MAP1LC3A - MAP1LC3A

MAP1LC3A
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3ECI, 3WAL, 3WAN, 4ZDV
Идентификаторы
Псевдонимы	MAP1LC3A, ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, белок 1, связанный с микротрубочками, легкая цепь 3 альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 601242 MGI: 1915661 ГомолоГен: 12021 Генные карты: MAP1LC3A
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	34,560,345 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	155,278,073 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание фосфатидилэтаноламина; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание фосфолипидов; • связывание убиквитин-протеин-лигазы; • связывание микротрубочек;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • мембрана органеллы; • цитозоль; • поздняя эндосома; • мембрана; • аутофагосома; • микротрубочки; • цитоскелет; • цитоплазматический пузырек; • эндомембранная система; • автолизосома; • мембрана аутофагосомы; • синапс;
Биологический процесс	• аутофагия; • аутофагия митохондрии; • сборка аутофагосом; • ответ на ион железа (II); • реакция на ион свинца; • реакция на уровень питательных веществ; • клеточный ответ на аминокислотное голодание; • ответ на морфин; • клеточный ответ на перекись водорода; • клеточный ответ на ион меди; • клеточный ответ на азотное голодание; • клеточный ответ на голодание; • макроавтофагия; • GO: 0000046 Созревание аутофагосомы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84557
	66734
	ENSG00000101460
	ENSMUSG00000027602
	Q9H492
	Q91VR7
	NM_032514; NM_181509
	NM_025735
	NP_115903; NP_852610
	NP_080011
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Связанные с микротрубочками белки 1A / 1B легкая цепь 3A это белок что у людей кодируется MAP1LC3A ген.^[5]^[6]^[7] Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Функция

MAP1A и MAP1B находятся микротрубочка -ассоциированные белки, которые опосредуют физические взаимодействия между микротрубочками и компонентами цитоскелет. MAP1A и MAP1B каждый состоит из субъединицы тяжелой цепи и нескольких субъединиц легкой цепи. Белок, кодируемый этим геном, является одной из субъединиц легкой цепи и может связываться либо с MAP1A, либо с MAP1B.^[7]

MAPLC3A является одним из гомологов дрожжей у млекопитающих. ATG8, важный маркер и эффектор аутофагия.^[8]

Регулирование

MAP1LC3A регулируется несколькими посттрансляционные модификации. К ним относятся ковалентное связывание C-конец к фосфатидилэтаноламин в аутофагических мембранах и фосфорилирование от протеинкиназа А,^[9] который подавляет его функции аутофагии. Нековалентные взаимодействия важны для его функций нацеливания на груз в избирательной аутофагии. Например, было показано взаимодействовать с участием секвестосома 1.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101460 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027602 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Манн СС, Хаммарбэк Дж. А. (май 1997 г.). «Локализация гена и онтогенетическая экспрессия легкой цепи 3: общая субъединица ассоциированного с микротрубочками белка 1A (MAP1A) и MAP1B». J Neurosci Res. 43 (5): 535–44. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (19960301) 43: 5 <535 :: AID-JNR3> 3.0.CO; 2-J. PMID 8833088.
^ Pankiv S, Clausen TH, Lamark T., Brech A, Bruun JA, Outzen H, Overvatn A, Bjorkoy G, Johansen T. (август 2007 г.). «p62 / SQSTM1 связывается непосредственно с Atg8 / LC3, чтобы облегчить разложение агрегатов убиквитинированного белка за счет аутофагии». J Biol Chem. 282 (33): 24131–45. Дои:10.1074 / jbc.M702824200. PMID 17580304.
^ ^а ^б «Ген Entrez: MAP1LC3A, связанный с микротрубочками белок 1 легкой цепи 3 альфа».
^ Валенте Дж., Морани Ф., Никотра Дж., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О, Арисио Р., Катсарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников». Биомед Рес Инт. 2014: 462658. Дои:10.1155/2014/462658. ЧВК 4127242. PMID 25136588.
^ Черра С.Дж., Кулич С.М., Уэчи Дж., Баласубрамани М., Маунтзурис Дж., Дэй Б.В., Чу, Коннектикут (август 2010 г.). «Регулирование белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования». J. Cell Biol. 190 (4): 533–9. Дои:10.1083 / jcb.201002108. ЧВК 2928022. PMID 20713600.
^ Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62 / SQSTM1 в аутофагосомы». J. Cell Sci. 121 (Пт 16): 2685–95. Дои:10.1242 / jcs.026005. PMID 18653543.

дальнейшее чтение

Snásel J, Pichová I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Folia Biol. (Прага). 42 (5): 227–30. Дои:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639. S2CID 7617882.
Валлин М., Дейнум Дж, Губар Л., Дэниэлсон УХ (1990). «Протеолитическое расщепление белков, связанных с микротрубочками, ретровирусными протеиназами». J. Gen. Virol. 71 (9): 1985–91. Дои:10.1099/0022-1317-71-9-1985. PMID 2212989.
Шенфельд Т.А., МакКеррахер Л., Обар Р., Валле РБ (1989). «MAP 1A и MAP 1B являются структурно родственными белками, связанными с микротрубочками, с различными паттернами развития в ЦНС». J. Neurosci. 9 (5): 1712–30. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.09-05-01712.1989. ЧВК 6569839. PMID 2470876.
Манн СС, Хаммарбак Дж. А. (1994). «Молекулярная характеристика легкой цепи 3. Субъединица связывания микротрубочек MAP1A и MAP1B». J. Biol. Chem. 269 (15): 11492–7. PMID 7908909.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Bonnet C, Boucher D, Lazereg S и др. (2001). «Дифференциальная регуляция связывания белков, связанных с микротрубочками MAP1A, MAP1B и MAP2, путем полиглутамилирования тубулина». J. Biol. Chem. 276 (16): 12839–48. Дои:10.1074 / jbc.M011380200. PMID 11278895.
Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
He H, Dang Y, Dai F и др. (2003). «Посттрансляционные модификации трех членов семейства MAP1LC3 человека и обнаружение нового типа модификации для MAP1LC3B». J. Biol. Chem. 278 (31): 29278–87. Дои:10.1074 / jbc.M303800200. PMID 12740394.
Танида И., Су Ю.С., Эзаки Дж. И др. (2004). «HsAtg4B / HsApg4B / аутофагин-1 расщепляет карбоксильные концы трех гомологов человеческого Atg8 и делипидирует связанные с микротрубочками белковые конъюгаты легкой цепи 3- и ГАМКА-рецептор-ассоциированные белок-фосфолипидные конъюгаты». J. Biol. Chem. 279 (35): 36268–76. Дои:10.1074 / jbc.M401461200. PMID 15187094.
Куно Т., Мидзугути М., Танида И. и др. (2005). «Резонансные отнесения 1H, 13C и 15N человеческой легкой цепи-3 белка, ассоциированного с микротрубочками». J. Biomol. ЯМР. 29 (3): 415–6. Дои:10.1023 / B: JNMR.0000032505.99071.ea. PMID 15213446. S2CID 23561733.
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, et al. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Мол. Ячейка. 15 (6): 853–65. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Куно Т., Мидзугути М., Танида И. и др. (2005). «Структура раствора легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками, и идентификация его функциональных субдоменов». J. Biol. Chem. 280 (26): 24610–7. Дои:10.1074 / jbc.M413565200. PMID 15857831.
Соу Ю.С., Танида И., Комацу М. и др. (2006). «Фосфатидилсерин в дополнение к фосфатидилэтаноламину является мишенью in vitro для модификаторов Atg8 млекопитающих, LC3, GABARAP и GATE-16». J. Biol. Chem. 281 (6): 3017–24. Дои:10.1074 / jbc.M505888200. PMID 16303767.
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101460 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027602 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8833088-5] Манн СС, Хаммарбэк Дж. А. (май 1997 г.). «Локализация гена и онтогенетическая экспрессия легкой цепи 3: общая субъединица ассоциированного с микротрубочками белка 1A (MAP1A) и MAP1B». J Neurosci Res. 43 (5): 535–44. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (19960301) 43: 5 <535 :: AID-JNR3> 3.0.CO; 2-J. PMID 8833088.

[pmid17580304-6] Pankiv S, Clausen TH, Lamark T., Brech A, Bruun JA, Outzen H, Overvatn A, Bjorkoy G, Johansen T. (август 2007 г.). «p62 / SQSTM1 связывается непосредственно с Atg8 / LC3, чтобы облегчить разложение агрегатов убиквитинированного белка за счет аутофагии». J Biol Chem. 282 (33): 24131–45. Дои:10.1074 / jbc.M702824200. PMID 17580304.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: MAP1LC3A, связанный с микротрубочками белок 1 легкой цепи 3 альфа».

[8] Валенте Дж., Морани Ф., Никотра Дж., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О, Арисио Р., Катсарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников». Биомед Рес Инт. 2014: 462658. Дои:10.1155/2014/462658. ЧВК 4127242. PMID 25136588.

[pmid20713600-9] Черра С.Дж., Кулич С.М., Уэчи Дж., Баласубрамани М., Маунтзурис Дж., Дэй Б.В., Чу, Коннектикут (август 2010 г.). «Регулирование белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования». J. Cell Biol. 190 (4): 533–9. Дои:10.1083 / jcb.201002108. ЧВК 2928022. PMID 20713600.

[pmid18653543-10] Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62 / SQSTM1 в аутофагосомы». J. Cell Sci. 121 (Пт 16): 2685–95. Дои:10.1242 / jcs.026005. PMID 18653543.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]