Gla домен - Gla domain

GLA домен
1dan opm.png
Закрепление Фактор свертывания крови VIIa к мембране через домен GLA
Идентификаторы
СимволGla
PfamPF00594
ИнтерПроIPR000294
PROSITEPDOC00011
SCOP21cfi / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство89
Белок OPM1pfx
Мембранома342

Витамин К-зависимое карбоксилирование / гамма-карбоксиглутаминовая кислота (GLA) домен это белковый домен который содержит посттрансляционные модификации многих остатков глутамата путем витамин К -зависимый карбоксилирование формировать γ-карбоксиглутамат (Gla). Белки с этим доменом неофициально известны как Gla белки. Остатки Gla ответственны за связывание ионов кальция с высоким сродством.[1][2]

Домен GLA связывает ионы кальция, хелатируя их между двумя карбоновая кислота остатки. Эти остатки являются частью области, которая начинается на N-конце зрелой формы белков Gla и заканчивается консервативным ароматическим остатком. Это приводит к консервативному мотиву Gla-x (3) -Gla-x-Cys.[3] который находится в середине домена и, по-видимому, важен для распознавания субстрата карбоксилазой.

Решены трехмерные структуры нескольких доменов Gla.[4][5] Ионы кальция вызывают конформационные изменения в домене Gla и необходимы для правильного сворачивания домена Gla. Общей структурной особенностью функциональных доменов Gla является кластеризация N-концевых гидрофобных остатков в гидрофобный участок, который опосредует взаимодействие с мембраной поверхности клетки.[5]

В настоящее время следующие Gla-содержащие белки человека (Gla-белки) охарактеризованы до уровня первичной структуры: факторы свертывания крови II (протромбин), VII, IX и X, антикоагулянтные белки C и S и фактор X-нацеливание белок Z. Костный белок Gla остеокальцин, ингибирование кальцификации матричный белок Gla (MGP), рост клеток регулирующий белок "специфический ген остановки роста 6" ГАЗ6, периостин (фактор, необходимый для миграции и адгезии эпителиальных клеток), плюс два богатых пролином Gla-протеина (PRGP) и два трансмембранных Gla-протеина (TMGP), функции которых неизвестны.[6][7][8]

Во всех случаях, когда их функция была известна, присутствие остатков Gla в этих белках оказалось важным для функциональной активности.[9]

Подсемейства

Белки человека, содержащие этот домен

  1. Тромбин (F2) (он же фактор свертывания крови II; также его предшественник протромбин) - участвует в коагуляция
  2. Фактор VII (F7) - участвует в коагуляции
  3. Фактор IX (F9) - участвует в коагуляции
  4. Фактор X (F10) - участвует в коагуляции
  5. Белок С (PROC) - роли в регулировании антикоагулянт, воспаление, смерть клетки, и поддержание проницаемость стенок кровеносных сосудов
  6. Белок S (PROS1) - участвует в коагуляции
  7. Белок Z (ПРОЗ) - участвует в коагуляции
  8. Остеокальцин (BGLAP) - участвует в минерализация костей.
  9. Матричный белок gla (MGP) - ингибитор кальцификация мягких тканей и играет роль в организации костей
  10. ГАЗ6 - считается, что участвует в стимуляции пролиферации клеток
  11. Транстиретин (TTR), ранее известный как преальбумин, переносит тироксин (T4) в кровь и спинномозговую жидкость.
  12. Ингибитор интер-альфа-трипсина тяжелая цепь H2 (ITIH2 ) - играет роль в островках поджелудочной железы и многих других клетках
  13. Периостин - фактор, необходимый для миграции клеток (эмбриональное развитие, и иммунные ответы ) и адгезия эпителиальные клетки, чрезмерно выраженная при некоторых видах рака
  14. Обогащенный пролином белок gla 1 (PRGP1)[6][7]
  15. Обогащенный пролином белок gla 2 (PRGP2)[6][7][8]
  16. Трансмембранный γ-карбоксиглутамилпротеин 3 (TMG3)[7]
  17. Трансмембранный γ-карбоксиглутамилпротеин 4 (TMG4)[7]

Рекомендации

  1. ^ Фридман PA, Przysiecki CT (1987). «Витамин К-зависимое карбоксилирование». Int. J. Biochem. 19 (1): 1–7. Дои:10.1016 / 0020-711X (87) 90116-9. PMID  3106112.
  2. ^ Вермеер С (1990). «Гамма-карбоксиглутамат-содержащие белки и витамин К-зависимая карбоксилаза». Biochem. J. 266 (3): 625–636. Дои:10.1042 / bj2660625. ЧВК  1131186. PMID  2183788.
  3. ^ Прайс PA, Fraser JD, Metz-Virca G (1987). «Молекулярное клонирование матричного белка Gla: последствия для распознавания субстрата витамин К-зависимой гамма-карбоксилазой». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (23): 8335–8339. Дои:10.1073 / пнас.84.23.8335. ЧВК  299537. PMID  3317405.
  4. ^ Фридман С.Дж., Фури BC, Фури Б., Балежа Д.Д. (1995). «Структура безметалловой области связывания богатой гамма-карбоксиглутаминовой кислотой мембраны фактора IX по данным двумерной ЯМР-спектроскопии». J. Biol. Chem. 270 (14): 7980–7987. Дои:10.1074 / jbc.270.14.7980. PMID  7713897.
  5. ^ а б Фридман С.Дж., Фури BC, Фури Б., Балежа Д.Д., Блоштейн, доктор медицины, Якобс М. (1996). «Идентификация сайта связывания фосфолипидов в витамин К-зависимом факторе IX белка свертывания крови». J. Biol. Chem. 271 (27): 16227–16236. Дои:10.1074 / jbc.271.27.16227. PMID  8663165.
  6. ^ а б c Кулман Дж. Д., Харрис Дж. Э., Холдеман Б. А., Дэви Е. В. (август 1997 г.). «Первичная структура и тканевое распределение двух новых белков гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, богатых пролином». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (17): 9058–62. Дои:10.1073 / пнас.94.17.9058. ЧВК  23027. PMID  9256434.
  7. ^ а б c d е Кулман Дж. Д., Харрис Дж. Э., Се Л., Дэви Е. В. (февраль 2001 г.). «Идентификация двух новых трансмембранных белков гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, широко экспрессируемых в тканях плода и взрослого». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (4): 1370–5. Дои:10.1073 / pnas.98.4.1370. ЧВК  29263. PMID  11171957.
  8. ^ а б Кульман Дж. Д., Харрис Дж. Э., Се Л., Дэви Е. В. (май 2007 г.). «Богатый пролином белок Gla 2 представляет собой витамин К-зависимый белок клеточной поверхности, который связывается с коактиватором транскрипции Yes-ассоциированным белком». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (21): 8767–72. Дои:10.1073 / pnas.0703195104. ЧВК  1885577. PMID  17502622.
  9. ^ Сатти, Дж. (1993-03-01). «Синтез витамин К-зависимых белков» (PDF). Журнал FASEB. Федерация американских обществ экспериментальной биологии. 7 (5): 445–52. Дои:10.1096 / fasebj.7.5.8462786. PMID  8462786. Получено 2014-11-17.