Фактор X - Factor X

F10
Белок F10 PDB 1c5m.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыF10, FX, FXA, фактор коагуляции X
Внешние идентификаторыOMIM: 613872 MGI: 103107 ГомолоГен: 30976 Генные карты: F10
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человек)[1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение F10
Геномное расположение F10
Группа13q34Начинать113,122,799 бп[1]
Конец113,149,529 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE F10 205620 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000504
NM_001312674
NM_001312675

NM_001242368
NM_007972

RefSeq (белок)

NP_000495
NP_001299603
NP_001299604

NP_001229297
NP_031998

Расположение (UCSC)Chr 13: 113.12 - 113.15 МбChr 8: 13.04 - 13.06 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор X, также известный эпоним Фактор Стюарта – Проуэра, является фермент (EC 3.4.21.6 ) из каскад коагуляции. Это серинэндопептидаза (группа протеаз S1, Клан ПА ). Фактор X синтезируется в печень и требует витамин К для его синтеза.

Фактор X активируется путем гидролиза в фактор Ха обоими фактор IX (с его кофактором, фактор VIII в комплексе, известном как внутренняя Tenase) и фактор VII со своим кофактором, тканевый фактор (комплекс, известный как внешний Tenase ). Таким образом, это первый член последний общий путь или же путь тромбина.

Он действует путем раскалывания протромбин в двух местах ( аргумент -чт а затем аргумент -ile облигация), что дает активную тромбин. Этот процесс оптимизируется, когда фактор Ха находится в комплексе с активированным кофактор V в протромбиназа сложный.

Фактор Ха инактивируется протеин Z-зависимый ингибитор протеазы (ZPI), а ингибитор сериновой протеазы (Серпин). Сродство этого белка к фактору Ха увеличивается в 1000 раз при наличии белок Z, в то время как он не требует белка Z для инактивации фактор XI. Дефекты протеина Z приводят к повышению активности фактора Ха и склонности к тромбозам.

Период полувыведения фактора X составляет 40–45 часов.

Структура

Первая кристаллическая структура человеческого фактора Ха была депонирована в мае 1993 года. На сегодняшний день 191 кристаллическая структура фактора Ха с различными ингибиторами депонирована в банке данных по белкам. Активный центр фактора Xa разделен на четыре субпакета: S1, S2, S3 и S4. Подложка S1 определяет главный компонент избирательности и связывания. Вспомогательный карман S2 небольшой, неглубокий и плохо очерченный. Он сливается с подпунктом S4. Дополнительный карман S3 расположен на краю кармана S1 и довольно подвержен воздействию растворителя. Субкарман S4 имеет три лиганд-связывающих домена: «гидрофобный бокс», «катионную дыру» и водный сайт. Ингибиторы фактора Ха обычно связываются в L-образной конформации, где одна группа лиганда занимает анионный карман S1, выстланный остатками Asp189, Ser195 и Tyr228, а другая группа лиганда занимает ароматический карман S4, выстланный остатками Tyr99, Phe174. , и Trp215. Обычно эти два сайта взаимодействия связывает довольно жесткая линкерная группа.[5]

Генетика

Человеческий фактор X ген расположен на хромосома 13 (13q34).

Роль в болезни

Врожденный дефицит фактора X встречается очень редко (1: 1000000) и может проявляться носовое кровотечение (кровотечение из носа), гемартроз (кровотечение в суставы) и желудочно-кишечная кровопотеря. Помимо врожденного дефицита, низкие уровни фактора X могут иногда возникать при ряде болезненных состояний. Например, дефицит фактора X можно увидеть в амилоидоз, где фактор X адсорбируется на амилоидных фибриллах в сосудистой сети.

Дефицит витамина К или антагонизм со стороны варфарин (или аналогичное лекарство) приводит к выработке неактивного фактора X. При терапии варфарином это желательно для предотвращения тромбоз. По состоянию на конец 2007 г. четыре из пяти появляющихся антикоагуляция терапевтические средства нацелены на этот фермент.[6]

Ингибирование фактора Ха может предложить альтернативный метод антикоагуляции. Прямые ингибиторы Ха популярные антикоагулянты.

Полиморфизм фактора X был связан с повышенной распространенностью бактериальных инфекций, что указывает на возможную роль в прямом регулировании иммунного ответа на бактериальные патогены.[7]

Терапевтическое использование

Фактор X является частью свежезамороженная плазма и комплекс протромбиназы. Существует два коммерчески доступных концентрата фактора X: «Фактор X P Behring», производимый CSL Behring,[8] и фактор X высокой чистоты Коагадекс произведено Лаборатория биопродуктов и одобрен для использования в Соединенных Штатах FDA в октябре 2015 года и в ЕС в марте 2016 года после предварительного принятия CHMP и COMP.[9][10][11][12]

Kcentra, производимый CSL Behring, представляет собой концентрат, содержащий факторы коагуляции II, VII, IX и X, а также антитромботические белки C и S.[13]

Использование в биохимии

Протеаза фактора Ха может использоваться в биохимии для отщепления белковых меток, которые улучшают экспрессию или очистку представляющего интерес белка. Его предпочтительный сайт расщепления (после аргинина в последовательности Ile-Glu / Asp-Gly-Arg, IEGR или IDGR) можно легко сконструировать между последовательностью метки и представляющим интерес белком. После экспрессии и очистки метка протеолитически удаляется фактором Ха.

