DDX27 - DDX27

DDX27
Идентификаторы
ПсевдонимыDDX27, DRS1, Drs1p, PP3241, RHLP, dJ686N3.1, HSPC259, DEAD-box геликаза 27
Внешние идентификаторыOMIM: 616621 MGI: 2385884 ГомолоГен: 6431 Генные карты: DDX27
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение DDX27
Геномное расположение DDX27
Группа20q13.13Начинать49,219,295 бп[1]
Конец49,244,077 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDX27 221780 s в формате fs.png

PBB GE DDX27 219108 x at fs.png

PBB GE DDX27 215693 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_017895
NM_001348187

NM_153065

RefSeq (белок)

NP_060365
NP_001335116

NP_694705

Расположение (UCSC)Chr 20: 49.22 - 49.24 МбChr 2: 167.02 - 167.03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полипептид-бокс DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) 27, также известный как DDX27, это человек ген.[5]

В белок кодируемый этим геном принадлежит к семейству белков DEAD-боксов, характеризующихся консервативными мотив Asp-Glu-Ala-Asp (МЕРТВЫЙ) и предположительно РНК геликасы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, связанных с изменением РНК. вторичная структура Такие как инициирование перевода, ядерный и митохондриальный сращивание, и рибосома и сплайсосома сборка. Судя по структуре их распространения, некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, и рост клеток и разделение. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, функция которого не определена.[5]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции DDX27. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ddx27tm1a (КОМП) Wtsi[10][11] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа, проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[12][13][14]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[8][15] Было проведено 27 испытаний и два фенотипы сообщалось. Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и в отдельном исследовании только 1% дожили до отлучение от груди (значительно меньше, чем Менделирующее соотношение ). Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких значительных отклонений от нормы.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124228 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017999 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: DDX27 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокс-полипептид 27».
  6. ^ "Сальмонелла данные о заражении Ddx27 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  7. ^ "Citrobacter данные о заражении Ddx27 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ а б c Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  10. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей». Архивировано из оригинал на 2012-03-20. Получено 2012-01-05.
  11. ^ "Информатика генома мыши".
  12. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  13. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  14. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  15. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение