Дипептидаза D-Ala-D-Ala - Википедия - D-Ala-D-Ala dipeptidase

D-Ala-D-Ala дипептидаза
Идентификаторы
Номер ЕС3.4.13.22
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

D-Ala-D-Ala дипептидаза (EC 3.4.13.22, D-аланил-D-аланин дипептидаза, дипептидаза vanX D-Ala-D-Ala, VanX) является фермент.[1][2][3][4][5][6] Этот фермент катализирует следующее химическая реакция

D-Ala-D-Ala + H2O 2 Д-Ала

Этот фермент - Zn2+-зависимый.

Рекомендации

  1. ^ Reynolds PE, Depardieu F, Dutka-Malen S, Arthur M, Courvalin P (сентябрь 1994 г.). «Устойчивость к гликопептидам, опосредованная энтерококковым транспозоном Tn1546, требует продукции VanX для гидролиза D-аланил-D-аланина». Молекулярная микробиология. 13 (6): 1065–70. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00497.x. PMID  7854121.
  2. ^ Wu Z, Wright GD, Walsh CT (февраль 1995 г.). «Сверхэкспрессия, очистка и характеристика VanX, D-, D-дипептидазы, которая необходима для устойчивости к ванкомицину у Enterococcus faecium BM4147». Биохимия. 34 (8): 2455–63. Дои:10.1021 / bi00008a008. PMID  7873524.
  3. ^ McCafferty DG, Lessard IA, Walsh CT (август 1997). «Мутационный анализ потенциальных цинк-связывающих остатков в активном центре энтерококковой D-Ala-D-Ala дипептидазы VanX». Биохимия. 36 (34): 10498–505. Дои:10.1021 / bi970543u. PMID  9265630.
  4. ^ Bussiere DE, Pratt SD, Katz L, Severin JM, Holzman T., Park CH (июль 1998 г.). «Структура VanX показывает новую амино-дипептидазу, участвующую в опосредовании резистентности к ванкомицину на основе транспозонов». Молекулярная клетка. 2 (1): 75–84. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80115-х. PMID  9702193.
  5. ^ Тан А.Л., Локе П., Сим Т.С. (2002). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика VanX, D-аланил-D-аланин дипептидазы из Streptomyces coelicolor A3 (2)». Исследования в области микробиологии. 153 (1): 27–32. Дои:10.1016 / s0923-2508 (01) 01282-7. PMID  11881895.
  6. ^ Мэтьюз М.Л., Перияннан Дж., Хайдин С., Сиджел Т.К., Беннетт Б., Краудер М.В. (октябрь 2006 г.). «Исследование механизма реакции D-ala-D-ala дипептидазы, VanX, с помощью исследований ЭПР с остановленным потоком кинетики и быстрого замораживания с гашением на Co (II) -замещенном ферменте». Журнал Американского химического общества. 128 (40): 13050–1. Дои:10.1021 / ja0627343. ЧВК  2547881. PMID  17017774.

внешняя ссылка