородом в качестве акцептора. В систематическое название этого класса ферментов амин: оксидоредуктаза кислорода (дезаминирующая) (медьсодержащая). Этот фермент участвует в 8 метаболические пути: цикл мочевины и метаболизм аминогрупп, метаболизм глицина, серина и треонина, метаболизм гистидина, метаболизм тирозина, метаболизм фенилаланина, метаболизм триптофана, метаболизм бета-аланина, и биосинтез алкалоидов ii. Имеет 2 кофакторы: медь, и PQQ.

Структура

Трехмерная структура аминоксидазы меди была определена с помощью Рентгеновская кристаллография.[1]Аминоксидазы меди представляют собой гомодимеры грибовидной формы с массой 70-95 кДа, каждый мономер содержит ион меди и ковалентно связанный окислительно-восстановительный кофактор, топахинон (TPQ). TPQ образуется в результате посттрансляционной модификации консервативного остатка тирозина. Ион меди координирован с тремя остатки гистидина и две молекулы воды в форме искаженной квадратной пирамиды, которые выполняют двойную функцию в катализе и биогенезе TPQ. Каталитический домен является самым большим из 3-4 доменов, обнаруженных в аминоксидазах меди, и состоит из бета-сэндвича из 18 нитей на двух листах. Активный сайт скрыт и требует изменения конформации, чтобы обеспечить доступ к субстрату.

N-концевые домены N2 и N3 имеют общую структурную складку, ее ядро ​​состоит из альфа-бета (4), где спираль упакована против свернутых в спираль антипараллельных бета-листов. Дополнительный домен находится на N-конце некоторых аминоксидаз меди, а также в родственных белки Такие как клеточная стенка гидролаза и N-ацетилмурамоил-L-аланин амидаза. Этот домен состоит из пятицепочечного антипараллельного бета-лист скрученный вокруг альфы спираль.[5][6]

Функция

У эукариот они выполняют более широкий спектр функций, включая дифференцировку и рост клеток, заживление ран, детоксикацию и передачу клеточных сигналов;[7] один фермент AOC (AOC3 ) функционирует как белок сосудистой адгезии (VAP-1) в некоторых тканях млекопитающих.[1]

Белки человека, содержащие этот домен

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c PDB: 3LOY​; Чанг С.М., Клема В.Дж., Джонсон Б.Дж., Муре М., Клинман Дж. П., Уилмот К.М. (март 2010 г.). «Кинетический и структурный анализ субстратной специфичности двух аминоксидаз меди из Hansenula polymorpha». Биохимия. 49 (11): 2540–50. Дои:10.1021 / bi901933d. ЧВК  2851405. PMID  20155950.
  2. ^ Конвери М.А., Филлипс С.Е., Макферсон М.Дж., Ядав К.Д., Ноулз П.Ф., Парсонс М.Р., Уилмот С.М., Блейкли В., Корнер А.С. (1995). «Кристаллическая структура хинофермента: аминоксидаза меди Escherichia coli при разрешении 2 A». Структура. 3 (11): 1171–1184. Дои:10.1016 / s0969-2126 (01) 00253-2. PMID  8591028.
  3. ^ Мюррей Дж. М., Конвери М. А., Филлипс С. Е., Макферсон М. Дж., Ноулз П. Ф., Парсонс М. Р., Уилмот С. М., Блейкли В., Корнер А. С., Альтон Г., Палсик М. М. (1997). «Каталитический механизм аминооксидазы хинофермента из Escherichia coli: изучение восстановительной полуреакции». Биохимия. 36 (7): 1608–1620. Дои:10.1021 / bi962205j. PMID  9048544.
  4. ^ Танизава К., Гусс Дж. М., Фриман Х. С., Ямагути Х., Уилс М.С., Дули Д.М., Мацунами Х., Макинтайр В.С., Руджеро С.Э. (1997). «Кристаллические структуры медьсодержащей аминоксидазы из Arthrobacter globiformis в холо- и апо-формах: последствия для биогенеза топахинона». Биохимия. 36 (51): 16116–16133. Дои:10.1021 / bi971797i. PMID  9405045.
  5. ^ Парсонс М.Р., Конвери М.А., Уилмот К.М., Ядав К.Д., Блейкли В., Корнер А.С., Филлипс С.Е., Макферсон М.Дж., Ноулз П.Ф. (ноябрь 1995 г.). «Кристаллическая структура хинофермента: аминоксидаза меди Escherichia coli при разрешении 2 A». Структура. 3 (11): 1171–84. Дои:10.1016 / s0969-2126 (01) 00253-2. PMID  8591028.
  6. ^ Уилмот С.М., Хайду Дж., Макферсон М.Дж., Ноулз П.Ф., Филипс С.Е. (ноябрь 1999 г.). «Визуализация дикислорода, связанного с медью во время ферментативного катализа». Наука. 286 (5445): 1724–8. Дои:10.1126 / science.286.5445.1724. PMID  10576737.
  7. ^ Гусс Дж. М., Фриман Х. С., Кумар В., Уилс М. С., Дули Д. М., Харви И., Макгирл М. А., Зубак В. М. (1996). «Кристаллическая структура эукариотической (проростки гороха) медьсодержащей аминоксидазы при разрешении 2,2 A». Структура. 4 (8): 943–955. Дои:10.1016 / s0969-2126 (96) 00101-3. PMID  8805580.

дальнейшее чтение