GADD45A - GADD45A

GADD45A
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2 кг4
Идентификаторы
Псевдонимы	GADD45A, DDIT1, GADD45, задержка роста и индуцируемое повреждение ДНК альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 126335 MGI: 107799 ГомолоГен: 1449 Генные карты: GADD45A
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	67,688,334 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	67,037,457 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание киназы; • активность гомодимеризации белков; • активность гетеродимеризации белков; • связывание с N-концом белка; • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • ядерное пятнышко;
Биологический процесс	• апоптотический процесс; • остановка митотического клеточного цикла; • центросомный цикл; • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы; • отрицательная регуляция активности протеинкиназы; • передача сигнала в ответ на повреждение ДНК; • реакция на стресс; • положительное регулирование каскада JNK; • регуляция клеточного цикла; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • клеточный ответ на механический раздражитель; • положительная регуляция метаболических процессов активных форм кислорода; • остановка клеточного цикла; • положительная регуляция апоптотического процесса; • клеточный ответ на ионизирующее излучение; • клеточный цикл; • активация активности MAPKKK; • Ремонт ДНК; • положительная регуляция каскада p38MAPK; • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1647
	13197
	ENSG00000116717
	ENSMUSG00000036390
	P24522
	P48316
	NM_001924; NM_001199741; NM_001199742
	NM_007836
	NP_001186670; NP_001186671; NP_001915
	NP_031862
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD45 alpha это белок что у людей кодируется GADD45A ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген является членом группы генов, GADD45 гены, уровни транскриптов которых увеличиваются после стрессовых условий остановки роста и лечения ДНК-повреждающими агентами (мутагены ). Транскрипция этого гена, вызванная повреждением ДНК, опосредуется как p53 -зависимые и -независимые механизмы. Белок, кодируемый этим геном, отвечает на стрессы окружающей среды, опосредуя активацию стр.38 /JNK путь через MTK1 / MEKK4 киназа.^[7]

Приложения

Тот факт, что экспрессия этого гена является индикатором повреждения ДНК, был использован для создания in vitro тест на мутагенность, анализ GADD45a-GFP GreenScreen HC.^[8] Этот анализ состоит из клеточной линии, которая была сконструирована так, чтобы экспрессия GADD45A приводила к экспрессии зеленый флуоресцентный белок, который легко обнаружить. Чтобы проверить вещество на мутагенность, его наносят на эти клетки и измеряют флуоресценцию.

Взаимодействия

GADD45A был показан взаимодействовать с участием:

АУРКА,^[9]
Cdk1,^[10]^[11]^[12]^[13]
CCNB1,^[10]^[13]
GADD45GIP1^[14]
MAP3K4,^[15]
P21,^[12]^[16] и
PCNA.^[12]^[17]^[18]^[19]^[20]

Смотрите также

Gadd45

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116717 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036390 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Папатанасиу М.А., Керр Н.С., Роббинс Дж. Х., Макбрайд О. В., Аламо I-младший, Барретт С.Ф., Хиксон И.Д., Форнас А.Дж. младший (март 1991 г.). «Индукция ионизирующим излучением гена gadd45 в культивируемых клетках человека: отсутствие посредничества протеинкиназой C». Mol Cell Biol. 11 (2): 1009–16. Дои:10.1128 / MCB.11.2.1009. ЧВК 359769. PMID 1990262.
^ Холландер М.С., Аламо И., Джекман Дж., Ван М.Г., Макбрайд О.В., Форнас А.Дж. младший (декабрь 1993 г.). «Анализ гена gadd45 млекопитающих и его ответ на повреждение ДНК». J Biol Chem. 268 (32): 24385–93. PMID 8226988.
^ ^а ^б «Ген Entrez: задержка роста GADD45A и индуцируемое повреждением ДНК, альфа».
^ Уолмсли Р.М., Тейт М. (2012). «Анализ GADD45a-GFP GreenScreen HC». Методы Мол. Биол. Методы молекулярной биологии. 817: 231–50. Дои:10.1007/978-1-61779-421-6_12. ISBN 978-1-61779-420-9. PMID 22147576.
^ Санчес Р., Пантоха-Учеда Д., Прието Дж., Диркс Т., Маркаида М.Дж., Монтойя Дж., Кампос-Оливас Р., Бланко Ф.Дж. (июль 2010 г.). "Структура раствора остановки роста человека и повреждения ДНК 45alpha (Gadd45alpha) и его взаимодействия с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA) и киназой Aurora A". J. Biol. Chem. 285 (29): 22196–201. Дои:10.1074 / jbc.M109.069344. ЧВК 2903397. PMID 20460379.
^ ^а ^б Чжан К., Антиноре MJ, Ван XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (май 1999 г.). «Ассоциация с Cdc2 и ингибирование активности киназы Cdc2 / Cyclin B1 с помощью p53-регулируемого белка Gadd45». Онкоген. 18 (18): 2892–900. Дои:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.
^ Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (июнь 2000 г.). «Ингибирование GADD45 киназы Cdc2 коррелирует с GADD45-опосредованным подавлением роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. Дои:10.1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.
^ ^а ^б ^c Ян К., Маниконе А., Курсен Дж. Д., Линке С. П., Нагашима М., Форгес М., Ван XW (ноябрь 2000 г.). «Идентификация функционального домена в GADD45-опосредованной контрольной точке G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. Дои:10.1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.
^ ^а ^б Вайрапанди М., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерман Д.А. (сентябрь 2002 г.). «GADD45b и GADD45g являются ингибиторами киназы cdc2 / cyclinB1, играющими роль в контрольных точках клеточного цикла S и G2 / M, вызванных генотоксическим стрессом». J. Cell. Физиол. 192 (3): 327–38. Дои:10.1002 / jcp.10140. PMID 12124778.
^ Chung HK, Yi YW, Jung NC, Kim D, Suh JM, Kim H, Park KC, Song JH, Kim DW, Hwang ES, Yoon SH, Bae YS, Kim JM, Bae I, Shong M (июль 2003 г.). «CR6-взаимодействующий фактор 1 взаимодействует с белками семейства Gadd45 и модулирует клеточный цикл». J. Biol. Chem. 278 (30): 28079–88. Дои:10.1074 / jbc.M212835200. PMID 12716909.
^ Такекава М., Сайто Х. (ноябрь 1998 г.). «Семейство стресс-индуцируемых GADD45-подобных белков опосредует активацию стресс-зависимого MTK1 / MEKK4 MAPKKK». Ячейка. 95 (4): 521–30. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.
^ Чжао Х, Цзинь С., Антиноре MJ, Lung FD, Fan F, Blanck P, Roller P, Fornace AJ, Zhan Q (июль 2000 г.). «Центральная область Gadd45 необходима для его взаимодействия с p21 / WAF1». Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. Дои:10.1006 / exc.2000.4906. PMID 10912791.
^ Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан К., Бэ И., Чен С.Й., Гилмер TM, Кастан М.Б., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие p53-регулируемого белка Gadd45 с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Наука. 266 (5189): 1376–80. Дои:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.
^ Чен ИТ, Смит М.Л., О'Коннор П.М., Форнейс А.Дж. (ноябрь 1995 г.). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и свидетельства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1 / Cip1 с PCNA». Онкоген. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.
^ Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерманн Д.А. (июнь 2000 г.). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.
^ Холл PA, Кирси JM, Коутс PJ, Norman DG, Warbrick E, Cox LS (июнь 1995 г.). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.

