NEK9 - Википедия - NEK9

NEK9
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNEK9, NERCC, NERCC1, Nek8, киназа 9, родственная NIMA, APUG, LCCS10, NC
Внешние идентификаторыOMIM: 609798 MGI: 2387995 ГомолоГен: 13222 Генные карты: NEK9
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение NEK9
Геномное расположение NEK9
Группа14q24.3Начинать75,079,353 бп[1]
Конец75,127,344 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NEK9 214738 s на fs.png

PBB GE NEK9 212299 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_033116
NM_001329237
NM_001329238

NM_145138

RefSeq (белок)

NP_001316166
NP_001316167
NP_149107

NP_660120

Расположение (UCSC)Chr 14: 75.08 - 75.13 МбChr 12: 85,3 - 85,34 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинкиназа Nek9 является фермент что у людей кодируется NEK9 ген.[5][6]

Взаимодействия

NEK9 был показан взаимодействовать с:

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции NEK9. Условный нокаутирующая мышь линия называется Нек9tm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[12] для определения последствий удаления.[13][14][15][16] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119638 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034290 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Holland PM, Milne A, Garka K, Johnson RS, Willis C, Sims JE, Rauch CT, Bird TA, Virca GD (май 2002 г.). «Очистка, клонирование и характеристика Nek8, новой киназы, связанной с NIMA, и ее кандидата в субстрат Bicd2». Журнал биологической химии. 277 (18): 16229–40. Дои:10.1074 / jbc.M108662200. PMID  11864968.
  6. ^ «Ген Entrez: NEK9 NIMA (никогда в митозе ген а) - родственная киназа 9».
  7. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
  8. ^ Belham C, Roig J, Caldwell JA, Aoyama Y, Kemp BE, Comb M, Avruch J (сентябрь 2003 г.). «Митотический каскад киназ семейства NIMA. Nercc1 / Nek9 активирует киназы Nek6 и Nek7». Журнал биологической химии. 278 (37): 34897–909. Дои:10.1074 / jbc.M303663200. PMID  12840024.
  9. ^ а б Ройг Дж., Михайлов А., Белхам С., Авруч Дж. (Июль 2002 г.). «Nercc1, киназа семейства NIMA млекопитающих, связывает Ran GTPase и регулирует митотическую прогрессию». Гены и развитие. 16 (13): 1640–58. Дои:10.1101 / gad.972202. ЧВК  186374. PMID  12101123.
  10. ^ Тан BC, Ли SC (март 2004 г.). «Nek9, новый белок, ассоциированный с FACT, модулирует межфазную прогрессию». Журнал биологической химии. 279 (10): 9321–30. Дои:10.1074 / jbc.M311477200. PMID  14660563.
  11. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  12. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  16. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс Н. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Ячейка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  17. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение