GSTK1 - GSTK1
Глутатион S-трансфераза каппа 1 (GSTK1) - это фермент что у людей кодируется GSTK1 ген который расположен на седьмая хромосома.[5] Он принадлежит к суперсемейству ферментов, известных как глутатион S-трансфераза (GST), которые в основном известны клеточная детоксикация.[6] Ген GSTK1 состоит из восьми экзоны и семь интроны и хотя он является членом семейства GST, было обнаружено, что его структура похожа на бактериальную HCCA (2-гидроксихромен-2-карбоксилат) изомеразы и бактериальные дисульфидные связи, образующие DsbA оксидоредуктаза. Это сходство позже позволило переименовать фермент GSTK1 в DsbA-L.[7] Исследования также показали, что несколько вариаций гена GSTK1 могут быть ответственны за метаболические заболевания и некоторые виды рак.[7]
Структура
Фермент GSTK1 представляет собой гомодимер и, как и все GST, он содержит TRX -подобный домен и спиральный домен. Однако GSTK1 существенно отличается по своему вторичная структура по сравнению с другими GST. Было замечено, что спиральный домен расположен между βαβ и ββα мотивы TRX-подобного домена, а не TRX-подобного домена и C-терминал спиральный домен, соединенный коротким линкером альфа-спирали как обычно видно в GST.[6] Кроме того, димер GSTK1 имеет форму бабочки, а не V-образную щель, как в других классах.[6] Что касается гена GSTK1, то это ~ 5 kb длинный, имеет восемь экзонов, расположен на хромосоме 7q34 и включает элемент инициатора на сайте начала транскрипции вместо ТАТА или Коробка CCAAT.[5]
Функция
GSTK1 продвигает адипонектин мультимеризация в эндоплазматический ретикулум (ER), хотя механизм, с помощью которого это происходит, неизвестен.[8] GSTK1 может предотвратить стресс ER и индуцированное ER стрессом подавление адипонектина, подразумевая, что GSTK1 помогает функциям ER. GSTK1 находится в ER, а также в митохондрии из гепатоциты. Это указывает на потенциальную роль GSTK1 во взаимодействии между двумя органеллы; хотя это плохо понимается.[8]
Открытие GSTK1 в пероксисома привело к исследованиям, основанным на его функции. Было высказано предположение, что аналогично GSTA, GSTK1 может играть роль в буферизации ацил-КоА и ксенобиотик-КоА и участвовать в их связующей деятельности. GSTK1 также может отвечать за детоксикацию перекиси липидов создается в пероксисоме на основе пероксидаза активность по отношению к трем субстратам: трет-бутилгидропероксид, гидропероксид кумола, и 15-S-гидроперокси-5,8,11,13-эйкозатетраеновая кислота.[5]
Клиническое значение
Уровень экспрессии адипонектина связан с такими заболеваниями, как резистентность к инсулину, ожирение, и диабет 2 типа. Уменьшение количества белка указывает на более высокую вероятность получения указанных заболеваний. Поскольку видно, что GSTK1 играет роль в мультимеризации адипонектина, этот фермент может регулировать концентрацию адипонектина и, таким образом, увеличивать чувствительность к инсулину и защитить от диабета.[7] Кроме того, ген GSTK1 не регулируется, когда он вызван окислительный стресс и чрезмерно выражены во многих опухоли приводящие к трудностям во время рака химиотерапия.[9] Более того, было замечено, что экспрессия гена GSTK1 значительно увеличивается в корреляции с лекарственной устойчивостью в опухолевых клетках, таких как эритролейкоз и аденокарцинома молочной железы предполагая, что это вместе с GSTP1 и GSTA4, может быть причиной лекарственной устойчивости.[10]
GSTK1 также может быть потенциальным инструментом для исследования рака. Белки, фосфорилированные тирозином отвечают за многие клеточные функции, такие как рост клетки, деление, адгезия, и подвижность. Эти действия также очень связаны с раком, и поэтому изучение этого белка может позволить получить доступ к информации, которая может классифицировать опухоли на прогноз и предсказание.[11] Благодаря C-концевому домену SH2 GSTK1, фосфорилированные по тирозину белки могут связываться с ним, что облегчает обнаружение белка и его изучение.[11]
Взаимодействия
Было замечено, что GSTK1 взаимодействует с:
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197448 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029864 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c Морель Ф., Раух С., Пети Е., Питон А, Трет Н., Коулз Б., Гийозо А. (апрель 2004 г.). «Характеристика генов и белков каппа-глутатион-S-трансферазы человека и доказательства пероксисомной локализации». Журнал биологической химии. 279 (16): 16246–53. Дои:10.1074 / jbc.M313357200. PMID 14742434.
- ^ а б c Ли Дж, Ся З, Дин Дж (сентябрь 2005 г.). «Тиоредоксиноподобный домен глутатионтрансферазы человека каппа-класса обнаруживает гомологию последовательностей и структурное сходство с ферментом тета-класса». Белковая наука. 14 (9): 2361–9. Дои:10.1110 / л.с. 051463905. ЧВК 2253485. PMID 16081649.
- ^ а б c Гао Ф, Фанг Ц., Чжан Р., Лу Дж., Лю Х., Ван Ц., Ма Х, Сюй Дж, Цзя В., Сян К. (2009). «Полиморфизм гена DsbA-L связан с секрецией инсулина и распределением жировых отложений у населения Китая». Эндокринный журнал. 56 (3): 487–94. Дои:10.1507 / endocrj.k08e-322. PMID 19225211.
- ^ а б c d Лю М., Чен Х, Вэй Л., Ху Д., Донг К., Цзя В., Донг Л.К., Лю Ф. (апрель 2015 г.). «Локализация эндоплазматического ретикулума (ER) имеет решающее значение для белка DsbA-L для подавления стресса ER и подавления адипонектина в адипоцитах». Журнал биологической химии. 290 (16): 10143–8. Дои:10.1074 / jbc.M115.645416. ЧВК 4400330. PMID 25739441.
- ^ Неберт DW, Василиу В. (ноябрь 2004 г.). «Анализ семейства генов глутатион S-трансферазы (GST)». Геномика человека. 1 (6): 460–4. Дои:10.1186/1479-7364-1-6-460. ЧВК 3500200. PMID 15607001.
- ^ Калинина Е.В., Берозов Т.Т., Штиль А.А., Чернов Н.Н., Гласунова В.А., Новичкова М.Д., Нурмурадов Н.К. (ноя 2012). «Экспрессия генов изоформ глутатионтрансферазы GSTP1-1, GSTA4-4 и GSTK1-1 в опухолевых клетках при формировании лекарственной устойчивости к цисплатину». Вестник экспериментальной биологии и медицины. 154 (1): 64–7. Дои:10.1007 / s10517-012-1876-4. PMID 23330092. S2CID 42062131.
- ^ а б Цю Ф, Хуан Д., Сяо Х, Цю Ф, Лу Л., Не Дж (апрель 2013 г.). «Обнаружение тирозин-фосфорилированных белков в тканях гепатоцеллюлярной карциномы с использованием комбинации GST ‑ Nck1 ‑ SH2 pull-down и двумерного электрофореза». Отчеты по молекулярной медицине. 7 (4): 1209–14. Дои:10.3892 / mmr.2013.1324. PMID 23426619.
дальнейшее чтение
- Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
- Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
- Робинсон А., Хаттли, Джорджия, Бут HS, Совет PG (май 2004 г.). «Моделирование и биоинформатические исследования человеческой глутатион-трансферазы каппа-класса предсказывают новое третье семейство глутатион-трансфераз, сходное с прокариотическими изомеразами 2-гидроксихромен-2-карбоксилата». Биохимический журнал. 379 (Pt 3): 541–52. Дои:10.1042 / BJ20031656. ЧВК 1224102. PMID 14709161.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
- Ли Дж, Ся З, Дин Дж (сентябрь 2005 г.). «Тиоредоксиноподобный домен глутатионтрансферазы человека каппа-класса обнаруживает гомологию последовательностей и структурное сходство с ферментом тета-класса». Белковая наука. 14 (9): 2361–9. Дои:10.1110 / л.с. 051463905. ЧВК 2253485. PMID 16081649.
- Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