Фактор Ха

Пути свертывания крови in vivo показывая центральную роль, которую играет тромбин

Фактор Ха - активированная форма фактор коагуляции X, одноименный фактор Стюарта-Проуэра. Фактор X - это фермент, а серинэндопептидаза, который играет ключевую роль на нескольких этапах система коагуляции. Фактор X равен синтезированный в печень. Наиболее часто используемые антикоагулянты в клинической практике, варфарин и гепарин серия антикоагулянтов и фондапаринукс, действуют, чтобы подавить действие фактора Ха в различной степени.

Традиционные модели коагуляции, разработанные в 1960-х годах, предусматривали два отдельных каскада, внешний (тканевый фактор (ТФ)) путь и внутренний путь. Эти пути сходятся к общей точке - образованию комплекса Фактора Ха / Ва, который вместе с кальций и связаны фосфолипиды поверхность, генерировать тромбин (фактор IIa) из протромбин (фактор II).

Новая модель, клеточная модель антикоагуляции, по-видимому, более полно объясняет этапы свертывания крови. Эта модель состоит из трех стадий: 1) инициация коагуляции на клетках, несущих ТФ, 2) усиление прокоагулянтного сигнала тромбином, генерируемым на клетке, несущей ТФ, и 3) распространение образования тромбина на тромбоцит поверхность. Фактор Ха играет ключевую роль на всех трех этапах.[14]

На этапе 1 Фактор VII связывается с трансмембранный белок ТФ на поверхности клеток превращается в фактор VIIa. Результатом является комплекс фактора VIIa / TF, который катализирует активацию фактора X и Фактор IX. Фактор Ха, образующийся на поверхности клетки, несущей ТФ, взаимодействует с Фактор Va сформировать протромбиназный комплекс который генерирует небольшие количества тромбина на поверхности клеток, несущих ТФ.

На стадии 2, стадии амплификации, если было произведено достаточно тромбина, то происходит активация тромбоцитов и связанных с тромбоцитами кофакторы происходит.

На 3 стадии - образование тромбина, Фактор XIa активирует свободный фактор IX на поверхности активированных тромбоцитов. Активированный фактор IXa с Фактор VIIIa формирует комплекс "тенасе". Этот «теназный» комплекс активирует больше фактора X, который, в свою очередь, образует новые протромбиназные комплексы с фактором Va. Фактор Ха является основным компонентом протромбиназного комплекса, который конвертирует большие количества протромбина - «тромбиновый взрыв». Каждая молекула фактора Ха может генерировать 1000 молекул тромбина. Этот большой выброс тромбина ответственен за фибрин полимеризация сформировать тромб.

Фактор Ха также играет роль в других биологических процессах, которые напрямую не связаны с коагуляцией, таких как заживление ран, ремоделирование тканей, воспаление, ангиогенез и атеросклероз.

Подавление синтеза или активности фактора X - это механизм действия многих антикоагулянтов, используемых сегодня. Варфарин, синтетическое производное кумарин, является наиболее широко используемым пероральным антикоагулянтом в США. В некоторых странах Европы другие производные кумарина (фенпрокумон и аценокумарол ) используются. Эти агенты, известные как антагонисты витамина К (VKA), ингибируют витамин K-зависимое карбоксилирование факторов II (протромбин), VII, IX, X в гепатоцитах. Это карбоксилирование после перевода важно для физиологической активности.[15]

Гепарин (нефракционированный гепарин) и его производные низкомолекулярный гепарин (НМГ) привязать к плазма кофактор антитромбин (AT) инактивировать несколько факторов свертывания крови IIa, Xa, XIa и XIIa. Сродство нефракционированного гепарина и различных НМГ к фактору Ха значительно различается. Эффективность антикоагулянтов на основе гепарина возрастает по мере увеличения селективности к фактору Ха. НМГ демонстрирует повышенную инактивацию фактора Ха по сравнению с нефракционированным гепарином, а фондапаринукс, агент на основе критической пентасахаридной последовательности гепарина, демонстрирует большую селективность, чем НМГ. Эта инактивация фактора Ха гепаринами называется «непрямой», поскольку она основана на присутствии AT, а не на прямом взаимодействии с фактором Ха.