дальнейшее чтение

Хильдесхайм Дж, Форнас А. Дж. (2003). «Gadd45a: неуловимый, но привлекательный ген-кандидат при раке поджелудочной железы». Clin. Рак Res. 8 (8): 2475–9. PMID 12171872.
Чен ИТ, Смит М.Л., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (1995). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и свидетельства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1 / Cip1 с PCNA». Онкоген. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.
Кирси Дж. М., Коутс П. Дж., Прескотт А. Р. и др. (1995). «Gadd45 - это белок, регулируемый ядерным клеточным циклом, который взаимодействует с p21Cip1». Онкоген. 11 (9): 1675–83. PMID 7478594.
Холл П.А., Кирси Дж. М., Коутс П. Дж. И др. (1995). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.
Carrier F, Smith ML, Bae I, et al. (1995). «Характеристика человеческого Gadd45, белка, регулируемого р53». J. Biol. Chem. 269 (51): 32672–7. PMID 7798274.
Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан Кью и др. (1994). «Взаимодействие p53-регулируемого белка Gadd45 с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Наука. 266 (5189): 1376–80. Дои:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.
Варбрик Э., Лейн Д.П., Гловер Д.М., Кокс Л.С. (1997). «Гомологичные области Fen1 и p21Cip1 конкурируют за связывание с одним и тем же сайтом на PCNA: потенциальный механизм для координации репликации и репарации ДНК». Онкоген. 14 (19): 2313–21. Дои:10.1038 / sj.onc.1201072. PMID 9178907.
Warbrick E, Хезерингтон W, Lane DP, Glover DM (1998). «PCNA-связывающие белки в Drosophila melanogaster: анализ консервативного связывающего домена PCNA». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (17): 3925–32. Дои:10.1093 / nar / 26.17.3925. ЧВК 147798. PMID 9705499.
Такекава М., Сайто Х (1998). «Семейство стресс-индуцируемых GADD45-подобных белков опосредует активацию стресс-зависимого MTK1 / MEKK4 MAPKKK». Ячейка. 95 (4): 521–30. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.
Carrier F, Georgel PT, Pourquier P и др. (1999). «Gadd45, стрессовый белок, чувствительный к р53, изменяет доступность ДНК на поврежденном хроматине». Мол. Cell. Биол. 19 (3): 1673–85. Дои:10.1128 / MCB.19.3.1673. ЧВК 83961. PMID 10022855.
Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW и др. (1999). «Ассоциация с Cdc2 и ингибирование активности киназы Cdc2 / Cyclin B1 с помощью p53-регулируемого белка Gadd45». Онкоген. 18 (18): 2892–900. Дои:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.
Джин С., Антиноре М.Дж., Лунг Ф.Д. и др. (2000). «Ингибирование GADD45 киназы Cdc2 коррелирует с GADD45-опосредованным подавлением роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. Дои:10.1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.
Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г. и др. (2000). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.
Йи Ю.В., Ким Д., Юнг Н. и др. (2000). «Белки семейства Gadd45 являются коактиваторами рецепторов ядерных гормонов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 272 (1): 193–8. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2760. PMID 10872826.
Чжао Х., Цзинь С., Антиноре М.Дж. и др. (2000). «Центральная область Gadd45 необходима для его взаимодействия с p21 / WAF1». Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. Дои:10.1006 / exc.2000.4906. PMID 10912791.
Ян К., Маниконе А., Курсен Дж. Д. и др. (2001). «Идентификация функционального домена в GADD45-опосредованной контрольной точке G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. Дои:10.1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Ковальский O, Lung FD, Roller PP, Fornace AJ (2001). «Олигомеризация человеческого белка Gadd45a». J. Biol. Chem. 276 (42): 39330–9. Дои:10.1074 / jbc.M105115200. PMID 11498536.

внешние ссылки

СМИ, связанные с GADD45A в Wikimedia Commons

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116717 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036390 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1990262-5] Папатанасиу М.А., Керр Н.С., Роббинс Дж. Х., Макбрайд О. В., Аламо I-младший, Барретт С.Ф., Хиксон И.Д., Форнас А.Дж. младший (март 1991 г.). «Индукция ионизирующим излучением гена gadd45 в культивируемых клетках человека: отсутствие посредничества протеинкиназой C». Mol Cell Biol. 11 (2): 1009–16. Дои:10.1128 / MCB.11.2.1009. ЧВК 359769. PMID 1990262.

[pmid8226988-6] Холландер М.С., Аламо И., Джекман Дж., Ван М.Г., Макбрайд О.В., Форнас А.Дж. младший (декабрь 1993 г.). «Анализ гена gadd45 млекопитающих и его ответ на повреждение ДНК». J Biol Chem. 268 (32): 24385–93. PMID 8226988.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: задержка роста GADD45A и индуцируемое повреждением ДНК, альфа».

[pmid22147576-8] Уолмсли Р.М., Тейт М. (2012). «Анализ GADD45a-GFP GreenScreen HC». Методы Мол. Биол. Методы молекулярной биологии. 817: 231–50. Дои:10.1007/978-1-61779-421-6_12. ISBN 978-1-61779-420-9. PMID 22147576.

[pmid20460379-9] Санчес Р., Пантоха-Учеда Д., Прието Дж., Диркс Т., Маркаида М.Дж., Монтойя Дж., Кампос-Оливас Р., Бланко Ф.Дж. (июль 2010 г.). "Структура раствора остановки роста человека и повреждения ДНК 45alpha (Gadd45alpha) и его взаимодействия с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA) и киназой Aurora A". J. Biol. Chem. 285 (29): 22196–201. Дои:10.1074 / jbc.M109.069344. ЧВК 2903397. PMID 20460379.

[pmid10362260-10] а ^б Чжан К., Антиноре MJ, Ван XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (май 1999 г.). «Ассоциация с Cdc2 и ингибирование активности киназы Cdc2 / Cyclin B1 с помощью p53-регулируемого белка Gadd45». Онкоген. 18 (18): 2892–900. Дои:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.

[pmid10747892-11] Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (июнь 2000 г.). «Ингибирование GADD45 киназы Cdc2 коррелирует с GADD45-опосредованным подавлением роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. Дои:10.1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.

[pmid10973963-12] а ^б ^c Ян К., Маниконе А., Курсен Дж. Д., Линке С. П., Нагашима М., Форгес М., Ван XW (ноябрь 2000 г.). «Идентификация функционального домена в GADD45-опосредованной контрольной точке G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. Дои:10.1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.

[pmid12124778-13] а ^б Вайрапанди М., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерман Д.А. (сентябрь 2002 г.). «GADD45b и GADD45g являются ингибиторами киназы cdc2 / cyclinB1, играющими роль в контрольных точках клеточного цикла S и G2 / M, вызванных генотоксическим стрессом». J. Cell. Физиол. 192 (3): 327–38. Дои:10.1002 / jcp.10140. PMID 12124778.

[pmid12716909-14] Chung HK, Yi YW, Jung NC, Kim D, Suh JM, Kim H, Park KC, Song JH, Kim DW, Hwang ES, Yoon SH, Bae YS, Kim JM, Bae I, Shong M (июль 2003 г.). «CR6-взаимодействующий фактор 1 взаимодействует с белками семейства Gadd45 и модулирует клеточный цикл». J. Biol. Chem. 278 (30): 28079–88. Дои:10.1074 / jbc.M212835200. PMID 12716909.

[pmid9827804-15] Такекава М., Сайто Х. (ноябрь 1998 г.). «Семейство стресс-индуцируемых GADD45-подобных белков опосредует активацию стресс-зависимого MTK1 / MEKK4 MAPKKK». Ячейка. 95 (4): 521–30. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.

[pmid10912791-16] Чжао Х, Цзинь С., Антиноре MJ, Lung FD, Fan F, Blanck P, Roller P, Fornace AJ, Zhan Q (июль 2000 г.). «Центральная область Gadd45 необходима для его взаимодействия с p21 / WAF1». Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. Дои:10.1006 / exc.2000.4906. PMID 10912791.

[pmid7973727-17] Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан К., Бэ И., Чен С.Й., Гилмер TM, Кастан М.Б., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие p53-регулируемого белка Gadd45 с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Наука. 266 (5189): 1376–80. Дои:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.

[pmid7478510-18] Чен ИТ, Смит М.Л., О'Коннор П.М., Форнейс А.Дж. (ноябрь 1995 г.). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и свидетельства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1 / Cip1 с PCNA». Онкоген. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.

[pmid10828065-19] Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерманн Д.А. (июнь 2000 г.). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.

[pmid7784094-20] Холл PA, Кирси JM, Коутс PJ, Norman DG, Warbrick E, Cox LS (июнь 1995 г.). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]