Недавно была разработана новая серия специфических ингибиторов фактора Ха прямого действия. К ним относятся препараты ривароксабан, апиксабан, Betrixaban, LY517717, дарексабан (YM150), Эдоксабан и 813893. Эти агенты имеют несколько теоретических преимуществ перед современной терапией. Их можно вводить перорально. У них быстрое начало действия. И они могут быть более эффективными против фактора Ха, поскольку они ингибируют как свободный фактор Ха, так и фактор Ха в протромбиназном комплексе.[16]

История

Американские и британские ученые независимо друг от друга описали дефицит фактора X в 1953 и 1956 годах соответственно. Как и некоторые другие факторы свертывания крови, этот фактор был первоначально назван в честь этих пациентов, г-на Руфуса Стюарта (1921) и мисс Одри Проуэр (1934).

Взаимодействия

Фактор X показал взаимодействовать с Ингибитор пути тканевого фактора.[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126218 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000031444 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Презентация по ингибиторам прямого фактора Ха». Архивировано из оригинал на 2016-03-03. Получено 2010-04-08.
  6. ^ Рон Уинслоу; Эйвери Джонсон (2007-12-10). "Гонка за новым разбавителем крови". Wall Street Journal. п. A12. В архиве из оригинала от 10.03.2016. Получено 2008-01-06. Этот всплеск интереса отражает растущее понимание того, что врачи называют каскадом свертывания крови ... Четыре новых препарата для разжижения крови нацелены на фермент под названием фактор Ха, один из нескольких ферментов, которые играют важную роль в этом каскаде.
  7. ^ Скаар, Эрик П .; Шкив, Джилл; Джером, Ребекка Н .; Пруйссерс, Андреа; Ширей-Райс, Яна К .; Маргаритис, Париж; Химмель, Лорен Э .; Монтейт, Эндрю Дж .; Чоби, Джейкоб Э. (19 февраля 2019 г.). «PheWAS раскрывает патологическую роль фактора X свертывания крови во время инфекции Acinetobacter baumannii». Инфекция и иммунитет. 87 (5): IAI.00031–19. Дои:10.1128 / IAI.00031-19. ISSN  0019-9567. ЧВК  6479028. PMID  30782860.
  8. ^ Марк Брукер (2008): «Реестр концентратов фактора свертывания крови». Издание восьмое, 2008 г., Всемирная федерация гемофилии
  9. ^ «FDA одобрило первый концентрат фактора X для лечения пациентов с редким наследственным нарушением свертываемости крови» (Пресс-релиз). FDA США. 20 октября 2015 г. Архивировано с оригинал 21 октября 2015 г.. Получено Двадцать первое октября, 2015. До сегодняшнего утверждения орфанных препаратов у пациентов с наследственной недостаточностью фактора X не было специальной заместительной терапии фактора свертывания крови.
  10. ^ «Коагадекс». Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. 28 июня 2017. Архивировано 22 июля 2017 года.. Получено 2 апреля 2020.CS1 maint: неподходящий URL (связь)
  11. ^ «Коагадекс». Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. 21 сентября 2018. В архиве из оригинала 17 декабря 2019 г.. Получено 2 апреля 2020.
  12. ^ «Коагадекс ЕПАР». Европейское агентство по лекарствам (EMA). Получено 21 апреля 2020.
  13. ^ «Kцентра-протромбин, фактор свертывания крови vii человека, фактор свертывания крови IX человека, фактор свертывания крови x человек, протеин c, белок s человека и водный набор». DailyMed. 22 октября 2018 г.. Получено 21 апреля 2020.
  14. ^ Хоффман М., Монро Д.М. (февраль 2007 г.). «Коагуляция 2006: современный взгляд на гемостаз». Гематологические / онкологические клиники Северной Америки. 21 (1): 1–11. Дои:10.1016 / j.hoc.2006.11.004. PMID  17258114.
  15. ^ Голан, Д. Э. (2012). Принципы фармакологии Патофизиологические основы лекарственной терапии. Филадельфия: Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. п. 387. ISBN  978-1-4511-1805-6.
  16. ^ Turpie AG (июнь 2007 г.). «Пероральные прямые ингибиторы фактора Ха в разработке для профилактики и лечения тромбоэмболических заболеваний». Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов. 27 (6): 1238–47. CiteSeerX  10.1.1.536.872. Дои:10.1161 / ATVBAHA.107.139402. PMID  17379841.
  17. ^ Broze GJ, Warren LA, Novotny WF, Higuchi DA, Girard JJ, Miletich JP (февраль 1988 г.). «Ингибитор свертывания, связанный с липопротеинами, который ингибирует комплекс фактор VII-тканевой фактор, также ингибирует фактор Ха: понимание его возможного механизма действия». Кровь. 71 (2): 335–43. Дои:10.1182 / blood.V71.2.335.335. PMID  3422166.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение